人类和非人灵长类动物肠道中,丁酸盐产生途径基因丰度相似

Molecular Biology and Evolution [IF:16.24]
① 通过基因靶向比对,量化野生非人灵长类动物和人类肠道宏基因组中丁酸盐产生途径基因的丰度;② 与除猕猴科的所有非人灵长类动物相比,人肠道细菌丁酸盐产生途径的多样性和相对丰度更高;③ 工业化人口与非工业化人口的丁酸产生途径丰度存在差异;④ 丁酸盐生产途径对进化的和现代人类饮食变化的这种弹性,可能标志着人类宿主-微生物相互作用的进化转变,增加了短链脂肪酸的产生;⑤ 此转变或有助于满足人类相对于非人类增加的能量需求。
【主编推荐语】在人类进化的过程中,肉食和烹饪等饮食习惯的改变导致了纤维摄入量的减少,而纤维消耗减少与肠道降解纤维的微生物类群的减少有关,特别是丁酸盐产生菌。因此,人类的饮食变化可能会影响丁酸盐产生有关的微生物基因的丰度。Molecular Biology and Evolution发表的研究,通过检索公开数据库中的基因信息,分析了四种主要的丁酸生成途径一碳水化合物降解途径(乙酰辅酶a),以及三种氨基酸降解途径(4-氨基丁酸、戊二酸和赖氨酸)在人类和非人类灵长类中及工业化和非工业化人群中的丰度。结果发现,与大多数非人灵长类动物相比,人类具有更高丰度的丁酸产生途径。此外,研究发现工业化人群和非工业化人群的丁酸盐生产途径存在差异。本结果或对饮食、肠道微生物群和人类健康之间的相互作用研究具有重要意义。(@nana)
Butyrate-production pathway abundances are similar in human and nonhuman primate gut microbiomes
2021-09-20, doi:10.1093/molbev/msab279

国内团队Lancet子刊:全自动磁控胶囊内窥镜对胃和小肠镜检效果如何?

Lancet Gastroenterology & Hepatology [IF:18.486]
① 纳入114例患者,利用全自动化磁控胶囊内窥镜(FAMCE)对胃检测的完成率为100% ;② FAMCE与常规经口胃镜检查的一致性为99.61%;③ FAMCE完成胃镜检查的平均时间为19.17 min,常规经口胃镜的平均时间为5.21 min;④ 两种方法共检出214个病变,其中193个被同时检测到;⑤ FAMCE漏诊5例,而常规经口胃镜漏诊16例;⑥ FAMCE可提供完整的小肠检查,并在50例(44%)患者中检出肠道病变;⑦ 2例(2%)患者出现不良事件,但未出现严重的不良事件,且无胶囊滞留。
【主编推荐语】磁控胶囊用于胃镜检查的临床应用尚处于早期阶段。近期,Lancet Gastroenterology & Hepatology杂志发表了来自陆军军医大学谢霞团队的研究成果,该研究的目的是评估全自动化磁控胶囊内窥镜(FAMCE)系统在胃镜和小肠检查的临床实践中的安全性和有效性。纳入114名18-80岁的受试者,受试者接受FAMCE检查胃病变,2 h后进行常规经口胃镜检查,比较胃镜检查结果。研究表明,FAMCE在胃检查和病变检出方面与传统经口胃镜具有相似的表现。FAMCE可为无法耐受传统经口胃镜的患者提供新的选择,可以自动引导带有自适应框架的磁性胶囊完成胃镜检查,无需操作员手动控制。此外,胶囊的电池寿命延长,可以一次完成对胃和小肠的检查。(@nana)
Fully automated magnetically controlled capsule endoscopy for examination of the stomach and small bowel: a prospective, feasibility, two-centre study
2021-09-20, doi:10.1016/S2468-1253(21)00274-0

Nature子刊:一种自上而下可扩展的菌群结构预测方法

Nature Computational Science [IF:N/A]
① 作者提出了一种自上而下的方法,其中要检查的子群落的数量随物种数量n线性增长,从而大大减少了实验工作;② 该方法使用来自留一法的子群落的稳态数据和数学模型来推断有效的成对相互作用并预测群落结构;③ 该方法的准确性随着n的增加而增加,使其适用于大型群落;④ 作者在计算机上建立了该方法,并针对文献中的五个物种群落和体外培养的八个物种群落对其进行了验证;⑤ 该方法为预测菌群结构提供了一种有效且可扩展的工具。
【主编推荐语】涉及多物种菌群的现代应用依赖于在特定环境中预测此类群落结构的能力,结构取决于物种之间的成对和高阶相互作用。为了解开这些相互作用,经典的自下而上的方法检查所有可能的物种子群落。由于子群落的数量随着物种数量 n 呈指数增长,因此此类方法不可扩展。为了克服这一挑战,作者开发了一种方法,该方法可以通过仅检查 2n 个子群落来预测一个拥有n个物种的群落的结构。作者将该的方法称为预测群落结构的有效成对交互(EPICS)。(@刘永鑫-中科院-宏基因组)
An efficient and scalable top-down method for predicting structures of microbial communities
2021-09-22, doi:10.1038/s43588-021-00131-x
刘好雨等Microbiome:罗伊氏黏液乳杆菌如何"益免疫"
本期话题:罗伊氏黏液乳杆菌,B细胞,丙酸,益生元,工程益生菌,肝,Akk菌,骨骼肌
2021-10-06
NEJM:溃疡性结肠炎新药临床传喜讯
本期话题:IBD治疗,ozanimod,利福昔明,肝性脑病,肠神经胶质细胞,NEC,菌群-免疫互作,疫苗,cGMP,新冠肺炎,直肠真杆菌,白塞病
2021-10-05
Cell子刊25页长综述详解:微生物组与癌症(附一图读懂)
本期话题:微生物组,粪肠球菌,卟啉单胞菌,大肠癌筛查,5-羟色胺,PKCλ/i,胆汁酸,癌症恶病质,单细胞测序,TRAIL
2021-10-04
中年人为何要加强膳食纤维?或是力量来源
本期话题:膳食纤维,骨骼肌,睡眠,糖尿病,益生菌,饮酒,Hp根除治疗,甜味剂,维生素K1,肺癌,坚果
2021-10-03
重磅综述:限食益于健康再添新证
本期话题:限时进食、药物-营养互作、鞘磷脂、鱼油、PUFA、膳食淀粉
2021-10-02
9月,最值得看的30篇肠道健康文献!
2021年9月,根据“热心肠因子”计算的30篇必读文献。
2021-10-01
今日Nature:隔日"过午不食"为何能更长寿?
本期话题:限时进食,高血压,香辛料,认知衰退,老年衰弱,糖尿病,生信
2021-09-30
两位中国院士分别突破,动物菌群研究登上Microbiome
本期话题:土壤动物,大熊猫,类黄酮,鱼,鸟类,猪,牛,遗传-菌群互作,工程菌,TMAO,NO
2021-09-29
中国团队多点开花:6文一览近期进展
本期话题:IBD,巨噬细胞,粪便滤液,新冠,肠干细胞,造血干细胞,B细胞,环境污染物
2021-09-28
中国力量:中山大学接连发表食管癌和大肠癌突破
本期话题:免疫治疗,DNA甲基化,WEE1抑制剂,KRAS/BRAF突变,DNA修复通路,Tetraspanin 6,AIM2,微生物组
2021-09-27