C Huttenhower
文章数:14篇
一型糖尿病
Cell子刊:易感一型糖尿病婴儿的肠道菌群动态变化
33个易感一型糖尿病婴儿的肠道微生物被测定,发现:① 整个婴儿期,肠道微生物的代谢通路而不是微生物的分类是稳定的;② 高丰度种的菌株组成也是稳定;③ 微生物多样性降低发生在血清转化之后,但在T1D发作之前;④ T1D发作之前,炎症组织和通路就已经增加。
一型糖尿病
婴儿肠道微生物
CTLA-4单抗
通过对黑色素瘤病人肠道菌群的分析研究检查点阻断诱导结肠炎的风险
① 通过CTLA-4单抗阻断免疫检查点与免疫介导的结肠炎发病相关; ② 分析使用CTLA-4单抗药物治疗转移性黑色素瘤的病人结肠炎发病前后的粪便菌群; ③ 拟杆菌门增加与结肠炎抵抗相关; ④ 与多胺运输及维生素B合成相关的通路与结肠炎发病风险增加相关。
CTLA-4单抗
结肠炎
黑色素瘤
LPS
Cell:不得自身免疫病,靠儿时细菌的免疫训练?
芬兰及爱沙尼亚人易得自身免疫疾病:① 对比这两国和俄罗斯,婴儿早期肠道菌群组成不同;② Dorei等拟杆菌在前者肠道中丰度较高;③ Dorei菌的LPS抑制大肠杆菌LPS的免疫原性,且无法降低NOD小鼠一型糖尿病发病率;④ Dorei菌这样的免疫沉默型菌可能阻碍对婴儿的免疫训练。
LPS
免疫原性
自身免疫
菌群
Genome Medicine:健康菌群长啥样?
① 不同人之间肠道菌群宏基因组的差别很大; ② 列出充分的保持健康所必需的菌群的组成,是发展针对菌群的疗法的第一步; ③ 一些研究记录了健康人群菌群组成及功能多样性,及地理、饮食及生活方式等影响因素; ④ 本综述回顾了几种对“健康菌群”的定义及对“健康菌群”多样性的现有了解。
菌群
健康
微生物组学
Microbiome:人体微生物组学的未来在哪里?
① 2013年7月24日至26日在美国马里兰州的贝塞斯达召开了题为“人类微生物组学:憧憬未来”的学术会议;② 会议汇集了人类微生物组研究领域的专家,旨在全面介绍微生物组研究的现行状态,但更重要的是确定并讨论这个新兴领域研究的不足,挑战和机遇;③ 本报告将总结一下专家演讲报告,并阐述了在继续推动并提供医学转化应用方面,人类微生物组该做什么样的研究。
微生物组学
子宫颈阴道微生物是女性生殖道中宿主炎症应答的主要调控者
① 乳酸菌被认为与维护女性生殖健康密切相关;② 该工作研究了146名非洲年轻女性的生殖道菌群,发现乳酸菌丰度低、菌群多样性高;③ 高度多样性的生殖道菌群与生殖道促炎细胞因子浓度密切相关;④ 转录谱分析表明,生殖道抗原呈递细胞通过Toll样受体4信号感应革兰氏阴性细菌产物,通过激活NF-κB信号通路和产生趋化因子募集淋巴细胞来促进生殖道炎症;⑤ 本研究提出了一种子宫颈阴道菌群影响生殖道感染,进而影响女性生殖健康的相关机制。
婴儿肠道菌群
STM:抗生素,到底对婴儿肠道菌群有何影响?
