张涛+贾慧珏:Nature子刊揭示肠道菌群与血液代谢物间的因果关系

Nature Genetics [IF:38.33]
① 纳入2个中国队列(发现+验证,共3432人),用双向孟德尔随机化挖掘肠道菌群(如肠菌、菌群功能)与人体代谢特征的因果关联;② 鉴定出菌群与血液代谢物间的58个因果关联(17个菌→血,41个血→菌),复证了43个;③ 如Oscillibacter和Alistipes可降低血液甘油三酯,而血液谷氨酸可使草酸杆菌属减少,5-甲基四氢叶酸、丙氨酸、谷氨酸盐和硒等可影响变形菌门成员;④ 用日本生物库数据验证了部分发现,并延伸鉴定出肠菌与多种疾病的因果效应。
【主编推荐语】肠道微生物组与人体的生理状态和疾病密切相关,但这些关联是否具有因果关系仍存争议。Nature Genetics最新发表了深圳华大生命科学研究院张涛和贾慧珏作为共同通讯作者的研究,收集分析了3432名中国人的全基因组、粪便宏基因组、人体测量学和血液代谢物数据,通过M-GWAS以及双向孟德尔随机化分析,鉴定出肠道微生物组(如特定微生物分类单元及菌群功能)与血液代谢物水平之间的潜在因果关系,为进一步揭示菌群与表型和疾病关系以及潜在干预方法,提供了新的证据和假说。(@mildbreeze)
Mendelian randomization analyses support causal relationships between blood metabolites and the gut microbiome
2022-01-03, doi:10.1038/s41588-021-00968-y
延伸阅读: 【BioArt】

Nature子刊:非洲农村婴儿的肠道菌群及其营养网络的发育特征

Nature Microbiology [IF:17.745]
① 纳入冈比亚农村616名7-37月龄婴幼儿,取3个时间点共1389个粪便样本,研究非工业化环境下的肠道菌群发育特征;② 年龄是决定肠道菌群组成的主要因素,而人体测量指标不是;③ 揭示了多种肠菌随年龄的变化规律;④ 平均而言,Prevotella copri(Pc)、普氏粪杆菌(Fp)和Prevotella stercorea(Ps)是丰度最高的肠菌;⑤ 鉴定出多个细菌营养网络集群,以Ps或Fp为中心的菌群伴随年龄增长稳步发展,而Pc在断奶后迅速成为优势菌(1岁时达到稳定)。
【主编推荐语】居住在工业化国家和非工业化国家的人,其肠道菌群中存在不同的细菌营养网络,非工业化国家居民的肠道菌群往往富含普氏菌属物种。Nature Microbiology近期发表的一项研究,分析了600余名不同月龄的冈比亚农村婴幼儿的肠道微生物组,揭示了非工业化环境下婴幼儿肠道菌群和高丰度肠菌的发育规律,以及其基于普氏菌属物种的细菌营养网络特征。(@mildbreeze)
Gut microbiomes from Gambian infants reveal the development of a non-industrialized Prevotella-based trophic network
2021-12-31, doi:10.1038/s41564-021-01023-6
延伸阅读: 【Nature Microbiology】

Nature子刊:GM15小鼠肠道菌群模型

Nature Communications [IF:14.919]
① 分析C57BL/6J SPF/SOPF小鼠的粪便菌群,鉴定出20个优势菌科,通过分离培养,用其中7个科的15个菌株建立一种标准化的简化小鼠肠道菌群模型,命名为GM15;② GM15广泛地再现了C57BL/6J SOPF小鼠宏基因组的功能,定植GM15的小鼠在表型上与SPF/SOPF小鼠相似(宏观、免疫、代谢等);③ GM15模型可限制因微生物群组成波动造成的混杂影响,可提高临床前研究的可重复性和稳健性。
【主编推荐语】小鼠是最常用的哺乳动物模式生物,在肠道菌群研究中有重要地位,但目前的小鼠研究模型仍存在菌群标准化的问题。Nature Communications发表的这项研究在这方面进行了探索,建立了一种含15个菌株的小鼠肠道菌群简化模型,并对其进行了表征。这一标准化的小鼠菌群模型,或能帮助改善关于宿主-微生物互作和微生物-微生物互作的临床前研究的可重复性。(@mildbreeze)
A standardized gnotobiotic mouse model harboring a minimal 15-member mouse gut microbiota recapitulates SOPF/SPF phenotypes
2021-11-18, doi:10.1038/s41467-021-26963-9

