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小肠君
文章数:483篇
新冠疫苗
国内团队:肠道共生菌或通过预存抗体影响新冠疫苗效果
影响新冠疫苗有效性的因素众多,接种者体内的预存抗体是重要的影响因素之一。华山医院感染科团队近期发表研究,发现肠道共生菌群可能是新冠交叉反应抗体的重要来源。该研究结果显示,肠道菌群结构差异直接影响预存S2蛋白交叉反应抗体的有无,而且鼠源的单克隆交叉反应抗体能够中和新冠病毒;研究者进一步在临床队列中发现S2蛋白预存抗体水平与新冠灭活疫苗激发特异性抗体水平正相关。该研究不仅为解释疫苗免疫反应的人群差异提供了新思路,并且为提高疫苗有效性提供了一个潜在的靶标,对于后续研究具有重要参考价值。
新冠疫苗
S2蛋白预存抗体
肠道菌群
研究论文
基础研究
类器官
复旦肿瘤医院:用游离癌细胞培养类器官,提供抗癌新方法
无法通过手术方法治疗的转移型结直肠癌,对治疗提出了新挑战。复旦大学附属肿瘤医院团队近期在Clinical and Translational Medicine发表通讯文章,介绍了通过血液游离癌细胞培养类器官的方法,为建立转移型结直肠癌的个体化治疗方法提供了一个研究平台,值得参考。
类器官
研究论文
基础研究
结直肠癌
转移性结直肠癌
细菌间互作
肠道菌群产物调节霍乱弧菌运动模式
肠道菌群分泌的小分子很可能是介导共生细菌-致病菌互作的关键物质。Gut Microbes近期发表的研究发现,健康人肠道提取物和肠道细菌培养液上清中,含有可以调节霍乱弧菌运动和黏膜穿透的小分子物质,虽然肠道菌群分泌的小分子对于霍乱弧菌的生长和运动呈抑制作用,但不同细菌产物的影响并不一致。该研究从菌群、菌株代谢水平解读共生菌-霍乱弧菌互作分子机制,对于深入研究肠道内细菌间互作、肠道细菌致病机制调控均有重要参考价值。
细菌间互作
肠道菌群小分子
霍乱弧菌
生物膜
肠癌发生
厦门大学:揭示肿瘤发生中的ID1双向调节机制
ID1基因是转化生长因子TGFβ的下游基因,在肠癌发生中发挥关键作用。Nature Communications近期发表厦门大学周虎团队的新研究,发现TGFβ通过改变Nur77的功能,对ID1基因及其表达产物发挥了双向调节作用。该成果对于揭示结肠癌的发生、转移和耐药机制具有重要价值。
肠癌发生
研究论文
基础研究
转化生长因子TGFβ
Nur77
结直肠癌
预测结直肠癌预后的脂质组参数
脂代谢与众多慢性病相关,有望成为癌症诊断指标。Gastroenterology近期发表一项基于发现队列和验证队列的研究,发现脂肪酸合成酶的表达水平在结直肠癌组织中上调,TG谱可以作为预测结直肠癌的可靠预测参数。本研究对于建立新型结直肠癌预后模型具有参考价值。
结直肠癌
脂质组
三酰甘油
预后预测
结直肠癌风险
预测结直肠癌风险的新工具
溃疡性结肠炎进展为结直肠癌一直缺乏预测方法。Gut近期发表一款基于多中心研究和验证的直肠癌风险预测工具UC-CaRE,该工具利用溃疡性结肠炎的炎症活动期状态、 轻度异常增生(LGD)体积、LGD可见程度或完全切除程度、多病灶情来预测结直肠癌患病风险。该工具可以使医生和患者直接分析癌症进展风险,有助于及时干预或治疗。
结直肠癌风险
轻度异型增生(LGD)
风险预测模型
结直肠癌诊断
检测结直肠癌微卫星不稳定性的二代测序新方法
二代测序广泛应用于癌症相关突变位点检测,Gastroenterology近期发表的研究对比了新老两种检测结直肠癌微卫星不稳定性的二代测序分析方法,发现新开发的MSICare分析方法在检测阳性率方面优于被FDA批准的MSISensor方法。该结果对于优化结直肠癌诊断具有参考价值。
结直肠癌诊断
微卫星不稳定性(MSI)
二代测序(NGS)
白色念珠菌
Cell子刊:白色念珠菌接合生殖和肠道定植共用调控因子
白色念珠菌既是一种条件致病菌,也是人体共生菌群的组成成分。Cell Host and Microbe近期发表研究,发现白色念珠菌的有性接合生殖与宿主体内定植共享多种转录调控因子,尽管各因子在两种行为中发挥的调控作用有所差别。该研究结果揭示了白色念珠菌基因调控网络的复杂性和多向性,对于研究微生物适应性调控机制具有重要参考价值。
白色念珠菌
定植适应性
研究论文
转录调控
不可培养的微生物
死细菌——人类肠道菌群的培养盲区?
