Shuai Cheng Li

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文章数：3篇

中枢性性早熟

国内团队：肠道菌群参与中枢性性早熟的潜在机制

四川大学华西医院沈百荣团队与香港城市大学李帅成团队合作，在Clinical and Translational Medicine发表研究，通过分析对比中枢性性早熟（CPP）、超重和健康女孩的肠道菌群，鉴定出多个CPP相关细菌，表明细菌合成的神经递质或在CPP中有重要作用，并阐明了CPP和超重女孩肠道菌群的共同特征，提示靶向肠道菌群或能用于CPP治疗。

中枢性性早熟肠-脑轴肠道菌群肥胖

宏基因组装配

国内团队：通过linked-read测序对宏基因组组装进行全面研究

目前的宏基因组学实践使用短读长测序来同时对微生物基因组混合物进行测序。但是，这些结果在基因组组装过程中含糊不清，导致微生物基因组完整性和重叠群连续性无法令人满意。而通过将相同的条形码与较长的DNA片段（10-100 kb）的读长连接在一起，Linked-read测序能够消除其中的一些歧义，从而改善了宏基因组的装配。香港浸会大学张璐和香港城市大学李帅成与团队在Microbiome发表文章，全面研究了linked-read测序参数对宏基因组装配的影响。虽然linked-reads测序的基因组组装质量无法与PacBio CCS long-reads的匹敌，但由于linked-reads测序的低成本和高碱基质量，使用它的理由仍然很有说服力。本研究表明，使用linked-reads进行宏基因组组装的最佳实践是合并来自多个文库的linked-reads，其中每个文库具有足够的每个片段读取深度，且更少量的输入DNA。

宏基因组装配短读长 PacBio CCS长读长参数空间 linked-read

菌群恢复力

世纪坛医院+中科院计算所+华中科大：长期出国的人，菌群如何变化？

研究表明，短期的饮食变化可改变健康人或疾病患者的肠道菌群组成。来自世纪坛医院、中科院计算所及华中科大的团队在Gut上发表的一项最新研究，对10名在国外生活了6个月的北京健康志愿者的肠道菌群进行了追踪分析，发现肠道菌群表现出了很强的可塑性和恢复性：在国外时，菌群组成趋向于当地的模式，而回国后，菌群又可很快恢复。

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