肠道菌群

结直肠癌抗肿瘤免疫肠道菌群肿瘤微环境滤泡辅助性T细胞

己糖激酶（HK）催化糖酵解的第一步，限制其速度。其中HK2是主要的HK异构体，在肠上皮细胞中高度表达，促进免疫反应，并在炎症期间被上调。Cell Metabolism发表的一项最新研究揭示了肠上皮HK2以及菌群对其的调节在肠道稳态调控中的作用。该研究发现，敲除肠上皮细胞中的HK2能通过抑制细胞死亡和改变线粒体功能来抑制小鼠结肠炎。此外，肠道菌群代谢物丁酸可以通过下调HK2，发挥对结肠炎的保护作用。该研究提供了丁酸调节肠道稳态的一种机制，并表明HK2可作为治疗炎症性肠病等炎症疾病的新靶点。

肠道炎症免疫代谢肠上皮己糖激酶丁酸

微生物结构变异

傅静远等Cell子刊：从微生物遗传组成的维度，解析人肠道菌群与胆汁酸代谢的关系

荷兰格罗宁根大学医学中心傅静远教授及团队在Cell Host & Microbe发表文章，整合了荷兰LifeLines-DEEP（LLD）和300-Obesity（300-OB）两个人群队列共计1437名受试者的肠道微生物宏基因组、胆汁酸代谢谱以及多维度表型数据，以微生物基因组结构变异（SV）为切入点，系统探究了肠道微生物遗传组成与胆汁酸代谢的关联。有趣的是，肠道微生物遗传组成关联和相对丰度关联之间的重叠较少，表明SV作为一个新的数据维度，可以提供菌群组成无法反映的额外信息，值得深入挖掘。

微生物结构变异胆汁酸代谢研究论文 human gut microbiome bile acid metabolism

二甲双胍

二甲双胍或通过改变肠道菌群干预妊娠期糖尿病

孕期使用二甲双胍来治疗妊娠期糖尿病已有一定的共识，而越来越多的研究证据表明肠道菌群在糖尿病的发生发展过程中扮演重要的角色。本研究旨在探索二甲双胍在治疗妊娠期糖尿病过程中是否改变了肠道菌群的结构，从而论证肠道菌群在其中可能发挥的中介作用。

二甲双胍研究论文孕妇妊娠期糖尿病胰岛素

菌群-肠-脑

江南大学Nature子刊：肠道菌群影响熊蜂的记忆

江南大学的赵伟团队在Nature Communications发表的一项最新研究中，以熊蜂为模型，探究了个体的认知差异是否可能源于菌群-肠-脑的相互作用，结果表明，熊蜂共生菌Firm-5乳杆菌（L. apis）的增加，与熊蜂长期记忆的改善之间，存在因果关系。

菌群-肠-脑熊蜂肠道菌群长期记忆

菌群-药物互作

Nature：阿卡波糖降糖不理想？有菌群酶让药失活

阿卡波糖源自土壤细菌，能通过抑制α-葡糖苷酶来减少生物体对复杂碳水化合物的代谢。这一作用机制使得阿卡波糖被开发为抗糖尿病药，能改善患者的餐后血糖。但阿卡波糖也会抑制细菌的α-葡糖苷酶，从而对人体菌群造成影响。那么人类微生物组中是否也存在抵抗阿卡波糖的机制呢？为了解答这一问题，美国普林斯顿大学Mohamed S. Donia作为通讯作者，与罗格斯大学、上海交通大学的赵立平团队合作，通过宏基因组学、生化和结构生物学方法，找到了在人体菌群中广泛存在的能让阿卡波糖失活的细菌酶（Maks），并通过分析已发表的临床试验数据（https://www.mr-gut.cn/papers/read/1088753988），初步证实了这类酶可能是削弱阿卡波糖对糖尿病治疗效果的“罪魁祸首”。该研究还进一步找到了能生成阿卡波糖样分子的人类口腔细菌，提示Maks可能是人体菌群抵抗这种内源性阿卡波糖的适应性策略。总之，该研究为菌群-药物互作提供了又一个范式，或能在临床上指导糖尿病患者用药。相关成果已在Nature发表，值得专业人士关注。

