抗生素

肠道菌群恢复力基础研究抗生素菌群失调

粪菌移植 IBS-D 研究论文随机对照试验细菌植入

Science Translational Medicine上发表的一项最新研究结果，对14名健康志愿者接受系统性抗生素治疗前、治疗期间及治疗后的皮肤、口腔及粪便菌群进行对比分析，发现抗生素可对皮肤菌群的组成造成显著及持续的影响，且可能导致抗生素耐药菌在皮肤菌群中的扩增。

抗生素皮肤菌群抗菌素耐药性研究论文基础研究

粪菌移植

粪菌移植治疗难治性肠道移植物抗宿主病

Therapeutic Advances in Hematology上发表的一项前瞻性队列研究结果，在9名严重难治性胃肠道移植物抗宿主病（GvHD）患者中进行粪菌移植治疗，4名患者应答且总生存期延长，广谱抗生素使用与粪菌移植失败相关。另外，患者对粪菌移植治疗的临床应答与回肠结肠免疫细胞浸润的特征变化相关。

粪菌移植研究论文前瞻性队列研究胃肠道移植物抗宿主病抗生素

肠-脑轴

方鑫+陈廷涛：头孢曲松钠调节菌群及炎症以缓解小鼠帕金森病

南昌大学第一附属医院的方鑫团队与南昌大学的陈廷涛团队在Oxidative Medicine and Cellular Longevity上发表的一项最新研究结果，发现在MPTP诱导的帕金森病小鼠模型中，头孢曲松钠可能通过调节肠道菌群组成、增强肠道屏障功能、降低全身及神经炎症，从而缓解行为及神经病理表现。

肠-脑轴头孢曲松钠研究论文基础研究啮齿动物（小鼠）

剖腹产

剖腹产期间使用抗生素的时机，对婴儿菌群有何影响？

现行的NICE剖腹产指南建议产妇在剖腹产前（皮肤切开前）而不是在脐带夹闭后进行预防性抗生素治疗，这可以减少剖腹产产妇的感染风险，但可能使婴儿在产前就暴露于抗生素，从而可能影响婴儿肠道菌群的建立。Gut发表的一项最新随机对照试验，研究了剖腹产过程中给产妇使用抗生素的时机对婴儿肠道菌群定植的影响，表明产妇在剖腹产前使用抗生素不会对婴儿菌群造成额外的不良影响，而剖腹产本身会影响婴儿菌群的早期发育，但似乎不会影响长期健康。

剖腹产婴儿肠道菌群抗生素随机对照试验

靶向基因组挖掘

ARTS-DB：抗生素抗性靶标数据库

本文中作者展示了抗生素抗性靶标搜寻器（ARTS）数据库，这是一个综合性存储库，包含来自 NCBI 的 RefSeq 和 GEM 目录的高质量细菌基因组集，并使用靶向基因组挖掘（TDGM ）策略进行处理。ARTS 数据库允许研究人员快速访问预先计算的 ARTS 结果并通过更广泛的视野探索细菌界。作者相信 ARTS 数据库将成为寻找新型天然产物的重要资源。ARTS 数据库可在 https://arts-db.ziemertlab.com/ 上在线公开访问，没有访问限制。

靶向基因组挖掘 ARTS 数据库生物合成基因簇宏基因组组装基因组抗生素

抗生素

Lancet子刊：相比头孢噻肟，替莫西林治疗发热性尿路感染对肠道菌群的影响更小

三代头孢菌素（头孢噻肟等）可能增加抗生素耐药风险。The Lancet Infectious Diseases上发表的一项4期临床试验结果，在152名发热性尿路感染患者中对比了三代头孢菌素（头孢噻肟）与其替代抗生素（替莫西林）的疗效、安全性及对肠道菌群的影响，发现替莫西林与头孢噻肟的疗效及安全性相似，且对肠道菌群的影响更小。

