Clinical microbiology

搜索
登录

Clinical microbiology

文章数：10篇

刘洋彧等：理解粪菌移植的生态学原理，辅助个体化益生菌设计

人肠道菌群是一个非常复杂的生态系统，但是我们对于其中的生态学原理还所知有限，这是研究菌群干预方法道路上的一大障碍。《Nature Communications》最新了发表来自哈佛大学医学院刘洋彧团队的研究，他们提出了一个可用于理解粪菌移植（FMT）治疗艰难梭菌感染的生态学原理的理论框架，并在此基础上开发了一种算法，能用于设计清除致病菌定植的个体化混合益生菌配方。这项研究对于加深人们对FMT生态学原理的认知，以及未来设计开发基于菌群的干预疗法，具有指导意义。

粪菌移植微生物生态学 Clinical microbiology Ecological modelling Ecological networks

肠道菌群失调

Nature：他汀类药物或能帮助改善肥胖者的肠道菌群健康

此前研究表明，人的肠道菌群或能根据优势细菌的种类，划分为4种肠型。其中Bact2肠型以拟杆菌属占比高、粪杆菌属占比低、微生物密度较低为特征，与系统性炎症和便溏（稀便）存在关联，是潜在的菌群失调肠型。Nature发表的一项最新研究，对欧洲BMIS队列参与者进行了横断面相关性分析，发现Bact2肠型在肥胖人群中明显更加普遍，但在服用他汀类药物（降胆固醇药）的肥胖者中，这一比例从17.7%降到了5.9%。未来需开展随机对照试验，来检验他汀类药物对菌群的组成和健康是否具有调控作用。

肠道菌群失调 Clinical microbiology Metabolic syndrome metagenomics Microbiome

广泛耐药（XDR）

Nature Reviews：临床开发抗菌药的现状和方向（综述）

此文综述了临床开发中的抗菌剂，并确认了这些新型抗菌剂的范围有限，尤其是针对革兰氏阴性关键优先病原体。特别是，所有正在开发的针对关键优先病原体的药剂都表现出某种程度的预先存在的交叉耐药性。研发新的抗菌药物，尤其是针对世卫组织关键优先病原体的抗菌药物的需求仍然很旺盛。为了提供针对最强耐药性病原体的药物并为未来不可预测的耐药性挑战做准备，应将精力集中在没有预先存在交叉耐药性的创新和抗菌剂上（即针对新类别或新靶标）。新抗生素的发现需要长时间的持续投入，需要大量的资源来解决新型抗菌剂的众多挑战，还需要集体努力来扩大科学基础。

广泛耐药（XDR）泛耐药（PDR）抗菌剂革兰氏阴性菌交叉抗性

药敏检测方法

Nature Reviews：新型快速的微生物药敏检测系统（综述）

快速检测致病菌的抗生素耐药性，有助于对耐药菌感染进行针对性的治疗，在临床实践上有重要意义。Nature Reviews Microbiology近期发表的综述文章，详细介绍了当前的药敏检测系统（AST）研发进展和临床转化情况，推荐专业人士参考学习。

药敏检测方法 Antibacterial drug resistance Antimicrobials BACTERIAL INFECTION Clinical microbiology

婴儿肠道菌群

Nature：剖腹产对新生儿肠道菌群的不良影响

婴儿出生后，会迅速定植来自母亲和环境中的微生物。此前对生命早期肠道菌群的研究大多受限于16S分析的分辨率和较小的样本量，且对新生儿期（≤1月龄）的研究不足。Nature上线的最新研究，发表了迄今为止最大规模的新生儿肠道菌群的宏基因组学研究。这项来自英国的研究发现，分娩方式是影响新生儿期肠道菌群组成的最主要因素，剖腹产使新生儿的菌群中富集医院环境相关的机会致病菌，且破坏了母婴间的拟杆菌传递，证实了剖腹产对早期肠道菌群的不良影响，但这些变化是否有长期健康影响还需进一步研究。

婴儿肠道菌群 Clinical microbiology metagenomics Microbiome paediatrics

宏基因组学

Nature子刊：宏基因组二、三代混合组装新软件OPERA-MS

二代测序通量高、准确度高，但读长短；三代测序读长长，但错误率高、成本高。将这两者的优势结合，目前在宏基因组领域还没有得到广泛应用，存在很多技术难题没有解决。近日，来自新加坡基因组所的Niranjan Nagarajan课题组发布了一款二、三代测序混合组装软件OPERA-MS，组装结果不仅碱基准确率高，而且短读长数据拼接长度提升了一个数量级。这一重镑成果于7月29日发表于世界顶级期刊《Nature Biotechnology》。

宏基因组学 Clinical microbiology Genome assembly algorithms metagenomics Jing-Min Liu

Nature子刊：儿童哮喘的“卫生假说”再添新证

哮喘发病率随着城市化而攀升，但在农村长大的人群似乎对哮喘有抗性，有研究认为这与农村空气中富含的微生物有关。《Nature Medicine》发表的一项最新研究表明，家庭室内尘埃菌群的构成与儿童哮喘风险相关，与农场家庭的尘埃菌群组成越接近，则孩子的哮喘风险越低，这些发现为儿童哮喘的“卫生假说”添加了新的证据，也提示以室内环境菌群为靶点，或是预防儿童哮喘的可行策略。

儿童哮喘室内菌群 Asthma Clinical microbiology epidemiology

噬菌体疗法

Nature子刊：噬菌体疗法治疗耐药细菌感染

分枝杆菌具有抗生素耐药性，是全球性健康问题。脓肿分枝杆菌感染影响囊性纤维化患者的肺移植治疗，增加移植后的死亡率。Nature Medicine上发表的一项案例研究中，使用含有三种裂解性噬菌体的“鸡尾酒”疗法，安全且有效地改善了一位脓肿分枝杆菌感染的囊性纤维化患者在接受肺移植后的各项症状。

噬菌体疗法 Bacteriophages Biological Therapy Clinical microbiology Medical research

抗生素耐药性

结合进化生物学研究临床相关耐药质粒（综述）

耐药性质粒是临床致病菌获得抗生素耐药性的重要途径。研究耐药质粒在宿主细菌中的持留机制对预测耐药性变化、研究响应耐药性管控措施意义重大。本文作者从进化生物学角度提出了耐药质粒持留的潜在机制，并总结了一系列研究质粒-宿主细菌互作的实验方法和手段，值得专业人士关注。

抗生素耐药性耐药质粒临床菌株基因水平转移 antibiotic resistance

临床微生物学

Nature Reviews：一图读懂呼吸道菌群（必读综述）

火爆朋友圈的一图读懂，特别再次推荐给大家。

临床微生物学感染性疾病流行病学病原体呼吸道疾病