菌群-药物互作阿卡波糖细菌酶 2型糖尿病口腔菌群

婴儿食物过敏

婴儿食物过敏研究论文肠道菌群双歧杆菌 IgE-mediated

早发性结直肠癌

国内团队：早发性大肠癌患者的肠道菌群特征

早发性结直肠癌（yCRC，<50岁）的发病率正在快速增加，且其侵袭性更强，但目前关于yCRC的肠道菌群及其诊断价值尚缺乏深入研究。Nature Communications最新发表了复旦大学附属肿瘤医院马延磊团队的研究，重点分析了yCRC的肠道菌群组成和功能改变，揭示了其与晚发性CRC（oCRC，≥50岁）的差异，并基于粪便菌群标志物开发了诊断模型，或能用于yCRC的检测。

早发性结直肠癌肠道菌群医学研究诊断模型

菌群传递

郑浩、胡小松等：遗传因素塑造蜜蜂肠道菌群

蜜蜂肠道菌群是由一组简单、特异的核心细菌构成，主要通过蜜蜂间的社会互动在同蜂巢（姐妹）成员间传播。这个核心菌群在不同蜜蜂个体之间呈现高度的菌株水平多样性，这种菌群的个体差异与多种因素相关，蜜蜂的遗传因素可能在其中有重要作用。中国农业大学郑浩作为通讯作者，近期在Microbiome发表研究，通过宏基因组测序，对不同蜜蜂亚种以及通过人工授精构建的杂交蜂的基因组和微生物组联合分析，发现在菌群的社会传播过程中，宿主基因型可明显影响核心菌的丰度以及菌株水平的构成。此外，与宿主基因型有关的特定双歧杆菌还参与了蜜蜂的“肠脑轴”调控。这些发现揭示了宿主基因型参与塑造蜜蜂肠道菌群菌株水平组成的重要作用，并表明遗传因素可通过调节肠道菌群对蜜蜂的大脑生理和健康带来间接影响。我们特别对该研究通讯作者郑浩教授进行了专访（见“延伸阅读”），以飨读者。

菌群传递蜜蜂遗传-菌群互作肠-脑轴肠道菌群

青春双歧杆菌

浙大团队Nature子刊：青春双歧杆菌或助“青春常驻”

肠道菌群与宿主衰老有密切联系，但是哪些细菌可能影响宿主的衰老和寿命及其背后的机制，尚待研究揭示。Nature Aging最新发表了浙江大学医学院王良静、康利军、姒健敏与团队的研究成果，揭示了青春双歧杆菌潜在的抗衰老作用。该研究表明，膳食补充青春双歧杆菌可能通过上调宿主的过氧化氢酶的活性，延长多种动物模型的健康寿命和寿命。

青春双歧杆菌衰老与长寿小鼠果蝇线虫

噬菌体

段屹等Nature Reviews：用噬菌体治疗消化道疾病（一图读懂）

除了肠道中的细菌、真菌，以噬菌体为主的肠道病毒组也与人体健康密切相关。近期研究表明，噬菌体在治疗胃肠道疾病方面有很大潜力。Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology最新发表了由加州大学圣迭戈分校的段屹主笔的综述观点文章，总结了噬菌体在维持人类健康和疾病发病机制中的作用、基于噬菌体的治疗方法（包括直接使用噬菌体来治疗肠道疾病）、靶向特定细菌来操纵肠道菌群等方面的研究进展，并对噬菌体临床应用的挑战和未来研究方向进行了展望，值得专业人士关注！我们特别将其中的配图编译为一图读懂，希望能助你长知识。

噬菌体噬菌体疗法胃肠病肝病肠道菌群

NAFLD/NASH

GLP-1/GLP-2受体双激动剂或可靶向肠肝轴和菌群，治疗脂肪肝炎

Hepatology近期发表的文章，基于肠-肝轴在非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）/非酒精性脂肪性肝炎（NASH）中的重要作用，开发出靶向GLP1和GLP2受体双激动剂，检测其对NASH的治疗效果。GLP1/2Fc联合治疗对代谢表型、肝脏炎症、纤维化和肠道完整性有协同作用，还有调节肠道微生物群的潜力，是NAFLD/NASH较为有前景的治疗策略。