尽可能多地分离培养肠道细菌,对于研究肠道微生态以及进行有效干预具有重要意义;但是受限于目前技术条件,人体肠道中存在大量不可培养细菌菌株。Gut Microbes近期发表一项研究,通过联合使用荧光激活细胞分选技术、高通量测序和培养组技术,发现培养技术的局限性并不是部分菌株难以培养的唯一原因,标本的来源很可能对肠道菌株的活性具有重要影响。该研究不仅建立了宏基因组-培养组联用的新型分析方法,也为肠道菌株培养技术提供了理论和技术参考。
不可培养的微生物
培养组学
荧光激活细胞分选技术
新冠肺炎
肠道环境或可减缓新冠肺炎症状
肠道症状是新冠肺炎的肺外症状之一。Gastroenterology近期发表了西奈山医学院的一项研究,在患者队列中发现,具有肠道症状患者的肺炎严重程度和死亡率反而较低,肠道活检组织中炎症状态处于抑制状态,提示肠道环境中可能具有抑制新冠肺炎严重程度的机制。该研究从队列和肠道组织角度阐释了肠道症状与新冠肺炎转归的关系,对于进一步研究新冠肺炎相关免疫调控具有重要参考价值。
新冠肺炎
肠道症状
研究论文
粪菌移植
多中心临床试验支持菌群移植预防抗生素耐药细菌
常规医疗手段难以预防和阻止抗生素耐药细菌在肠道中的定植,为日后发生耐药细菌感染、耐药基因转移留下隐患。Genome Medicine近期发表一项非双盲多中心临床试验,发现用于预防艰难梭菌感染复发的菌群制剂RBX2660,还可以降低患者肠道中耐药细菌、耐药基因组载量,为预防风险人群感染耐药细菌提供了参考,也是管控抗生素耐药性传播的新实践,值得参考。
粪菌移植
抗生素耐药细菌
研究论文
医学研究
人
昼夜节律
NEJM综述:解读生物钟的机制和医学应用价值
生物钟/昼夜节律调控机制的研究,不仅解释了机体的生理现象,也对疾病的防治具有启示。新英格兰医学杂志近期发表综述,从昼夜节律产生的生理结构、分子基础出发,系统性介绍了昼夜节律在一系列现代疾病中的影响和作用,提出了在疾病防控、治疗中需要重视人体昼夜节律的重要性,对于机制研究和临床运用都具有参考价值。
昼夜节律
昼夜节律紊乱
综述
诊断
治疗
合成生态学
Nature子刊:合成微生物群落的自动化设计
建立稳定的人造多菌株微生态具有重要的实用价值。Nature Communications近期发表研究,开发了一种可用于构建稳定微生态群落的自动化设计软件,该软件有助于发现构建稳定微生态群落所需的关键指标和条件,对实际构建具有重要指导意义,值得参考。
合成生态学
研究论文
计算生物学
免疫
Cell子刊:代谢疾病与新冠肺炎相关性的序幕已拉开(综述)
新冠肺炎全球蔓延至今,住院患者的肥胖、糖尿病和心血管风险因素成为科研和医学转化的关注点。Cell Metabolism近期发表综述,回顾了2020年初至今对于肥胖/糖尿病与新冠肺炎的相关性研究,指出代谢风险因素与新冠肺炎发生、发展与预后的研究仍然有许多空缺,强调了需要关注新冠肺炎对于代谢疾病的长期影响。该综述对于系统性了解代谢疾病与新冠肺炎的关联、合理制定对症治疗手段具有参考价值。
免疫
代谢紊乱
新冠肺炎
综述
糖尿病
衰老与衰弱
Nature子刊:终生限食支链氨基酸或可减缓衰老
蛋白质限制饮食对多种生物均有促健康、促长寿作用,但具体哪种营养成分发挥促健康作用缺乏定论。Nature Aging近期发表一项基于小鼠的研究,发现限制食用支链氨基酸可以促进健康、延长小鼠寿命,对于雄性小鼠的促健康作用尤为显著。该结果对于开发促健康饮食、促进老年健康具有参考价值。
衰老与衰弱
支链氨基酸
限制饮食
研究论文
基础研究
细菌-真菌互作
共生细菌或决定白色念珠菌在肠道内的定植量
白色念珠菌感染是严重的医院获得性感染类型,预测其定植量和抑制方法有助于治疗这种真菌感染。ISME Journal近期发表的研究中建立了一种新的细菌-真菌代谢互作模型,不仅发现肠道共生细菌可以调节白色念珠菌的代谢活性和定植能力,还可用于预测白色念珠菌的定植量,并发现了有可能负调控白色念珠菌定植的细菌,为研究肠道中真菌-细菌互作以及开发可能的抗真菌感染生物制剂提供了理论参考。
