刘星吟团队:新的鉴定和量化菌群关系变化的分析框架—PM2RA
热心肠小伙伴们 2021-05-20
南京医科大学刘星吟教授课题组在Genomics, Proteomics & Bioinformatics杂志上在线发表了文章,借鉴工业领域监测变量之间关系一致性的方法,提出了一个鉴定和量化菌群关系变化的分析框架(PM2RA),以检测和量化各种条件下菌群中的关系变化。

近期,来自南京医科大学刘星吟教授课题组在Genomics, Proteomics & Bioinformatics杂志上在线发表了文章PM2RA: A Framework for Detecting and Quantifying Relationship Alterations in Microbial Community,借鉴工业领域监测变量之间关系一致性的方法,提出了一个鉴定和量化菌群关系变化的分析框架(PM2RA),以检测和量化各种条件下菌群中的关系变化。PM2RA无需构建共现网络,可直接比较不同条件下菌群关联的变化。为了方便临床医生以及没有生信基础的科研人员使用该软件进行两种状态下菌群关系的变化分析,PM2RA提供在线分析工具及单机版软件 http://www.pm2ra-xingyinliulab.cn/。

专家简介
刘星吟
南京医科大学特聘教授,江苏省特聘教授
南京医科大学肠道微生态创新团队组长
刘星吟,教授, 博士生导师,2006年获中山大学理学博士学位,2006年8月至2010年10月,先后在美国Rochester大学从事表观遗传学以及肠道微生物研究。2010-2015 在美国爱因斯坦医学院从事自闭症关联基因的表观遗传学研究。2015年10月作为高层次引进人才受聘于南京医科大学基础医学院。2016年9月被评为南京医科大学特聘教授,2016年被评为江苏特聘医学专家,2017年被评为江苏特聘教授,2018年担任南京医科大学肠道微生态创新团队的组长。2019年兼聘生殖医学国家重点实验室PI,并担任生殖医学国家重点实验室孤独症研究中心副主任。学术兼职:江苏微生物学会理事,中国医药教育协会微生态专业委员会常务委员,中国优生科学协会医学遗传学专业委员会副主任委员,同时是Science Advance, Gut Microbes,  Acta Pharmacologica Sinica 等权威期刊的专职审稿人。团队主要致力于肠道微生物与人类疾病关联的基础和临床转化研究。近五年以第一作者或通讯作者在Cell Host & Microbe, Cell Reports, Gut Microbes 等国际权威期刊发表。
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