微生物绝对丰度变化

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微生物绝对丰度变化

刘星吟团队：评估微生物绝对丰度变化新方法

南京医科大学刘星吟团队发表研究，提出了一种基于微生物相对丰度来估计不同条件下各类群中微生物绝对丰度变化的新方法(quantification of microbial absolute abundance differences，QMD)，同时作者构造了基于QMD开展组间差异菌识别(differential abundant taxa，DA)的统计检验假设模型。研究表明，微生物绝对丰度组间差异可以用其相对丰度加上组间的总微生物丰度的变化来估计。QMD方法得到了真实的微生物绝对丰度变化数据的验证。与其他方法相比，QMD在微生物差异丰度定量、DA识别、运行速度上都表现出较好的性能。

微生物绝对丰度变化鲁棒性假阴性率（FNR）组间差异菌识别仿真实验