抗生素研究论文医学研究 4期临床试验发热性尿路感染

抗生素

肠道菌群对抗生素的个体化反应

抗生素对菌群的扰动程度因人而异。有假说认为，这种个体化的反应与治疗前的菌群组成有密切关系。然而，这一假说还需要更多人体研究数据的支持。Microbiome近期发表的一项研究，在一个小型的临床队列中进行了分析，表明治疗前菌群中的特定细菌类群可预测抗生素对菌群的扰动程度。因此，针对治疗前菌群的精确干预，或能减少抗生素引起的菌群失调及其不良影响。

抗生素肠道菌群个体化干预

肠神经系统

破坏肠道菌群，肠神经系统也受累？

肠道菌群与肠神经系统的互作，一定程度上介导了菌群对肠道生理的调控。Microbiome发表的一项最新研究，以抗生素处理的小鼠为模型，研究了肠道菌群的耗竭和自发恢复对肠道生理和肠神经系统的影响，表明肠道菌群可通过其产生的脂多糖（LPS）和短链脂肪酸（SCFA）等物质，来增强肠神经元存活和促进神经生成，从而维持肠神经系统的完整性。

肠神经系统小鼠抗生素肠道菌群

益生菌

国内团队：干酪乳杆菌Zhang或能减少抗生素引起的菌群失调

内蒙古农业大学张文羿团队，近期在Computational and Structural Biotechnology Journal发表研究，表明抗生素治疗不仅导致宿主肠道菌群失调，还导致炎症反应和肠道菌群中抗生素耐药基因增加。而每日补充干酪乳杆菌Zhang可以缓解抗生素干预的这些不良副作用，并促进肠道菌群稳态的恢复，这些益生菌作用可能与戈氏副拟杆菌介导的有益作用有关。

益生菌干酪乳杆菌Zhang 抗生素抗生素耐药基因短链脂肪酸

肠道准备

JAMA子刊：静脉注射+口服抗生素可减少大肠切除术后的切口感染

JAMA Surgery上发表的一项荟萃分析结果，总结了35项随机临床试验（共包含8377名接受选择性结直肠切除术的患者）的数据，发现在静脉注射抗生素的基础上，添加口服抗生素进行肠道准备，可显著降低切口感染的风险。

肠道准备荟萃分析抗生素选择性结直肠切除术

药物-菌群互作

Nature：抗生素伤害无辜肠菌，特定解毒剂或能保护

抗生素被用于对抗致病菌，但也会影响共生细菌，扰乱肠道菌群的组成，导致菌群失调和疾病。但不同种类的抗生素对不同肠道细菌的影响，仍然缺乏系统性研究。Nature最新发表的一项研究在前期工作（https://www.mr-gut.cn/papers/read/1066456444）的基础上，进一步阐明了不同抗生素对肠道共生菌的活性谱，并鉴定出能减少抗生素对共生细菌“误伤”且不影响对致病菌效力的药物，为避免抗生素对肠道菌群造成不良影响提供了新策略。

药物-菌群互作抗生素肠道菌群

肿瘤免疫治疗

抗生素或有益于肝癌免疫治疗

肿瘤免疫治疗研究论文抗生素肝细胞癌队列研究

益生菌

JAMA子刊：益生菌临床试验可能有选择性发表的问题

支持使用益生菌的证据常相互矛盾，导致这一现象的一个原因可能是临床试验结果的选择性发表，比如，研究者或期刊倾向于发表阳性结果的研究，而不发表阴性结果的研究等等。JAMA Network Open近期发表的一项研究，提取了2005年到2016年注册的儿童益生菌和抗生素的临床试验信息，对这些研究后续的发表情况进行了比较。结果发现，相较于抗生素相关研究，益生菌的临床试验结果被发表出来的可能性显著更低，说明益生菌研究有更多的选择性发表的现象。基于这些选择性发表的论文进行的系统评价和荟萃分析研究的结论，也需谨慎对待。

