Cell:复杂且明确的合成人类肠道菌群模型

Cell [IF:66.85]
① 在体外构建一个组成明确、复杂、稳定且可重复的合成菌群hCom1,包含人肠道菌群中常见的104种细菌,并对hCom1中的菌株-氨基酸互作及其对群落组成的影响进行了系统性分析;② 给定植hCom1的小鼠再次定植人粪便菌群(粪便挑战)以填补hCom1中未被占据的生态位,最终获得含119种肠菌的群落hCom2;③ 定植hCom2的小鼠在粪便挑战时有更强的群落稳定性,对致病性大肠杆菌的定植抵抗也更强;④ 定植hCom2或人类粪便菌群的小鼠具有相似的表型(细菌密度、免疫细胞谱、菌群代谢物),表明hCom2或能作为模型系统用于肠道菌群研究。
【主编推荐语】在小鼠中建立人类肠道微生物组模型有助于探究宿主-微生物相互作用。然而,目前的模型群落仍有较大缺陷:或是种类组成明确但结构相对简单,或是结构相对复杂但种类组成不明确,这极大的限制了人肠道微生物群模型的应用。Cell最新发表了斯坦福大学Michael Fischbach和Kerwyn Huang团队的研究论文,成功构建了一个人肠道微生物来源的、物种组成明确、结构复杂的群落hCom2。hCom2能反应人肠道微生物组的大部分生物学特性,并且该群落组成稳定,对病原体定植有很强的抵抗力,该模型或有助于对影响宿主健康的基因、微生物种类进行机制研究。未来需进一步完善该群落,包括增加细菌菌株以占据空的生态位,以及古细菌、真菌和病毒等肠道中的其它重要物种。(@NL)
Design, construction, and in vivo augmentation of a complex gut microbiome
2022-09-06, doi:10.1016/j.cell.2022.08.003

祁斌团队Cell子刊:大肠杆菌激活宿主食物消化系统新机制

Cell Host and Microbe [IF:31.316]
① 通过在秀丽隐杆线虫中建立食物消化系统,发现肠道细菌外膜蛋白(OMP)和神经免疫通路相互作用调控宿主食物消化;② 大肠杆菌OmpF/A通过激活神经肽NLP-12,作用于受体CCKR以激活食物消化;③ NLP-12是哺乳动物胆囊收缩素的同源物并可刺激多巴胺,缺失多巴胺受体或添加多巴胺拮抗剂可抑制OMP介导的消化;④ 多巴胺和NLP-12-CCKR-1通过抑制先天免疫PMK-1/p38,进而激活食物消化系统。
【主编推荐语】肠道菌群在调控食物消化方面可能具有关键作用,然而肠道微生物如何激活食物消化,其机制尚不清楚。近日,云南大学祁斌团队在Cell Host and Microbe发表文章,通过建立线虫食物消化研究体系,揭示大肠杆菌膜蛋白OmpA/F通过多巴胺和NLP-12-CCKR-1抑制先天免疫p38/MK-1通路,从而激活动物食物消化系统。这项研究揭示细菌OMP在调节动物营养吸收以及先天免疫中的关键作用。(@圆圈儿)
Gut commensal E. coli outer membrane proteins activate the host food digestive system through neural-immune communication
2022-09-02, doi:10.1016/j.chom.2022.08.004

Nature 子刊:青壮年时短期服用雷帕霉素,或可通过肠道自噬长期抗衰老

Nature Aging [IF:N/A]
① 在成年果蝇早期,雷帕霉素治疗可延缓衰老,并减轻与年龄相关的肠道衰退,其效果与终生服用相同;② 机制上,肠细胞自噬增加导致肠道中LManV和溶菌酶水平升高,从而介导早期雷帕霉素治疗的持久记忆;③ 成年早期短暂的雷帕霉素治疗可持续激活肠细胞自噬;④ 小鼠中,3个月的雷帕霉素早期治疗可达到长期治疗的类似效果:如溶菌酶分布、肠隐窝中Man2B1的水平、潘氏细胞结构以及肠道屏障功能等,即使停用6个月也有类似效果。
【主编推荐语】雷帕霉素可通过抑制TORC1活性并延长模式生物的寿命,然而目前尚不清楚何时以及多久服用雷帕霉素可达到长期治疗相同的效果,从而避免连续给药的不良副作用。近日发表在Nature Aging上的这篇文章,通过对不同年龄段的果蝇进行雷帕霉素处理,发现雌性果蝇和小鼠成年早期,使用雷帕霉素慢性治疗可通过药物的短暂脉冲获得抗衰老作用。因此,这项研究提供了药物干预实现抗衰老的新途径,最大限度地减少药物副作用的同时可最大限度地发挥药效。(@圆圈儿)
Long-lasting geroprotection from brief rapamycin treatment in early adulthood by persistently increased intestinal autophagy
2022-08-28, doi:10.1038/s43587-022-00278-w
延伸阅读: 【ScienceDaily】

