Gilbert Jack
文章数:13篇
鼠李糖乳杆菌
ISME:水解蛋白配方奶粉+LGG,抗食物过敏
适度水解酪蛋白配方奶粉加入LGG益生菌可改善婴儿牛奶过敏:① 分析健康和过敏婴儿摄入奶粉前后粪菌;② 过敏婴儿菌群以毛螺旋菌和瘤胃菌为主;③ 奶粉摄入后,Blautia,罗氏菌,粪球菌显著增加,但颤螺菌在已耐受和依旧过敏婴儿中有显著不同;④ 配方奶粉通过肠道菌群改善婴儿过敏。
鼠李糖乳杆菌
酪蛋白水解物
牛奶过敏
尸体分解
Science:我们死后,被哪些细菌分解?
① 分析在不同土壤基质上,小鼠及人类尸体分解过程中的微生物聚集;② 一群参与氮循环的细菌及真菌群体,一个可再生的分解者网络在可预知的不同时间点会出现;③ 分解者主要来源于非根际土壤;关键分解者在土壤中无处不在但丰度较低;④ 土壤类型不是参与分解的微生物群体发展的主要影响因素;⑤ 不同土壤中貌似专门存储有相似的用于分解尸体的“微生物库”,使得最终分解尸体的微生物种类趋同。
尸体分解
微生物群
法医
死亡时间
刑事案件
建筑环境
TI:研究居住环境里的微生物,需要普通人参与
① 城市化的兴起和室内活动的增加,对人类与菌群的相互联系产生了前所未有的影响;② 本文讨论这些生活方式可能会如何影响免疫发育和功能;③ 讨论是否可以寻求改变室内环境的方法,以暴露于种类更为丰富的微生物之中;④ 一个非常重要的步骤是持续的鼓励城市居民参与进来,以确定我们与自身栖息的不同微生物环境的相互作用。
建筑环境
环境微生物
实验可重复性
Nature子刊:如何促进宏基因组研究的可重复性?(2012)
① 由于可以发现新的酶和新的物种并作为与疾病相关的生物标记物,宏基因组学曾被业界寄予厚望;② 在过去的两年中,测序技术和生物信息的发展使系统性地研究微生物多样性和功能成为可能;③ 为了实现这一目标,世界科学界需要通力合作,建立统一的数据标准,使全球微生物组研究具有可比性;④ 增加数据可比性可以帮助生物技术研发进程,例如新的糖苷水解酶或新能源的发现。
实验可重复性
比较宏基因组
Cell:脆弱拟杆菌或可作为治疗神经发育障碍的益生菌
① Hsaio等人在Cell上发表的一项研究中,将小鼠模型的自闭症谱系障碍(ASD)与肠道菌群相联系;② 菌群及相关代谢产物的组成及结构改变驱动了ASD的症状;③ 脆弱拟杆菌(一种人肠道中的共生细菌)可作为益生菌,修复肠道通透性,改变菌群组成,并缓解ASD相关症状;④ 益生菌可能为未来治疗神经发育障碍提供了新的策略,抗生素、益生元等其它调节菌群的方法也值得尝试。
Science:室内环境中的菌群主要来自于居住者
① 选取7个家庭,评估家庭成员的体内菌群及每个家庭住所的室内环境菌群,其中3个家庭在实验期间搬家;② 在不同家庭之间,菌群群落具有显著差异,可根据家庭辨别出不同住所的菌群;③ 网络分析鉴定出人类是主要的细菌携带者,利用贝叶斯方法可显著匹配每个个体与其居住环境;④ 厨房柜台上的潜在人体致病菌的基因组草图可与居住者手上的菌群相匹配;⑤ 搬家后,新住所的菌群群落很快就变得与家庭成员的菌群相似。
国家微生物组计划
ACS Nano:美国国家微生物组计划的技术路线图
NMI技术路线图:①对象:地球/海洋/大气/人/动物微生物,微生态,生物膜,单/双/三物种生物膜合作/竞争;②技术:高通量测序,纳米科学/技术,合成生物学,基础和应用结合,单细胞基因组,蛋白和代谢组,蛋白活性分析,多组学,多尺度影像及功能,成像,蛋白标记,模式生物,多学科协同,新显微镜,样品准备/多模成像,测量输出/取样容积;实时成像/传感,精确操纵菌群,观测站;③ 其他:大数据/聪明数据、建模与仿真、伦理。