连续分析39个孩子0-3岁肠道菌群:① 6-18月大,大部分顺产婴儿不缺,但4个剖腹产和20%顺产儿缺拟杆菌;② 用抗生素,细菌种和株多样性都降,一些属只存单一株;③ 连续服用抗生素,期间菌群有短时变化;④ 用抗生素后抗性基因迅速现峰值,后急剧下降,一些基因在治疗结束后长期存在。
婴儿肠道菌群
抗生素
抗性基因
拟杆菌
剖腹产
健康人菌群
Science:环境-饮食-微生物-宿主关系决定者
环境-饮食-微生物-宿主关系研究突破:① 1135荷兰人,126个(31内在,12疾病,19药物,4吸烟,60饮食)因素与菌群相关;② 人菌群不同,有18.7%能用此解释,110因素与125细菌关联;③ 粪便嗜铬粒蛋白与61(占53%)菌相关;④菌多样性越大,嗜铬粒蛋白浓度越低。
健康人菌群
宿主因素
嗜铬粒蛋白
环境-饮食-微生物-宿主
IBD
Immunity:从IBD看菌群在转化医学中的潜力(综述)
经典综述,阐述菌群对IBD的影响和在转化医学中的潜力:① 炎症性肠病(IBD)是被研究得最多的慢性炎症性疾病,涉及环境、宿主基因和共生微生物等因素;② 这使得IBD成为宿主-微生物组相互作用中一个适当且高优先级的转化研究模型;③ 尽管绝大多数作用机制未明,数十年的流行病学研究已鉴定出许多环境风险因子;④ 在多个大人群样本中,IBD的遗传结构被仔细研究,并鉴定出多个相关上皮和免疫通路,但也缺乏完整的系统性解释;⑤ 肠道菌群在IBD中发生生态学和功能学意义上的失调,但对不同子类和病人个体的异质性至今仍无法解释;⑥ 因此,IBD有可能成为理解复杂炎症性疾病中人体微生物组角色的最佳模型。
IBD
炎症性肠病
转化医学
GWAS
Gut:宿主基因+肠道菌群,影响IBD发生和临床表现
① IBD患者临床表现差异明显可能与个体基因-肠道菌群互作有关;② 为验证该假设,研究人员对313位IBD患者及582位健康个体进行了病例对照分析;③ 通过对志愿者粪便16s、外周血、个体表型及基因型分析,研究人员建立了基于菌群调节基因NOD2、CARD9、ATG16L1、IRGM、FUT2的IBD风险评估体系;④ 并首次利用该体系发现健康高风险基因携带者其风险评分与Roseburia菌属的减少(失败率0.017)有关。⑤ 此外,发病部位同样影响着肠道菌群。
GWAS
IBD
宿主基因
肠道菌群
人体功能性基因组计划
Cell:肠道菌群如何调控细胞因子和免疫功能?
① 肠道菌群失调与异常免疫反应相关,通常伴随着炎症细胞因子的异常产生;② 本研究是人体功能性基因组计划(HFGP)中的一部分,探究在健康人中,肠道菌群组成及功能的差异,造成的个体间的对细菌刺激产生细胞因子响应的差异;③ 菌群-细胞因子间的联系模式是刺激源特异性、细胞因子特异性、刺激源+细胞因子特异性的;④ TNF-α与IFN-γ的产生与特异性菌群代谢通路相关:棕榈油酸代谢及色氨酸降解为色醇;
人体功能性基因组计划
功能基因组
肠道菌群
炎症因子
乳酸杆菌
Immunity:生殖道缺乳杆菌的女性更易感染HIV
① 在南非的年轻女性中,生殖道细菌群落多样性较高的女性感染HIV的几率,是生殖道菌群以卷曲乳酸杆菌为主的女性的4倍;② 在具有高危生殖道菌群的女性中,活化的粘膜CD4+ T细胞数量增加;③ 卷曲乳酸杆菌与HIV感染风险降低相关,普氏菌属、纤毛菌属及其它厌氧菌与HIV感染风险升高相关。
乳酸杆菌
子宫颈阴道菌群
HIV感染
阴道菌群
beta cells
eLife:肠道菌群的特定蛋白诱导胰腺beta细胞的扩增
① 利用无菌斑马鱼,本研究发现了在斑马鱼早期发育过程中,胰腺beta细胞群的正常发育需要肠道菌群的参与;② 一些特殊的细菌成员可以恢复正常的胰腺beta细胞数量;③ 这些细菌共同拥有一个编码BefA(beta细胞扩增因子A)的基因;④ BefA是在斑马鱼发育过程中诱导beta细胞增殖的充分条件。
beta cells
development
developmental biology
infectious disease
Microbiology
Lancet:有效预测儿童克罗恩病并发症的风险模型
① 针对新发克罗恩儿童,评估基因型、抗菌血清、回肠基因表达以及回肠、直肠和粪便菌群,建立并发症风险模型;② 风险模型的敏感性为66%,特异性为63%,阴性预测值为95%;③ 接受抗TNFα疗法的儿童更少得穿透并发症,但狭窄并发症无明显降低;④ 瘤胃球菌属与狭窄并发症有关,而韦永氏球菌属与穿透并发症有关;⑤ 回肠中控制细胞外基质产生的基因上调,并与狭窄并发症有关,纳入基因要素,风险模型的特异性提高到71%。
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