iMeta:宁康等综述用于蛋白质结构预测的宏基因组定量分析
热心肠小伙伴们 2022-04-08
华中科大宁康团队近期在iMeta发表综述文章。在本研究中,作者专注于定量的分析宏基因组数据中蕴含的菌群生态和进化模式,解码这些模式与蛋白质结构的复杂关系,并研究如何有效地利用这些模式来提高蛋白质结构预测的效率和准确性。作者从生态和进化模式角度出发,解码了宏基因组数据与蛋白质结构的复杂关系,并在宏基因组数据中发现了可用于高效补充蛋白质同源序列的靶向方法。本研究在有效利用宏基因组数据搜索同源序列并预测蛋白质结构方面具有指导意义。

华中科大宁康团队近期在iMeta发表综述文章How much metagenome data is needed for protein structure prediction: The advantages of targeted approach from the ecological and evolutionary perspectives。在本研究中,作者专注于定量的分析宏基因组数据中蕴含的菌群生态和进化模式,解码这些模式与蛋白质结构的复杂关系,并研究如何有效地利用这些模式来提高蛋白质结构预测的效率和准确性。作者从生态和进化模式角度出发,解码了宏基因组数据与蛋白质结构的复杂关系,并在宏基因组数据中发现了可用于高效补充蛋白质同源序列的靶向方法。本研究在有效利用宏基因组数据搜索同源序列并预测蛋白质结构方面具有指导意义。

专家简介
宁康
华中科技大学生命科学与技术学院教授
生物信息与系统生物学系系主任
宁康,华中科技大学生命科学与技术学院教授,博士生导师,生物信息与系统生物学系系主任。2003年本科毕业于中国科学技术大学计算机科学技术专业,2008年博士毕业于新加坡国立大学生物信息学专业,2010年于美国密歇根大学完成博士后工作。2015年开始担任华中科技大学生命科学与技术学院基于生物信息与系统生物学系系主任。是“教育部分子生物物理重点实验室”、“生物信息与分子成像湖北省重点实验室”等多个省部级实验室的管理或骨干成员。在生物信息学领域从事科研工作10余年,研究重点方向为微生物组大数据的人工智能挖掘及其在健康与环境等领域的应用。目前主持国家自然科学基金项目、科技部重大研究计划课题等。已做为通讯作者在PNAS、Nature Communications、Gut、Annals of the Rheumatic Diseases、Genome Biology、Genome Medicine、Microbiome、Briefings in Bioinformatics、Bioinformatics、Nucleic Acids Research等生物学、医学和生物信息学顶级学术期刊发表学术论文100余篇,文章总引用超过6000次,H指数40(Google Scholar)。获得软件著作权6项,申请国家发明专利20余项。入选2021-2023年全球前2%顶尖科学家“年度科学影响力”(single recent year impact)榜单。担任Genomics Proteomics Bioinformatics、Microbiology Spectrum、iMeta等国际期刊编委。担任中国生物信息学学会-基因组信息学分会副主任等;担任湖北省生物信息学会秘书长等。2022年当选中国计算机协会CCF杰出会员。已作为主编出版中英文教材和专著6本,并是6届iGEM金牌团队的指导老师。
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