细菌-真菌互作
真菌感染
研究论文
基础研究
白色念珠菌定植
膳食纤维
Nature Reviews:一文+一图读懂膳食纤维与胃肠健康(综述)
膳食纤维对肠道健康的促进作用近年来得到大量关注。Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology近期发表综述文章,详细解读了膳食纤维的理化性质对其在胃肠道中作用的影响,重点关注了膳食纤维可溶性、粘度和发酵性等特点,并回顾总结了膳食纤维在缓解胃肠疾病中的作用。本文的内容对于了解膳食纤维特点、功能以及在不同胃肠道疾病中的使用方法具有重要价值。我们特别将文中的图表编译为一图读懂,希望能帮助你涨知识。
膳食纤维
肠胃健康
综述
抗性淀粉
华西医院:抗性淀粉摄入或可缓解风湿性关节炎
饮食引发的肠道微生态变化很可能影响风湿性关节炎这类代谢疾病。Journal of Autoimmunity近期发表四川大学华西医院罗玉斌团队的研究,利用胶原诱导的关节炎(CIA)的小鼠模型,发现富含抗性淀粉的高纤饮食可显著缓解骨骼损伤、改变肠道微生态并增加血液中丙酸盐。该研究结果指示,富含抗性淀粉的高纤饮食可能可作为风湿性关节炎早期干预的食疗手段,为缓解这类自身免疫疾病提供了潜在新方法,值得参考。
抗性淀粉
免疫调控
Resistant starch
Collagen-induced arthritis (CIA)
Short-chain fatty acids (SCFAs)
新冠肺炎
ACE2的多重作用或有助于开发新冠肺炎新疗法(观点)
ACE2是新冠病毒入侵人体细胞的主要受体,但该蛋白在肠道微生态、肠道炎症调控中也具有重要功能。Gastroenterology杂志近期发表观点文章,通过总结ACE2在肠道中的作用,提出了SARS-CoV-2影响肠道微生态、肠道上皮的机制假说。该潜在机制有助于深入了解SARS-CoV-2致病性,并有望用于开发新疗法。
新冠肺炎
ACE2蛋白
COVID-19
其他
生物钟
少熬夜!晚睡或增加高血脂风险!
根据生物钟类型可将人群分为早睡型(工作时间集中于上半日)和晚睡型(工作时间集中于下半日)。Clinical Nutrition近期发表人群研究,发现在健康的年轻成年人中,晚睡型与心血管代谢风险增加、血脂类型改变有关,为进一步研究代谢紊乱的影响因素提供了人群研究数据,值得参考。
生物钟
心血管代谢风险
研究论文
医学研究
人群研究
微生物培养
Nature Reviews:微生物培养技术的创新进展(综述)
虽然测序技术的开发使得微生物研究可以脱离单菌株操作,但是深入的机制研究依然需要单菌株分离和培养。本综述总结了目前急需创新培养方法的微生物研究领域,归纳了制约现有菌株分离、鉴定、培养的因素,并介绍了近年来开发的一系列创新分离鉴定方法,对于经典微生物学、新兴微生态学研究都具有借鉴意义。
微生物培养
综述
IBD治疗药物
特定IBD药物可能与重症COVID-19风险相关
不同的IBD治疗方式可能与患者罹患重症COVID-19的风险有关。Gut近期发表一项对于国际注册临床研究的数据分析研究,比较了不同IBD药物治疗策略对重症COVID-19患病风险的相关性,结果显示治疗IBD的多药物联用疗法和巯基嘌呤药物可能与重症COVID-19风险增加相关。该结果对于疫情期间选择IBD用药具有一定参考价值。
IBD治疗药物
研究论文
COVID-19
医学研究
以人为对象的临床试验
微生物单细胞测序
高保真读取单细菌转录情况的新方法
检测单个细胞在不同条件下的转录情况,有助于阐释基因组相同的单细胞的表型、功能差异;但原核生物单细胞RNA测序一直是技术难点。Nature Microbiology近期发表了一种不依赖于转录片段poly(A)区域结合的细菌单细胞RNA测序方法,并在沙门氏菌和铜绿假单胞菌中验证该方法的实用性,有助于该技术运用于复杂微生态中的单细胞转录情况检测。