苏州大学:粪菌移植或可用于治疗自身免疫性肝炎

Frontiers in Immunology [IF:7.561]
① 自身免疫性肝炎(AIH)患者血清中肝酶、免疫球蛋白和脂多糖水平显著高于非酒精性脂肪肝患者和健康者,表现出高γ-球蛋白血症和较为严重的肠道菌群失调;② 抗生素致AIH模型小鼠(EAH小鼠)肠道菌群失调可加重肝损伤,并破坏滤泡调节性T细胞(TFR)和滤泡辅助性T细胞(TFH)的平衡;③ 使用健康小鼠的粪菌移植(FMT)可减轻EAH小鼠的肝损伤、高γ-球蛋白血症、细菌移位,并改善TFR/TFH平衡;④ FMT可恢复抗生素诱导的EAH小鼠的肠道菌群失调。
【主编推荐语】自身免疫性肝炎(AIH)一种自身免疫反应介导的慢性进行性肝脏炎症性疾病。遗传易感性与环境因素导致肝脏免疫稳态的破坏,滤泡调节性T细胞(TFR)和滤泡辅助性T细胞(TFH)细胞之间的失调可能导致自身抗体的过度产生和免疫稳态的破坏,从而导致AIH的免疫病理过程。最近的研究发现,维持肝脏免疫稳态的防御机制主要依赖于肠道菌群及其代谢副产物,它们共同构成外源抗原库。因此,重塑宿主和肠道微生物之间的内环境平衡,逆转TFR和TFH细胞之间的紊乱,将为AIH的治疗提供新的前景。苏州大学附属第三医院的陈建平和吴昌平团队发表在Frontiers in Immunology上的一项以AIH模型小鼠(EAH小鼠)为实验对象的研究中发现,使用粪菌移植(FMT)可显著改善EAH小鼠的相应症状,控制EAH小鼠的肝炎进展,表明FMT可能是治疗AIH的一种有效的方法。(@EADGBE)
Fecal Microbiota Transplantation Controls Progression of Experimental Autoimmune Hepatitis in Mice by Modulating the TFR/TFH Immune Imbalance and Intestinal Microbiota Composition
2021-11-29, doi:10.3389/fimmu.2021.728723

浙大一附院:不同剂量的益生菌对小鼠的急性肝损伤及高血氨症具有不同的保护效应

Microbiology spectrum [IF:7.171]
① 硫代乙酰胺处理后的小鼠饲喂不同剂量的唾液乳杆菌Li01:A-D组分别为10^5-10^6、10^7-10^8、10^9-10^10、10^11-10^12 CFU//mL;② A组小鼠体重降低最少,B组小鼠存活率最高;③ B组小鼠的肝损伤评分、髓过氧物酶、ALT、AST均为各组最低;④ B组小鼠肝脏的炎症因子(IL-1β、TNF-α、IL-6)及CD14表达为各组最低,血液的LPS结合蛋白水平也为各组最低;⑤ B组小鼠的肠道屏障完整性最好;⑥ 唾液乳杆菌Li01以剂量依赖性方式降低血液及肠道中的氨水平。
【主编推荐语】浙江大学医学院附属第一医院的李兰娟院士和李波作为共同通讯作者,在Microbiology spectrum上发表的一项最新研究结果,发现在硫代乙酰胺诱导的小鼠急性肝损伤及高血氨症模型中,中等剂量的唾液乳杆菌Li01对小鼠的肝损伤、炎症应答、肠道屏障性及存活率有着最好的保护作用;而最高剂量的唾液乳杆菌Li01降低血氨的作用最好。(@aluba)
Dose-Dependent Relationship between Protection of Thioacetamide-Induced Acute Liver Injury and Hyperammonemia and Concentration of Lactobacillus salivarius Li01 in Mice
2021-12-22, doi:10.1128/spectrum.01847-21
战肠炎?基因编辑!浙大团队Science子刊报突破
本期话题:IBD治疗,靶向递送系统,纳米疫苗,NAFLD,新冠肺炎,食物过敏,寄生虫感染
2022-01-04
2021年度回顾:大肠癌免疫治疗的3大进展
本期话题:结直肠癌,免疫治疗,放射性栓塞,IBD,纳米颗粒,环状RNA,USP19,缬氨酸,白血病,肝细胞癌,抗生素
2022-01-03
营养防癌研究水平如何?业界顶刊:系统综述仅1%高质量
本期话题:口腔健康,膳食蛋白质,生酮饮食,癌症,膳食补充剂,α-酮戊二酸,空气污染,燕麦,膳食脂肪,高蛋白饮食
2022-01-02
12月,最值得看的30篇肠道健康文献!
2021年12月,根据“热心肠因子”计算的30篇必读文献。
2022-01-01
肠道新焦点:追随“宏蛋白质组学学会”,探索菌群功能!
本期话题:宏蛋白质组学,肠道古菌组,大熊猫益生菌,工程酵母,胞外囊泡,腹膜黏连,禁食,PCOS
2021-12-31
菌群研究怎么搞?Nature子刊:相关→因果,5步走!
本期话题:菌群相关疾病研究,红肉,菊粉,肥胖,皮肤菌群,航天,胃癌,肠内分泌,跨上皮通道
2021-12-30
9文一览近期益生菌研究:中国团队多点开花
本期话题:益生菌,餐后血脂,癌症治疗,培菲康,抗衰老,肥胖,大肠癌,呼吸道感染,HIV
2021-12-29
9文一览:近期肠道与菌群免疫重要研究
本期话题:病毒组,自身免疫病,免疫训练,肠组织修复,微塑料,IBD,关节炎,新冠
2021-12-28
9文一览近期肿瘤研究:于君/刘尽尧/卜鹏程等纷获突破
本期话题:大肠癌,鸡乳杆菌,工程菌,罗伊氏菌素,回肠病,肌酸,结直肠息肉,Sotorasib,HER2阳性胃癌
2021-12-27
9文一览“吃与健康”:脂肪与脑/糖与胃肠被详尽综述
本期话题:膳食脂肪,膳食碳水化合物,禁食,肥胖,膳食硝酸盐,十字花科蔬菜,叶酸,转基因西红柿
2021-12-26