益生菌益生菌临床试验抗生素

抗生素

抗生素使用时长不影响抗生素耐药基因的丰度

来自EBioMedicine上发表的一项前瞻性队列研究结果，对45名接受抗生素治疗的患者及11名对照的粪便菌群及耐药组进行分析，发现抗生素使用时长（7天或14天）并未影响抗生素耐药基因的丰度，也不影响肠道菌群的多样性，但可能影响肠道噬菌体的含量。

抗生素巢式队列研究研究论文耐药组前瞻性队列研究

抗生素

24万人数据：抗生素使用与大肠癌风险有何关联？

Journal of the National Cancer Institute上发表的一项病例-对照研究，对来自瑞典的超过4万名结直肠癌患者及超过20万名对照的数据进行分析后发现，抗生素使用与近端结肠癌风险呈正相关，而与女性的直肠癌风险呈负相关。

抗生素研究论文病例-对照研究结直肠癌

孕期抗生素暴露

孕期抗生素暴露或影响母体免疫功能

虽然孕期暴露抗生素可能会影响胎儿的的健康，但是实际上抗生素是孕期最常见的药物之一，因此正确认识孕期抗生素暴露的影响和具体通路非常有必要。本研究通过动物实验，发现孕期抗生素暴露或影响母亲和胎儿的免疫系统，值得关注。

孕期抗生素暴露研究论文免疫系统抗生素胎盘免疫

抗TNF治疗

IBD患者接受抗TNF-α治疗期间，慎用抗生素！

抗药抗体（ADA）可降低患者对抗TNF治疗的应答。来自Gut上发表的一项回顾性队列研究结果，在1946名接受抗TNF治疗的IBD患者中发现，头孢菌素或青霉素+β-内酰胺酶抑制剂可能增加ADA风险，而氟喹诺酮类或大环内酯类抗生素可能降低ADA风险，在小鼠中的实验结果与患者中的数据一致。该研究结果提示，肠道菌群组成与ADA的产生相关，而IBD患者接受抗TNF-α治疗期间应谨慎使用抗生素治疗。

抗TNF治疗研究论文抗生素抗药抗体回顾性队列研究

抗生素

在菌株层面揭示人肠道微生物组对抗生素治疗的生态和进化反应

Genome Research近期发表的研究，从生态和进化的角度，在菌株层面揭示了人肠道菌群在抗生素治疗期间的变化，表明菌群的生态弹性可延伸到物种以下的遗传层面上。

抗生素肠道微生物组微生物生态学菌株水平

肠-肺轴

抗生素干预肠道菌群，对成年哮喘患者的肺部炎症无显著影响

近年研究揭示了肠-肺轴的存在，提示调节肠道菌群可能影响呼吸道疾病的干预治疗。Clinical Gastroenterology and Hepatology上发表的一项概念验证性干预研究却表明，成年哮喘患者口服抗生素虽然显著降低了肠道菌群的多样性，并改变肠道菌群的组成，但对患者的肺部炎症没有造成显著影响。

肠-肺轴研究论文哮喘医学研究以人为对象的临床试验

益生菌

Nature子刊：益生菌如何影响肠道耐药组？

抗菌药物耐药性对人类健康构成严重威胁，而肠道菌群含有丰富的耐药基因，且可从共生菌向病原菌传递，被称为肠道耐药组。益生菌通常被许多健康人食用或与抗生素联合使用，而益生菌对肠道耐药组的影响仍不清楚。Nature Microbiology近期发表的文章，通过分析肠道原位（经内镜取样）的耐药组，发现虽然益生菌可减少未经抗生素治疗的易定植（而非抗定植）个体的肠内耐药基因的数量，但抗生素治疗后，益生菌会使耐药组扩张。同时，研究发现粪便样本无法反映肠道原位的耐药组，因此直接从肠道原位采样对分析益生菌和抗生素对肠道耐药组的影响非常重要。

益生菌耐药基因个体特异性抗生素

生育力

备孕期服用抗生素与生育能力无关

许多研究探讨孕期服用抗生素与妊娠结局的关联，但是很少有人关注备孕期服用抗生素与备孕结果的关联。本研究基于队列数据，分析了这个话题。结果并没有发现备孕期服用抗生素会影响备孕结果的证据。