微生物单细胞测序
研究论文
基础研究
类器官
MIT华人团队:揭示细胞体积压缩对类器官生长的影响
MIT华人团队近日在Cell Stem Cell发表研究,发现压缩细胞体积造成的细胞内分子拥挤状态,可以通过影响Wnt/b-catenin信号通路驱动干细胞更新、促进类器官生长。该研究成果不仅揭示了一种外界物理因素对于细胞功能的影响方式,更为促进干细胞、类器官生长提供了方法,值得参考。
类器官
molecular crowding
mechanobiology
organoid
cell mechanics
微生物单细胞测序
单细胞功能基因组学捕捉罕见纤维降解细菌
从环境中筛选、鉴定出具有特定功能的细菌对于研究微生态功能具有重要意义。本研究利用底物荧光标记、流式细胞分选和单细胞基因组测序技术,从热泉环境中分离出了多种新的纤维降解细菌和纤维素分解酶。这种基于功能筛选的微生物单细胞基因组测序技术,有望用于阐释复杂微生态体系中的微生物功能,尤其适用于鉴别低丰度、难培养微生物。
微生物单细胞测序
功能基因组学
研究论文
难培养微生物
可移动基因元件
长读长测序协助发掘肠道菌群中的可移动基因元件
肠道菌群基因组中的可移动基因元件对于微生物进化、菌群-宿主互作具有重要影响。《Microbiome》近期发表一项研究,运用nanopore长读长测序技术,发现人体肠道菌群基因组中的可移动基因元件数量大于公共数据库中的已有数据,并发现来自拟杆菌的质粒分布广泛,还阐述了多个聚集在可移动基因元件上的基因功能。上述结果对于研究肠道菌群进化、菌群内和菌群-宿主互作具有重要参考价值。
可移动基因元件
长读长测序
纳米孔测序技术
人肠道菌群
Yonghui Ma
丰度基因
寻找与CRC、IBD相关肠道菌群基因的新方法
分析共丰度基因群( CAG)有助于简化从基因层面研究菌群的方法。近期《Microbiome》发表一种新的数据处理方法,将CAG作为基础单位进行基因水平的菌群分析,并用该方法验证了一系列结直肠癌、炎症性肠病人群研究中与疾病相关的CAG。该数据计算方法有助于在基因层面揭示肠道菌群与人体健康的关系。
丰度基因
肠道菌群标志物
方法学
结直肠癌
炎症性肠病(IBD)
皮肤菌群移植
皮肤菌群移植存在可能性!
皮肤菌群与皮肤健康有重要关联。《Microbiome》近期发表人体试验研究,发现从健康人皮肤上获得的菌群或者单菌株,短期内可以改变皮肤菌群移植受体的皮肤微生态结构,移植程度受移植物中微生物种类和数量、供体和受体原始皮肤菌群的影响。该结果对于研究皮肤菌群移植的可操作性具有参考价值。
皮肤菌群移植
Cutibacterium acnes
Microbiome transplantation
skin microbiome
人体皮肤菌群
Milestones in human microbiota research
Nature人体菌群研究里程碑:测序识别人类菌群
测序技术的发展有助于人类探索和自身相关的微生态结构和功能。本文回顾了检测人体相关菌群的测序方法,介绍了从一代Sanger测序到三代长度长测序在研究菌群特征中的优缺点,以及近期在人类菌群参考基因组构建、新基因组组装上获得的进展。
Milestones in human microbiota research
Sanger测序
扩增子测序
鸟枪法测序
参考基因组
抗生素耐药性
代谢适应性与生物被膜中的耐药性(综述)
活跃的微生物代谢状态是多种抗生素发挥作用的前提。《Trends in Microbiology》近期发表综述,系统性介绍了生物被膜中抗生素耐药性产生与微生物的代谢变化之间的关联,指出代谢活性下降是生物被膜耐药性增加的重要机制,对于研究生物背膜耐药性、开发针对性的耐药性管控具有重要参考价值。
抗生素耐药性
生物被膜
antimicrobial tolerance
biofilm
Metabolism