Paul W O'Toole
文章数:8篇
结肠直肠癌
Gut:到底有什么细菌与大肠癌相关?
①作者分析了59位结肠直肠癌患者、21位带有息肉的普通患者、56位健康人对照的粪便和粘膜样品。 ②结肠直肠癌患者粘膜的微生物群组成以及粘膜处的基因表达与健康人不同。 ③微生物组成及基因表达的改变不仅限于肿瘤组织,并且这些改变在与肿瘤组织距离不同的部位也不尽相同。
结肠直肠癌
粘膜微生物群
肠道菌群与老年人的饮食和健康有关
① 老年人的肠道菌群与年轻人有很大不同,且他们之间的个体差异较之年轻人也更大;② 研究了178名老年人的肠道菌群,分别为居住在社区的、进行日间门诊的、在医院进行短期康复护理的以及需要长期护理的;③ 肠道菌群的组成与老年人的虚弱、患病率、营养状况、炎症指标以及粪便的代谢物有关;④ 长期接受护理的老年人肠道菌群多样性明显少于居住在社区的,丢失的这部分菌群增加了他们的虚弱。
Diet
Gut:地中海饮食对肠道菌群和代谢组有何好处?
① 习惯性的饮食对肠道菌群组成起重要作用,同时决定菌群的代谢产物,对宿主产生影响;② 地中海饮食(MD)因为含有大量谷物、水果、蔬菜和豆类,在当前广受推崇,我们评估了153个意大利人的肠道菌群和其代谢组与他们的饮食习惯的关系,3组人习惯饮食分别为:杂食、植食和完全植食;③ 研究发现不同饮食类型人群中肠道菌群不同,且植物饮食与粪便中高短链脂肪酸水平有关;④ 少MD人有较高尿氧化三甲胺水平,高MD有助于益生菌产生好的代谢途径。
Diet
DIETARY FIBRE
ENTERIC BACTERIAL MICROFLORA
INTESTINAL BACTERIA
Short chain fatty acids
比较基因组学
利用比较基因组学研究213株乳杆菌及其相关菌属的进化和功能基因
应用高通量测序技术完成213株乳杆菌模式菌株个体基因组的重测序,以基因组注释结果为基础进行发育基因组学和功能基因组学分析。从基因组水平首次揭示了乳杆菌属不同模式菌株间的系统发育关系,并指出乳杆菌属为一个并系类群,是由从一个特定的共同祖先不断进化分化而成。
比较基因组学
乳杆菌
老年人
肠道菌群中的早衰特征
① 老年人身体的脆弱与肠道菌群的组成改变相关; ② 在较年轻的群体中分析728名女性双胞胎的粪便样本; ③ 脆弱指数(frailty index,FI)与肠道菌群的α-多样性负相关; ④ 细长针杆菌及迟缓埃格特菌丰度随FI增加而增加,柔嫩梭菌群丰度则随FI增加而降低。
老年人
肠道菌群
虚弱
衰老
Science:肠道菌群与衰老关系密切
① 肠道菌群可能参与调节衰老相关的先天免疫力、肌肉减少症和认知功能,这都影响老年人健康;② 老年人肠道菌群的多样性会消失,这不是在特定时间阈值或年龄突然发生,而是随着时间推移逐步形成;③ 根据年龄、长期家庭护理、饮食习惯和核心菌群的保留程度,可划分老年人菌群的组别;基于此,可理解它们是如何变化的,以及与临床表型有什么关系;④ 这可用于鉴定菌群与生理学衰老进程的相互作用,开发基于菌群的老年人健康监护方法等。
衰老
肠道菌群
功能基因组学
利用比较基因组学研究213株乳杆菌及其相关菌属的进化和功能基因
① 代谢多样性,不明菌种及菌种间关系使研究乳杆菌变得复杂;② 乳杆菌催化的生物转化是生物技术尚未探索的领域;③ 测定213株乳杆菌基因组及修饰糖和蛋白的基因;④ 描述乳杆菌中广泛存在可用于基因编辑的CRISPR-Cas免疫系统;⑤ 为现有菌种及新物种分类构建了完善的种系框架。
功能基因组学
乳杆菌
母乳菌群
SR:母乳里的细菌,会在婴儿粪便中出现么?
① 婴儿出生三个月内,对10对母子进行研究,在母乳中鉴定出207个属的细菌;② 变形菌和厚壁菌门,假单胞菌、葡萄球菌和链球菌属是优势细菌;③ 在第1/3/6周,12个属组成核心菌群且代表了菌群成员的81%,第12周,代表性下降到73%;④ 婴儿粪便与母乳样本中同时出现的属占婴儿粪便样本总相对丰度的70-88%,这支持了细菌从母乳转移到婴儿肠道的假说;⑤ 同一对母子中,能从母乳和婴儿粪便中分离得到完全相同的短双歧杆菌和植物乳杆菌菌株。
母乳菌群
婴儿菌群
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