Justin Sonnenburg
文章数:5篇
空间结构
Cell子刊:利用单细胞成像“看到”肠道菌群的分布
测序等技术很难了解肠道微生物的空间结构,科学家通过免疫荧光技术和专门设计的软件对这个问题进行研究。发现:① 特定组织的单细胞成像揭示了肠道微生物的空间结构;② 膳食纤维的缺乏驱使保护黏液层变薄;③ 微生物间距的测量揭示定殖依赖于饮食;④ BacSpace软件实现了大规模定量图像的分析。
空间结构
定量成像
细菌定殖
细菌定殖对宿主蛋白组的影响随胃肠道位置不同而变化
① 分析无菌、多形拟杆菌定殖及正常状态下的小鼠的胃、空肠、回肠、盲肠及近端结肠的蛋白组学; ② 在胃肠道不同位置的蛋白组有所区别; ③ 相对于细菌定殖状态,宿主的蛋白丰度更加取决于胃肠道位置; ④ 粪便菌群组成受远端结肠菌群影响。 ⑤
细菌定殖
宿主蛋白质组
胃肠道
肠道细菌
Nature:饮食不健康,子子孙孙的肠道越来越差?
① 膳食纤维中细菌可利用的碳水化合物(MAC)对肠道菌群生态很重要; ② 低MAC饮食造成小鼠肠道菌群多样性降低,高MAC饮食可以恢复多样性; ③ 低MAC饮食造成小鼠后代肠道菌群多样性降低,且不可通过高MAC饮食恢复; ④ 粪菌移植与高MAC饮食结合可恢复后代肠道菌群多样性。
肠道细菌
多样性
膳食纤维
膳食纤维
Nature:肠道菌群到底如何调节人体的代谢?(综述)
① 通过动物模型和人身上的研究,肠道菌群与肥胖有关的机制已近浮出水面;② 越来越多研究说明肠道菌群是饮食影响宿主代谢状态的调节子;③ 目前,人类关注的焦点是:建立相关因果关系,探索个体化营养等干预疗法的前景;④ 本文介绍膳食纤维、短链脂肪酸、菌群代谢产物、炎症和饮食、干预手段等内容。
膳食纤维
短链脂肪酸
代谢产物
炎症
饮食干预
基因操作
Cell子刊:对肠道菌群进行基因操作,以应对肾病!
① 肾功能下降时,源于肠道菌群的硫酸吲哚酚(IS)在血浆积累,促进慢性肾病;② 细菌色氨酸酶将色氨酸转为吲哚,被宿主吸收和转化后产生IS;③ 拟杆菌属有广泛分布的色氨酸酶家族,体外实验中删除色氨酸酶基因可阻止吲哚产生;④ 改变色氨酸酶状态或丰度,如给定植人工群落的限菌小鼠进行适当饮食改变,以及在普通小鼠中定植色氨酸酶缺陷拟杆菌,均可降低IS水平;⑤ 这意味着可以通过靶向菌群控制宿主IS浓度,这或许是治疗肾病的可能策略。
基因操作
尿毒症
硫酸吲哚酚
肾病
色氨酸
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