JAMA子刊:益生菌临床试验可能有选择性发表的问题

JAMA Network Open [IF:8.483]
① 纳入265项益生菌和136项抗生素的儿科注册临床试验进行分析;② 相比于益生菌研究,抗生素研究的发表比例更高(61.0%vs44.9%),在校正资金来源、盲法和目的等因素后,其发表的可能性也更高(OR 2.1);③ 抗生素试验更可能以治疗为目的(83.8%vs44.2%), 其多中心设计比例更高(35.4%),影响因子中位数显著更高(7.2vs3.0);④ 益生菌试验比抗生素试验更可能存在选择性发表的问题,提示需谨慎对待益生菌研究的系统评价和荟萃分析。
【主编推荐语】支持使用益生菌的证据常相互矛盾,导致这一现象的一个原因可能是临床试验结果的选择性发表,比如,研究者或期刊倾向于发表阳性结果的研究,而不发表阴性结果的研究等等。JAMA Network Open近期发表的一项研究,提取了2005年到2016年注册的儿童益生菌和抗生素的临床试验信息,对这些研究后续的发表情况进行了比较。结果发现,相较于抗生素相关研究,益生菌的临床试验结果被发表出来的可能性显著更低,说明益生菌研究有更多的选择性发表的现象。基于这些选择性发表的论文进行的系统评价和荟萃分析研究的结论,也需谨慎对待。(@mildbreeze)
Comparison of Publication of Pediatric Probiotic vs Antibiotic Trials Registered on ClinicalTrials.gov
2021-10-08, doi:10.1001/jamanetworkopen.2021.25236

Nature子刊:新一代工程菌SYNB1934治疗苯丙酮尿症或更有效!

Nature Communications [IF:14.919]
① 已开发的Escherichia coli Nissle(EcN)菌株SYNB1618,能表达苯丙氨酸解氨酶(PAL),降解胃肠道内的苯丙氨酸;② 利用基于生物传感器的PAL突变文库的高通量筛选方法Pop ‘n’ sort,筛选PAL突变体;③ 通过优化全细胞PAL活性,该筛选中获得的一种前导酶用于SYNB1934,构建一株更有效的基于EcN的苯丙酮尿症治疗菌株;④ SYNB1934具有与SYNB1618一致的代谢和生物安全特性,但PAL活性增加了近两倍,能显著降低血浆苯丙氨酸。
【主编推荐语】在苯丙酮尿症(PKU)患者中,苯丙氨酸羟化酶(PAH)的遗传缺陷导致全身苯丙氨酸(Phe)升高,可导致严重的神经功能损害。Synlogic公司已经开发了一株可降解苯丙氨酸(Phe)的大肠杆菌(Escherichia coli Nissle, EcN)菌株SYNB1618(查看文章),作为PKU的治疗药物。该临床工程菌株表达苯丙氨酸代谢酶苯丙氨酸解氨酶(PAL),催化苯丙氨酸脱氨为无毒产物反式肉桂酸(TCA)。Nature Communications近期发表的研究,利用基于生物传感器的PAL突变文库的高通量筛选,通过优化全细胞PAL活性,生成了一种更有效的基于EcN的PKU治疗菌株。与SYNB1618相比,SYNB1934体内PAL活性增加了近两倍。(@nana)
Improvement of a synthetic live bacterial therapeutic for phenylketonuria with biosensor-enabled enzyme engineering
2021-10-28, doi:10.1038/s41467-021-26524-0

JAMA:医用菌菇和中草药能否抗新冠?美国开展临床试验

JAMA [IF:56.272]
① 西方医学尚无治疗COVID-19的有效药物,一些研究者开始将目光投向中草药和医用菌菇等传统医学疗法上;② 美国FDA已批准评估2种菌菇(云芝+苦白蹄)及中草药(源于清肺排毒汤)用于COVID-19治疗的1期临床试验,目前正在加州大学圣迭戈分校和洛杉矶分校开展,另有2项研究菌菇能否增强COVID-19疫苗反应的试验也在进行中;③ 一些菌菇可调节免疫和抗病毒,清肺排毒汤在中国也显示了有效性,不同功能的生物活性物质或是这些药物的治疗机理。
【主编推荐语】传统中药在我国这次抗击新冠中发挥了重要作用。JAMA最新发表的一篇新闻,报道了美国目前正在开展的评估医用菌菇和中草药用于辅助治疗和预防新冠的临床试验,以及相关研究者的观点和评论。可以看到,“以食为药”的理念以及中草药的治疗作用,在西方学界已经得到了一定的认可和关注。中草药等传统医学是一座尚待挖掘的宝库,用现代科学和医学研究手段深入挖掘其中的有效物质和作用机理,将为更多的患者带来福音。(@mildbreeze)
Trials Test Mushrooms and Herbs as Anti-COVID-19 Agents
2021-11-03, doi:10.1001/jama.2021.19388
重医团队再发力,深入揭示“抑郁猴”的肠道菌群特征
本期话题:肠脑轴,抑郁猴,乙酸,小胶质细胞,心脏健康饮食模式,康普茶,膳食脂肪,FMT,免疫治疗,急性营养不良
2021-11-03
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本期话题:新冠肺炎,益生菌,肝硬化,肠-肝轴,饮食-免疫互作,真菌溶菌酶,显微镜下结肠炎,卡拉胶,环境污染物,粪菌移植
2021-11-02
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今日Cell:肠道感染如何触发“肠神经保卫战”
本期话题:神经免疫,双歧杆菌,肠道微生物组-代谢组,脂肪肝,下一代益生菌,维生素B12,维生素D受体
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本期话题:肠脑轴,进食控制,神经退行性疾病,模式生物,肠神经系统,色氨酸代谢,肠道真菌,肥胖,功能宏基因组学,口腔癌
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2021-10-27
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本期话题:新冠肺炎,分节丝状菌,IBD,肠-肝轴,多发性硬化,艰难梭菌感染,潘氏细胞,食物过敏,菌群-免疫互作
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聚焦“促癌坏蛋”具核梭杆菌:2中国团队再有新突破
本期话题:具核梭杆菌,ANGPTL4,ST11肺炎克雷伯菌,脆弱拟杆菌,RANBP1,BET蛋白,早发性转移性结直肠癌,TLR4,癌症恶病质
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