如何解读菌群江湖
赵方庆 2018-03-17
时长:17:37
中国科学院北京生命科学研究院的生物信息学专家赵方庆教授,他用生动的类比向我们介绍解读菌群江湖的十八般武艺,非常精彩
赵方庆
中国科学院北京生命科学研究院教授
中国肠道大会联合发起人&母婴肠道大会主席
近5年,先后主持国家自然科学基金6项(青年、面上、培育、重点和优青)、国家重点研发计划课题2项、国防科技创新特区项目、中国科学院“科技创新交叉与合作团队”项目和中科院院长特别奖基金等。近年来,围绕着“计算基因学”研究方向,建立了一系列原创性的生物信息学算法和工具,并在环形非编码RNA和微生物组领域取得重要进展。在Nature Communications、Gut、Genome Biology、Trends in Genetics、ISME J、Current Biology和Nucleic Acids Res 等刊物上发表通讯作者论文30余篇,平均影响因子超过10;研究论文总引用次数超过4200次(H-index 34),其中多篇入选ESI高被引论文;
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由G30资助
本演讲由G30企业提供资助,并受到民福社会福利基金会的大力支持和协助。
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图文实录

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“肠·道”演讲视频继续如约而至,今天的分享者是一位优秀的基础研究者——来自中国科学院北京生命科学研究院的生物信息学专家赵方庆教授,他用生动的类比向我们介绍解读菌群江湖的十八般武艺,非常精彩,请点击观看:



1080P 蓝光版请访问 http://v.qq.com/x/page/v0628z7i3e2.html 观看和下载。


我们大部分人可能都已经知道了肠道等身体部位的菌群与健康和疾病息息相关,但或许会是第一次通过赵方庆老师的演讲了解揭秘菌群江湖的那些高深技术。当然,赵老师用了通俗的类比,让你可以很好地去理解它们。


这是很酷的技术讲解,一定值得你多听几遍,你会真真切切地感觉自己在涨知识的!


赵方庆教授演讲内容简介

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在我跟赵方庆教授讨论演讲主题和内容的时候,他说技术背景很强的科普不好讲,他会用很多时间来准备。后来几次沟通,我都可以感觉到他一直在思考和改进,一直在努力把这次科普演讲变得更生动更完美。


最终的演绎很酷,让我惊喜!


这个爱看武侠小说的少壮派学者成功地用武侠里的江湖类比了菌群江湖,他作为一位“菌群百晓生”,向“肠·道”演讲的观众深入浅出地介绍了揭开江湖秘密的十八般武艺。


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一开场,赵老师就提出菌群的分类可类比为江湖的门派划分,菌群里的功能基因像是江湖人士所用的兵器,而菌群之间复杂的共生、竞争和拮抗似乎像是江湖中的拉帮结派、勾心斗角,这很抓人眼球也令人惊喜!


随后,赵老师举出了《天龙八部》里博闻强记精通各门派武功招数的王语嫣,认为菌群科学家的重要技能是需要像王语嫣那样,通过一个招数(标记基因)就可以推导下一个招数(基因功能以及对健康的影响)。


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“王语嫣们”在认知菌群的过程中,已经通过16S 等测序技术积累了相当多的菌群与疾病和健康的相关性(关联关系),但更为根本的是需要找到其中的因果关系,需要确定特定的菌株、功能基因是如何影响疾病和健康的。


赵老师结合自己和团队的科研成果,向观众们细致介绍了通过单细胞测序、共丰度网络重建、随机测序+单细胞测序等获取肠道细菌的精细基因图谱的巧妙方法。


菌群江湖极度复杂,揭开它们的秘密极其不容易,但像赵方庆教授这样的江湖大侠们逢山开路,遇河搭桥,见招拆招,硬是闯出一番天地!壮哉!


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有了更为精细的基因图谱,下一步“王语嫣们”需要知道菌群江湖中的不同门派是如何合纵连横的,细菌与细菌之间、细菌与人体之间、细菌与营养之间、细菌与噬菌体之间,都有着盘综错节的关系,而生物信息学家的工作就是能定性和定量地把这些关系挖出来。


挖出江湖关系以后,就可能利用这些关系来造福人类。赵老师举了一个例子,那就是可以利用生物信息学工具,准确地确定特定细菌的噬菌体,利用噬菌体,可能能够治疗一些常规药物完全无法应对的病原菌,这可以治病,更可以救人性命。


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以往,我们的关注点主要在人自身的基因上(居庙堂之高),而忽略了微生物组的存在和它们的重大作用。现在,越来越多科学研究证明了菌群对疾病和健康的基础性作用,我们越发不能忽视此“江湖之远”。


赵老师认为,我们仍然是任重而道远,但他也相信,基础研究的成果和临床的结合,可以极大促进这一过程的转化。


这真是非常精彩的科普演讲,可能中间确实有一些专业名词你不懂,但如果你关注菌群的研究和应用,我强烈推荐你好好看看,好好弄懂它们!



赵方庆教授演讲幻灯


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(分享结束)

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