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Lynn Bry
文章数:12篇
复发性艰难梭菌感染
用肠道代谢物预测艰难梭菌感染复发
艰难梭菌感染(CDI)患者中,有一小部分在抗生素治疗后会复发。Microbiome近期发表研究,对53名CDI患者进行了前瞻性的多时间点采样,揭示了与CDI复发相关的肠道菌群和肠道代谢组特征,表明治疗后的特定肠道代谢物(而非肠道菌群)数据可用于预测后续的复发风险。
复发性艰难梭菌感染
肠道菌群
肠道代谢组
预测模型
艰难梭菌
Cell子刊:用于艰难梭菌系统分析的调控和代谢网络预测模型
艰难梭菌(Cd)是医院内感染的首要病原体,可引起伪膜性结肠炎。Cell Host and Microbe发表的这项研究,报道了可用于解析Cd与宿主互作的Cd基因调控和代谢网络的3个预测模型,研究者建立了一个网站((http://networks.systemsbiology.net/cdiff-portal/),为Cd研究者提供研究模型、数据集和算法工具。
艰难梭菌
宿主-致病菌互作
细菌间互作
Cell子刊:共生菌塑造肠道环境,影响致病菌感染
肠道共生菌与致病菌间存在复杂的互作关系,Cell Host and Microbe发表的这项研究,采用多组学的系统生物学方法,在艰难梭菌感染小鼠模型中,探索了不同的梭菌属细菌( Paraclostridium bifermentans 和 Clostridium sardiniense )如何调控致病菌定植、生长和毒力从而影响宿主生存。这些发现为研发抗艰难梭菌的细菌疗法带来启示。
细菌间互作
艰难梭菌感染
肠道菌群
Treg
Cell子刊:菌群和基因剂量调控Treg产生TGF-β1,抑制过敏及自身免疫反应
Treg如何对过敏及自身免疫反应进行差异化调控尚未明确。来自Immunity上发表的一项最新研究,发现Treg产生的TGF-β1可通过调节肥大细胞及IgE应答以限制过敏及自身免疫反应,单等位基因敲除Treg中的TGF-β1可诱导ROR-γt+ Treg的分化异常以增强过敏反应,而双等位基因敲除可诱导小鼠的致死性自身免疫反应。该研究结果提示,Treg产生的TGF-β1可通过基因剂量效应及菌群依赖性方式,在不同的检查点调控过敏及自身免疫反应。
Treg
TGF-β
regulatory T cells
Allergy
Autoimmunity
菌群-免疫互作
肠道菌群影响生命早期胸腺淋巴细胞的发育
来自PNAS上发表的一项最新研究,报道了一种肠道菌群在生命早期对免疫系统发育的调节机制:脆弱拟杆菌的多糖A通过TLR2信号促进胸腺中PLZF+淋巴细胞的稳态,同时,菌群介导浆细胞样树突状细胞从结肠迁移至胸腺以维持PLZF+淋巴细胞的稳态。
菌群-免疫互作
early-life immunity
mucosal immunity
thymic lymphocyte development
菌群-免疫互作
食物过敏
Nature子刊:菌群疗法诱导特定T细胞,或是治疗食物过敏新策略
食物过敏(FA)与肠道菌群失调相关,《Nature Medicine》上线的一项最新研究,对FA婴儿的肠道菌群特征进行了纵向分析,鉴定出菌群失调和肠道免疫异常的特征,在小鼠中验证了FA菌群的致病性,通过细菌疗法有效抑制了小鼠FA,并揭示出背后的生物学机制,表明ROR-γt+ Treg细胞在改善FA中具有关键作用,这些发现为深入理解肠道菌群在FA中的作用,以及开发菌群靶向疗法来治疗FA,有重要意义。
食物过敏
Allergy
Applied microbiology
Dysbiosis
immune tolerance
噬菌体
Cell子刊:噬菌体对肠道菌群和代谢组的影响不容小觑
噬菌体如何在体内影响菌群?《Cell Host and Microbe》发表的一项最新研究,使用限菌小鼠模型,揭示出噬菌体对其靶细菌的直接影响,可对菌群造成级联效应,波及其它菌群成员,导致肠道代谢组改变,从而可对宿主产生影响,这些发现对于研究靶向肠道菌群的噬菌体疗法,很有参考意义。
噬菌体
Bacteriophage
virus
gut microbiome
microbiota
代谢调控
改变肠道共生菌的胆盐水解酶,可影响宿主代谢
菌群功能影响宿主代谢,但由于菌群基因和功能的复杂性,如何解析单个基因/功能对宿主的影响,是关键问题。eLife上一项来自哈佛医学院的最新研究,提供了一个值得参考的例子。通过细菌培养、细菌基因敲除、在无菌小鼠中进行单菌株定殖等方法,该研究揭示了共生菌的特定胆盐水解酶对宿主代谢的影响。
代谢调控
胆盐水解酶
肠道共生菌
多形拟杆菌
biochemistry
饮食
CR:饮食、遗传和肠道菌群,共同影响血浆代谢物水平
不同遗传背景的小鼠,肥胖及糖尿病风险存在差异,这种差异与肠道菌群相关。饮食、遗传因素、肠道菌群通过共同影响代谢产物的水平而影响疾病风险。
饮食
遗传因素
代谢产物
胰岛素抵抗
Jessica N Witchley
抗生素
JCI:宿主遗传背景和炎症潜力决定抗生素的作用
抗生素要发挥作用,宿主的遗传背景和炎症潜力很重要,具体都有怎样的关联,推荐看看这篇文章。
抗生素
肠道菌群
胆汁酸
炎症信号
胰岛素抵抗
多发性硬化
NC:多发性硬化患者的肠道菌群有什么改变?
两篇多发性硬化患者肠道菌群的文章,IF相差一半,差距在哪里?[呲牙] 发Scientific Reports的团队会不会感觉有点小郁闷?
多发性硬化
肠道菌群
Q Zhang
Kai-Yong Liu
粪便miRNA
Cell子刊:miRNA,塑造菌群!
① 粪便miRNA介导种间基因调控,促进宿主控制肠道菌群;② miRNA在人和小鼠粪便样本中含量丰富,存在于细胞外小泡;③ 肠上皮细胞(IEC)和Hopx阳性细胞是粪便miRNA的主要来源;④ 粪便miRNAs可以进入细菌,如F. nucleatum和大肠杆菌,特异性调节细菌基因转录,影响细菌生长;⑤ IEC特异性缺失miRNA的小鼠表现出不受控制的肠道菌群,且结肠炎加剧,而WT小鼠的粪便miRNA移植则可恢复粪便微生物,改善结肠炎。
粪便miRNA
肠道菌群