孙志宏团队:用超深度混合宏基因组测序,研究人类肠道菌群中低丰度物种的基因组和功能
热心肠小伙伴们 2022-02-12
内蒙古农业大学孙志宏团队近期在Gut Microbes发表研究,设计了一种 HiSeq-PacBio 混合、超深度宏基因组测序方法,研究结果表明该策略超过了人类肠道菌群中低丰度和超低丰度物种的基因组和功能表征的现有方法。该方法流程能够揭示功能宏基因组水平的更完整信息,突出了深度测序在揭示复杂菌群中存在的稀有物种的全面基因组特征和功能宏基因组潜力方面的价值。

内蒙古农业大学孙志宏团队近期在Gut Microbes发表研究Ontology-aware neural network: a general framework for pattern mining from microbiome data,设计了一种 HiSeq-PacBio 混合、超深度宏基因组测序方法,并用于从 8 名人类受试者获得的 12 份粪便样本中重建宏基因组组装基因组(MAGs),研究结果表明该策略超过了人类肠道菌群中低丰度和超低丰度物种的基因组和功能表征的现有方法。该方法流程能够揭示功能宏基因组水平的更完整信息,突出了深度测序在揭示复杂菌群中存在的稀有物种的全面基因组特征和功能宏基因组潜力方面的价值。

专家简介
孙志宏
内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教育部重点实验室副主任、研究员
内蒙古农业大学食品科学与工程学院博导
孙志宏,博士,内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教育部重点实验室副主任,研究员,博士研究生导师。国家杰青、国家优青获得者。主要从事乳酸菌生物多样性、功能基因组与肠道微生物研究,以第一/通讯作者在Nature Microbiology、Nature communications、Trends in Food Science and Technology、Gut Microbes等国际主流期刊发表SCI论文70余篇,授权发明专利20项,参编学术专著3部,参与起草5项质量安全地方标准。获教育部技术发明一等奖、内蒙古自治区科技进步奖一等奖、教育部科技进步二等奖和内蒙古自治区自然科学二等奖等科技奖励,荣获内蒙古自治区“优秀科技工作者”称号和内蒙古自治区青年创新人才奖。
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