NAFLD/NASH GLP-1/GLP-2受体双激动剂肝-肠轴肠道菌群

肠道-肌肉轴

干酪乳杆菌代田株改善小鼠的衰老相关肌少症

肠道-肌肉轴肌少症衰老益生菌干酪乳杆菌代田株

雷公藤甲素

国内团队：调节肠道菌群可治疗睾丸功能障碍

不孕不育是人类面对的一个重要的健康问题，其中男性不育占比50%。此外男性生育能力问题还会导致新生儿畸形或缺陷，因此受到广泛的关注。精子质量下降是随着工业化发展而出现的问题，除遗传因素外，环境毒性物质以及临床激素以及化疗类的药物暴露都会影响到精子的质量。雷公藤甲素（TP）临床上广泛用于抗肿瘤以及免疫治疗的药物，而其主要的副作用是导致的睾丸功能障碍。严重的睾丸毒性显著限制了TP在临床中的长期使用，但是目前对于其对睾丸的毒理机制尚不清楚。近期，四川大学华西医院、中科院昆明植物所的李飞团队在Microbiome上发表了他们对于TP睾丸毒性的最新研究成果。研究显示TP导致小鼠肠道菌群的变化，从而影响了肠道菌群所参与的多胺代谢过程，使得睾丸损伤以及精子数量减少。而补充多胺或者移植产精胺菌可缓解TP的副作用。这些研究成果揭示了多胺代谢、肠道菌群变化以及睾丸功能损伤之间的关系，为采用肠道微生物群监测和干预作为预防男性不育的一种治疗选择提供了理论基础。

雷公藤甲素睾丸功能损伤多胺代谢肠道菌群精胺

自闭症

Cell：“偏食”介导了自闭症与肠道菌群的关联

肠道菌群与自闭症之间有怎样的关系？二者间的关系是直接的，还是间接的？是否存在其他混杂因素？Cell最新发表的一项来自澳大利亚的大型自闭症粪便宏基因组学研究，通过分析247名儿童的粪便菌群和多维度的临床/表型指标，发现自闭症与肠道微生物组（组成、基因、功能通路）的直接关联极其有限。相反，粪便菌群与饮食特征、粪便稠度和年龄有密切关系。这些数据支持一个模型，即自闭症的遗传和表型特征促进了患儿“偏食”，而饮食多样性的降低反过来减少了菌群的多样性，因而自闭症患儿的菌群可能只是反映了疾病引起的饮食变化。该研究再次提示，在研究菌群与疾病的因果关联时，要考虑其中可能存在的混杂因素（如饮食），而菌群是否是自闭症的一个主要驱动因素，还需更加审慎的研究来评估。

自闭症肠道菌群饮食脑-肠-菌群轴

膳食乳化剂

乳化剂吃太多，伤肠、伤菌、伤代谢

流行病学和小鼠研究表明，膳食乳化剂会促进与肠道菌群失调相关的疾病。虽然这些化合物对肠道菌群和肠道健康的不利影响已在动物和体外模型中得到证实，但这些食品添加剂对健康人类的影响仍未得到充分验证。Gastroenterology发表的一项随机对照喂养试验表明，大量摄入常见膳食乳化剂羧甲基纤维素（CMC），可对健康成年人的肠道菌群、代谢组和肠屏障造成危害。因此，加工食品中广泛使用的CMC可能通过改变肠道菌群和代谢组，增加一系列慢性炎症疾病的风险。