国家微生物组计划
技术路线图
方法学
纳米科学
纳米技术
生物钟
Cell子刊:肠道菌群及高脂饮食影响生物钟功能和代谢
① 饮食及宿主因素导致肠道菌群组成及功能的昼夜变化; ② 高脂饮食打乱了肠道菌群组成结构及功能的正常昼夜变化模式; ③ 肠道菌群代谢产物的周期性变化与宿主的生理节律及代谢相关; ④ 打乱宿主-肠道菌群之间的生物钟网络可能促进饮食诱导的肥胖。
生物钟
昼夜节律
饮食
肥胖
土壤菌群
ISME:中国东部,从南到北的土壤微生物有何特点?
①采集中国东部从海南到黑龙江110个森林土壤,对土壤细菌、古菌和真菌进行高通量测序并构建共存关系网络;②土壤微生物共存网络的拓扑特征具有明显的地带性差异,而不同微生物类群的共存关系模式也有显著差别;③中国北方土壤菌群共存关系更普遍,但相互影响强度却较南方土壤菌群更小;④古菌共存关系为随机网络,细菌和真菌共存关系则为无标度网络;⑤土壤有机质、铁、氮和 pH是影响共存关系网络的重要环境因素。
土壤菌群
共存关系模式
同现网络拓扑特性
地理分布模式
土壤微生物组
ISME:家蝇幼虫处理猪粪,为何能让抗性基因减少?
① 动物饲料添加剂中滥用的抗生素可能增加动物粪便制成的肥料中的抗生素抗性;② 利用家蝇幼虫处理猪粪是一项减少抗生素污染肥料的新技术;③ 家蝇幼虫处理猪粪6天后,158个抗生素抗性基因中有94个明显减少,而有23个明显升高;④ 猪粪菌群中拟杆菌门相对丰度减少而变形菌门相对丰度增加,抗生素抗性基因的减少与梭菌目及拟杆菌目的减少相关。
抗菌香皂
Science:要小心你家的抗菌香皂么?
① 抗菌香皂最初主要在医院使用,但上世纪90年代开始,家庭也开始使用;② 同时,在肥皂、纸巾、洗手液、砧板、洗涤剂、化妆品、牙膏、玩具和塑料中都能找到各种抗菌物质;③ 最常见的是三氯生,75%的抗菌肥皂都有它,而它也在约75%的美国人尿液样本中被检出;④ 三氯生可能促进抗生素耐药性,并对人体健康有负面作用,因此在欧盟和美国明尼苏达州,它已经被部分禁止使用;⑤ 但研究和争论还在持续,关于三氯生对微生物组的影响有相互矛盾的结果。
抗菌香皂
三氯生
阿米什人
NEJM:传统农耕+更多灰尘+微生物,儿童哮喘骤减
① 阿米什人和胡特尔人的遗传起源和生活方式相似,但前者采用传统人工耕作,后者使用工业化耕作;② 哮喘患病率有惊人差异:阿米什人家中内毒素平均水平高6.8倍,但儿童哮喘和变应性致敏发生率大幅低出4和6倍;③ 两种人群家中灰尘上的微生物组成很不一样,儿童先天免疫细胞比例、表型和功能有明显不同;④ 在实验性过敏性哮喘小鼠鼻内滴注阿米什人家中灰尘的提取物,显著抑制呼吸道高反应性和嗜酸性粒细胞增多,而MyD88和Trif缺失鼠中,这样的保护作用消失。
阿米什人
胡特尔人
传统耕作
工业化耕作
过敏性疾病
精准医学
TPS:是时候将微生物组引入精准医学了!(综述)
① 美国精准医学计划为研究者和临床专业人士的合作打下坚实基础,这将推动新一代技术的研发,帮助病人治疗和康复,增加有效预先干预的机会;② 微生物组在健康和疾病中扮演着极为重要的角色,影响内分泌、生理甚至神经系统,改变许多疾病的治疗效果,并影响药物反应和耐受性;③ 本文总结微生物组对精准健康计划的影响,并列举了一些很好的例子,说明精准微生物组健康干预如何实施;④ 简要介绍微生物组分析技术、疗法和药物监管和应用等内容。
精准医学
益生元
益生菌
抗生素
关闭

用微信扫描上面二维码,验证身份

提醒:您需要先关注微信公众号“热心肠先生”,才能验证通过!

 验证成功,3秒后跳转

已超时,请 重试