袁慧娟团队:绝经后骨质疏松症患者的肠道和阴道菌群变化

Frontiers in Immunology [IF:8.786]
① 纳入132名绝经后妇女,分为骨量正常(对照)组、骨量减少组和骨质疏松(PMO)组,探索不同组间肠道和阴道菌群的差异及关联;② 相较于对照组,PMO组肠道菌群中产丁酸的Collinsella、产短链脂肪酸相关的Romboutsia等显著减少,阴道菌群中炎症相关的链球菌属等显著增多,而可缓解炎症反应的乳杆菌属等显著减少;③ PMO组血清中IL-10水平显著低于对照组和骨量减少组,而TNF-α水平显著高于对照组;④ 关联分析发现,肠道菌群与PMO的关系比阴道菌群更为密切。
【主编推荐语】绝经后骨质疏松症(PMO)受雌激素代谢和免疫反应的影响,而这些因素又受到菌群和炎症等因素的调节。河南省人民医院袁慧娟团队近期在Frontiers in Immunology发表研究,探索了肠道和阴道菌群与PMO的关联,表明绝经后妇女的骨密度变化与肠道菌群和阴道菌群的变化有关,而肠道菌群与PMO的关联更为紧密,为进一步研究菌群与PMO之间的因果关系和机制提供了方向。(@mildbreeze)
Changes in the composition of gut and vaginal microbiota in patients with postmenopausal osteoporosis
2022-08-12, doi:10.3389/fimmu.2022.930244
免疫细胞迁移:肠道如何成为炎症性疾病的“核心”?
本期话题:免疫细胞迁移,乳糜泻,扁桃体菌群,肠道超声,IBD,钙卫蛋白,NSAID,菌群-免疫互作
2022-09-06
人工智能+传统病理分期,助力大肠癌治疗决策
本期话题:人工智能预测分期,图像分析,具核梭杆菌,种族,筛查,持久性细胞,胆汁酸,上皮细胞,禁食
2022-09-05
茶的益处再添新证!追踪50万人,每天2杯茶可降低早死风险
本期话题:茶,癌症,饮酒,临床营养,植物性饮食,帕金森病,衰老,北欧饮食,蛋白质,维生素E,豆类
2022-09-04
菌群/营养/代谢,多视角聚焦糖尿病和肥胖
本期话题:糖尿病,肥胖,铁稳态,个体化治疗,饮食干预,减肥手术,益生菌,益生元,鞭毛蛋白,FMT
2022-09-03
今日Cell:肠菌也“挑食”?新方法深入解析
本期话题:饮食-菌群-宿主互作,IBD,微流控单细胞技术,多组学,益生菌,新冠,番茄
2022-09-02
8月,最值得看的30篇肠道健康文献!
2022年8月,根据“热心肠因子”计算的30篇必读文献。
2022-09-01
Cell重磅:“垃圾食品”扰乱菌群-免疫互作,让肠道更吸油
本期话题:Th17,肺菌群,嗜酸性粒细胞,IBD,银屑病,微生物生态学,病毒感染,益生菌
2022-08-31
31分Nature子刊:免疫细胞维护肠屏障的新招数
本期话题:ILC3,新冠,IBS,药物递送,IBD,疫苗,胰腺炎,2型免疫应答,嗜酸性食管炎
2022-08-30
II期临床:新辅助化疗有助于早期直肠癌患者的器官保留
本期话题:新辅助化疗,结直肠癌筛查,2/3期直肠癌,化疗耐药,癌症恶病质,POU5F1B,胰腺癌,菌群定量性状位点,膳食氨基酸
2022-08-29
86页综述详解:限时进食知几何,可取否?
本期话题:限时进食,饮食模式,饮食排除法,可穿戴设备,临床实践指南,膳食补充剂,n-3脂肪酸,鱼油,铁皮石斛
2022-08-28