膳食乳化剂饮食-菌群互作肠道菌群代谢组随机双盲对照试验

肠-脑轴

谢鹏+魏泓：菌群相关抑郁症中的肠-脑轴蛋白质组学分析

肠道菌群可能通过肠-脑轴影响抑郁症的发生发展。重庆医科大学谢鹏团队和第三军医大学魏泓团队合作，近期在Translational Psychiatry发表研究，在移植了抑郁症患者肠道菌群的小鼠模型中，揭示了肠道菌群失调相关的肠-脑轴蛋白质表达和功能的改变，为进一步理解菌群在抑郁症中的作用带来了新启示。

肠-脑轴肠道菌群抑郁小鼠蛋白质组学

肠易激综合征

方晓东+卞兆祥+李帅成：IBS患者的代谢组和菌群变化

ISME Journal近期发表了广州中医药大学方晓东、香港浸会大学卞兆祥、香港城市大学李帅成作为共同通讯作者的研究，通过对两个队列共400余人的粪便和血清样本进行分析，揭示了肠易激综合征（IBS）患者中的血清/粪便代谢组的改变及其与肠道微生物组的关系。该研究强调了IBS中的血清代谢物变化或能用于临床诊断，提示代谢失调或参与了IBS的发病机理，并为理解IBS抑郁症的合并症提供了新的线索。

肠易激综合征抑郁肠道菌群粪便代谢组血清代谢组

菌群传递

郑浩+翟一凡：在菌株水平揭示熊蜂肠道菌群的社会性传递规律

熊蜂是一种重要的授粉昆虫，在自然生态和农业生产中具有重要作用。熊蜂与蜜蜂都是社会性昆虫，都有相似的肠道菌组成，但两种蜂群的生命周期很不一样。熊蜂蜂巢多为一年生，且由单个蜂王建立，其肠道菌群的发育和传播规律尚待深入解析。中国农业大学郑浩和山东省农科院翟一凡作为共同通讯作者，近期在Microbiome发表研究，通过宏基因组学分析，在菌株层面阐明了熊蜂的肠道菌群的垂直传递模式，揭示了社会性差异对熊蜂和蜜蜂肠道菌群的影响。并构建了蜂类肠道菌基因组数据库，可用于未来进一步研究。该研究也表明，熊蜂也可作为新型模式生物，用于研究肠道菌群传递及其与宿主的互作机制等问题。我们特别对该研究的共同通讯作者郑浩教授进行了专访（见“延伸阅读”），以飨读者。

菌群传递熊蜂肠道菌群垂直传递菌株水平

系统性红斑狼疮（SLE）

TCR信号异常+肠道菌群紊乱=系统性自身免疫疾病

T细胞受体（TCR）信号异常和肠道失调被认为与系统性红斑狼疮（SLE）的发生有关，但这些致病机制是否相互关联仍不清楚。Arthritis and Rheumatology近期发表的文章，发现TCR信号的缺乏改变肠道菌群，并通过驱动Th17细胞的分化促进系统性自身免疫疾病的发生。

系统性红斑狼疮（SLE） TCR信号肠道菌群

高尿酸血症

国内团队：肠道菌群失调与血清尿酸升高有关

近期中南大学湘雅医院雷光华和曾超作为共同通讯在Arthritis and Rheumatology发表了一项研究成果，在对中国农村居民进行的一项研究（称为“发现队列”）中，发现肠道菌群失调与血清尿酸水平升高有关，这在另一项针对中国城市居民的研究（称为“验证队列”）中得到验证，研究结果提示肠道微生态失调可能参与调节血清尿酸水平。

高尿酸血症肠道菌群

益生菌涂层

刘尽尧团队：益生菌+聚多巴胺纳米涂层，有效改善小鼠结肠炎

对于炎症性肠病等自身免疫病，抑制过度活化的免疫反应是关键，但现有的免疫抑制剂存在局限性，包括抑制效率低和有潜在的脱靶毒性。上海交通大学医学院刘尽尧团队近期在Advanced Science发表研究，合成了一种聚多巴胺纳米免疫抑制剂，并将其作为益生菌涂层，通过抑制局部组织的过度免疫反应和调节肠道菌群的机制，有效改善了小鼠结肠炎，具有转化应用前景。