生育力研究论文备孕女性抗生素感染性疾病

抗生素

李后开+盛丽莉：高脂饮食影响抗生素暴露后的肠道菌群及宿主代谢恢复

上海中医药大学的李后开、盛丽莉与团队在Frontiers in Cell and Developmental Biology上发表的一项最新研究，发现短期抗生素暴露可影响大鼠的肠道菌群多样性、组成及功能，并改变胰岛素信号及肝脏转录组，且不同抗生素造成的影响有所差异。在45天的恢复期内，肠道菌群、胰岛素信号及肝脏基因表达的恢复程度受到抗生素种类及饮食类型（普通饮食或高脂饮食）的影响，高脂饮食可能恶化抗生素暴露后的宿主代谢恢复。

抗生素饮食-宿主-菌群互作研究论文基础研究其它动物

肠-脑轴

肠道菌群促进阿尔茨海默病吗？看遗传背景

肠道菌群与阿尔茨海默病（AD）的β-淀粉样蛋白（Aβ）病理发展相关。Brain Behavior and Immunity上发表的一项最新研究，发现将老龄（16月龄）AD小鼠模型的粪菌移植给年轻（3月龄）AD小鼠模型后，可促进后者的Aβ斑块形成，但粪菌移植对野生型小鼠无影响。该研究结果提示，虽然肠道菌群的变化自身无法单独诱导Aβ形成，但可在AD遗传背景下促进AD的进展。

肠-脑轴研究论文基础研究抗生素粪菌移植

高脂饮食

扬州大学Nature子刊：高脂饮食削弱抗生素功效？与肠道菌群改变有关

扬州大学王志强团队发表在Nature Microbiology上的文章。该研究主要探究了高脂饮食引发的肠道菌群改变与小鼠抗生素耐受的相关性。研究结果显示，高脂饮食与抗生素处理呈现一种拮抗作用，并且该效应与肠道菌群改变以及代谢物吲哚-3-乙酸（IAA）有关。

高脂饮食抗生素

真菌感染

Nature子刊：β-内酰胺类抗生素如何增加白色念珠菌感染风险

白色念珠菌存在于正常的人体肠道菌群中，通常不会引发感染，但在一些风险因素（如免疫功能低下、黏膜屏障损伤以及广谱抗生素治疗）存在时可能引发致命的感染。Nature Communications近期发表的一项研究，揭示了β-内酰胺抗生素促进白色念珠菌感染的一种机制，表明共生菌群释放的肽聚糖风暴在其中有关键的介导作用。

真菌感染抗生素肽聚糖白色念珠菌肠道菌群

艰难梭菌感染

Nature子刊：预测艰难梭菌感染的菌群标志物

Nature Communications最新发表2篇背靠背研究，对欧洲多中心的ANTICIPATE队列研究的患者数据进行分析，探索了可预测抗生素治疗后发生艰难梭菌感染（CDI）的预测标志物，具有临床应用潜力。本研究对其中945名患者的肠道菌群进行分析，报道了或能预测抗生素相关CDI的菌群标志物。

艰难梭菌感染预测标志物肠道菌群抗生素

艰难梭菌感染

Nature子刊：抗生素相关艰难梭菌感染的预测因素

Nature Communications最新发表2篇背靠背研究，对欧洲多中心的ANTICIPATE队列研究的患者数据进行分析，探索了可预测抗生素治疗后发生艰难梭菌感染（CDI）的预测标志物，具有临床应用潜力。本研究报道了该队列中1007名患者的CDI发生率，以及潜在的可预测CDI的患者临床特征和标志物。

艰难梭菌感染预测标志物抗生素

肠道菌群

人肠道菌群对抗生素治疗的生态和进化反应（综述）

抗生素治疗可对人肠道菌群的微生物生态和进化造成影响，FEMS Microbiology Reviews发表的综述对此进行了总结和讨论。

肠道菌群抗生素微生物生态学进化