苏晓泉阐述菌群的β多样性:从全局比对到局部比对
热心肠小伙伴们 2021-09-03
青岛大学苏晓泉近期在mSystems发表文章,总结了作者为整合大规模菌群数据集,在整体群落水平(即“全局”)来计算相似性而开发的算法和工具,并阐述了作者对“局部比对”匹配策略的看法。

青岛大学苏晓泉近期在mSystems发表文章Elucidating the Beta-Diversity of the Microbiome: from Global Alignment to Local Alignment,总结了作者为整合大规模菌群数据集,在整体群落水平(即“全局”)来计算相似性而开发的算法和工具,并阐述了作者对“局部比对”匹配策略的看法。Beta多样性是菌群的基本特性,高效的菌群比较,不仅在“全局”层面,而且在“局部”层面,可以更精确和灵活地阐明菌群的beta多样性,从而有助于深入理解和有效利用菌群。

专家简介
苏晓泉
青岛大学计算机科学与技术学院教授
苏晓泉,男,1986年10月生,博士,教授,硕士研究生导师,青岛大学特聘教授,民盟盟员,国家留学基金公派访问学者。研究方向为生物信息学与大数据科学,已在该领域内mBio、mSystems、Bioinformatics、BMC Genomics等期刊发表学术论文20余篇,先后主持国家自然科学基金面上/青年项目、山东省自然基金重大基础项目、中科院重点部署项目子课题等,相关成果获得7项软件著作权。主持开发的“微生物组搜索引擎”(mse.ac.cn),入选“2016年中国生物医药技术十大进展”,并被新华社、科技日报、AsianScientist等国内外媒体报道评价为“A Google For Microbiome Research”。
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