益生菌涂层肠道菌群多巴胺能免疫调节炎症性肠病

子宫内膜异位症

子宫内膜异位症，肠道/阴道菌群或有作用（综述）

本综述总结了目前在子宫内膜异位症的研究中，有关肠道菌群和阴道菌群的关联研究，无论是子宫内膜异位症的病因、诊断和预后，人体微生物组可能均发挥着重要的作用。本研究值得相关领域的专家参考借鉴。

子宫内膜异位症综述不孕症慢性盆腔疼痛肠道菌群

益生菌

嗜酸乳杆菌+鼠李糖乳杆菌，可减少幽门螺杆菌载量

Helicobacter发表的一项双盲随机对照试验，评估了益生菌（嗜酸乳杆菌和鼠李糖乳杆菌）在减少幽门螺杆菌的细菌载量和改变肠道菌群方面的功效。

益生菌幽门螺杆菌感染随机对照试验肠道菌群

乳腺癌

肠道菌群或能用于乳腺癌诊断

亚洲乳腺癌有年轻化趋势，而绝经前乳腺癌患者肠道菌群研究较少。Experimental and Molecular Medicine发表的一项研究，通过分析不同绝经状态的乳腺癌和匹配的对照女性的肠道菌群，鉴定出或能用于乳腺癌诊断的肠菌标志物。

乳腺癌肠道菌群

抗生素

肠道菌群对抗生素的个体化反应

抗生素对菌群的扰动程度因人而异。有假说认为，这种个体化的反应与治疗前的菌群组成有密切关系。然而，这一假说还需要更多人体研究数据的支持。Microbiome近期发表的一项研究，在一个小型的临床队列中进行了分析，表明治疗前菌群中的特定细菌类群可预测抗生素对菌群的扰动程度。因此，针对治疗前菌群的精确干预，或能减少抗生素引起的菌群失调及其不良影响。

抗生素肠道菌群个体化干预

康普茶

康普茶对肥胖相关合并症及肠道菌群的影响（综述）

康普茶是由茶、糖、菌种和水4种主要元素混合发酵而成的饮料，近期发表于Critical Reviews in Food Science and Nutrition的一篇系统综述，根据目前的体内实验结果评估了康普茶摄入对肥胖相关合并症及肠道微生物群的影响。友情提醒，本文只是动物体内实验还需更多临床试验证据，此外康普茶的ph较低，可能对牙齿有不良影响。

康普茶发酵食品肥胖肠道菌群

肠神经系统

破坏肠道菌群，肠神经系统也受累？

肠道菌群与肠神经系统的互作，一定程度上介导了菌群对肠道生理的调控。Microbiome发表的一项最新研究，以抗生素处理的小鼠为模型，研究了肠道菌群的耗竭和自发恢复对肠道生理和肠神经系统的影响，表明肠道菌群可通过其产生的脂多糖（LPS）和短链脂肪酸（SCFA）等物质，来增强肠神经元存活和促进神经生成，从而维持肠神经系统的完整性。

肠神经系统小鼠抗生素肠道菌群

生物钟

人类生物钟类型相关的肠道菌群特征

FASEB Journal发表的研究，评估了不同的生物钟类型（早起型-云雀型，晚睡型-猫头鹰型）是否与不同的肠道微生物组成相关。利用宏基因组测序分析，建立了一个与生物钟类型相关的独特菌群标记，同时还确定了与云雀型生物钟相关的三种代谢途径，并将不同的饮食模式与不同时型联系起来。本研究结果提示，肠道微生物组和生物钟类型之间的存在联系，在未来或可用于指导饮食干预。

生物钟肠道菌群

肠道菌群

热量限制引发小肠胆汁酸、牛磺酸和谷胱甘肽改变，菌群有“责”

团队前期实验结果显示，CR可以刺激小肠内牛磺酸、牛磺酸结合型胆汁酸以及其他结合体的增加，降低谷胱甘肽水平。本研究主要探究这种改变是否与肠道菌群有关。研究分别采用了抗生素和粪菌移植的方式进行研究，发现上述改变与肠道菌群密切相关。

肠道菌群胆汁酸牛磺酸