张和平
文章数:13篇
比较基因组学
利用比较基因组学研究213株乳杆菌及其相关菌属的进化和功能基因
应用高通量测序技术完成213株乳杆菌模式菌株个体基因组的重测序,以基因组注释结果为基础进行发育基因组学和功能基因组学分析。从基因组水平首次揭示了乳杆菌属不同模式菌株间的系统发育关系,并指出乳杆菌属为一个并系类群,是由从一个特定的共同祖先不断进化分化而成。
比较基因组学
乳杆菌
肠道菌群
赵立平+陈卫+张和平团队:东西南北中,国人菌不同!
分析不同人群肠道菌群结构,了解共生菌如何维持宿主健康:① 对314名健康年轻人进行粪便菌群结构调查,覆盖中国不同省市地区和民族;② 九种合成短链脂肪酸的属在所有人中都被发现;③ 这九种微生物的分布根据宿主的民族、地理和生活方式仍有不同;④ 这些共有菌群是宿主健康不可或缺的成分。
肠道菌群
健康
Gut microbiota
蒙古人核心肠道菌群及季节性饮食改变的关系性研究
本研究对蒙古国乌兰巴托市,中央省和肯特省地区的64名蒙古族健康志愿者肠道菌群进行了为期一年(1月,3月,6月,9月和11月)的动态监测。本文旨在揭示蒙古族健康人肠道菌群构成及其核心肠道菌群,在此基础上结合饮食调查表,深入分析四季变换的饮食与蒙古族健康人肠道菌群的密切联系
Gut microbiota
Dietary
肠道菌群
蒙古人
季节性饮食
保加利亚乳酸杆菌
张和平+杨瑞馥团队:破解保加利亚乳杆菌的基因秘密
① 保加利亚乳酸杆菌是发酵乳制品中常用菌株; ② 基于8个保守基因分析蒙古、俄罗斯及中国西部的天然发酵制品中的298株菌株; ③ 251个确认的菌株拥有106个独特的序列类型,可被分为5个地理分布不平均的clonal complex; ④ 种群结构分析显示6个linegae。
保加利亚乳酸杆菌
基因多样性
种群结构
Gout
张和平团队:肠道菌群为预测痛风提供可靠参考
现行痛风临床诊断标准灵敏度低且滞后。①痛风患者与健康人肠道菌群构成差异显著,且缺乏F.prausnitzii并富含B.caccae和B.xylanisolvens。②编码黄嘌呤脱氢酶基因在痛风患者肠道内显著富集,而尿囊素酶却大幅减少。③痛风微生物指数模型诊断准确率高达88.9%。
Gout
Intestinal Microbiota
Shotgun Metagenomic
MIG
苜蓿青贮
内蒙古农大团队:用三代测序评估苜蓿青贮质量
① 用四种以乳酸菌为基础的添加剂处理苜蓿青贮;② 发酵过程中,添加剂有利于降低pH值和霉菌毒素,而增加有机酸;③ SMRT分析8个发酵后样本,细菌种类和丰度显著上升;④ 在原料中,巨大芽孢杆菌是起始优势物种,经过发酵后,添加剂中存在的乳酸片球菌和植物乳杆菌成为优势物种。
苜蓿青贮
苜蓿
青贮
三代测序
PacBio
功能基因组学
利用比较基因组学研究213株乳杆菌及其相关菌属的进化和功能基因
① 代谢多样性,不明菌种及菌种间关系使研究乳杆菌变得复杂;② 乳杆菌催化的生物转化是生物技术尚未探索的领域;③ 测定213株乳杆菌基因组及修饰糖和蛋白的基因;④ 描述乳杆菌中广泛存在可用于基因编辑的CRISPR-Cas免疫系统;⑤ 为现有菌种及新物种分类构建了完善的种系框架。
功能基因组学
乳杆菌
三代测序
张和平团队:利用三代测序评估婴儿配方食品安全性
① 由于婴儿对食物源性疾病的敏感性,婴儿配方食品需要严格的微生物标准;② 本研究利用PacBio单分子实时(SMRT)测序平台,对来源于30份中国国产及进口婴儿配方食品中的细菌16s rRNA全长进行分析;③ 嗜热链球菌、乳酸乳球菌及Lactococcus piscium在所有样品的细菌中占主要部分;④ 国产及进口的婴儿配方食品中细菌组成不同;⑤ 乳清蛋白氮指数与芽孢杆菌属的丰度呈负相关。
三代测序
PacBio
单分子实时测序
婴儿配方食品
食品安全
蒙古族
张和平 & 秦楠团队:蒙古族人肠道菌群的特点
① 不同人种的肠道菌群因遗传背景、饮食、文化习惯及社会经济状况的差异而不同;② 本文对110名来自蒙古国和中国的蒙古族人的肠道菌群进行shotgun宏基因组测序,并比较汉族、蒙古族及欧洲人的肠道菌群;③ 放线菌门及双歧杆菌属是三种人群肠道菌群差异的主要来源;④ 鉴定出了两种分别通过抗炎症效应及产生丁酸盐而改善蒙古族人肠道健康的细菌;⑤ Collinsella作为动脉粥样硬化患者的生物标记物,与成年蒙古族人心脑血管疾病的高死亡率相关。
蒙古族
肠道菌群
宏基因组
饮食干预
张和平团队:让爱吃肉的蒙古人多吃碳水化合物会怎样?
① 蒙古人的肠道菌群由于其以肉类及乳制品为主的饮食及独特的基因型而有着鲜明特点;② 研究用高碳水化合物饮食代替蒙古人日常的高蛋白及高脂饮食3周对蒙古人肠道菌群的影响;③ 随着饮食干预的进行,肠道细菌的丰度及多样性下降;④ 饮食干预期间,肠道菌群在门水平无显著变化,拟杆菌属等某些属的细菌的相对丰度在饮食干预后发生显著变化。
饮食干预
肠道菌群
蒙古人
碳水化合物
fecal microbiota
张和平团队:瘦肉鸡和脂肪鸡的粪便菌群显著差异
① 结合16S rRNA和全基因组测序分析鸡(LL)和脂肪鸡(FL)粪便代谢组差异;② 两品系在系统发育和功能代谢组方面存在着显著的结构性差异,FL组拟杆菌门明显减少,鉴定出14个不同丰度的属,包括一些短链脂肪酸产生和潜在的致病性种属;③ 冗余分析确定出190个关键响应OTUs,可能会解释两品系间系统发育和代谢组的结构性差异。FL组的4个聚类的同源组超过LL组样本,确定出15条差异性代谢途径;④ 数据凸显出这2种鸡品系间肠道代谢组的有趣变化。
fecal microbiota
broiler chicken
metagenomics
酸马奶
张和平团队:用单细胞扩增技术研究酸马奶细菌
① 酸马奶是一种传统的发酵乳制品,也是一个很好的分离新细菌的来源;② 本研究利用基于单细胞扩增技术的宏基因组学方法分析酸马奶中的微生物组;③ 通过分析30份稀释后的酸马奶悬浮液,鉴定出24个细菌种类;④ 除了之前报道过的酸马奶相关细菌种类外,本研究分离出了3个低丰度分类群:otakiensis乳酸杆菌, macedonicus链球菌以及torques瘤胃球菌;⑤ 酸马奶功能基因组中带有与乳糖代谢及典型风味化合物合成相关的基因。
酸马奶
单细胞扩增技术
植物乳杆菌P-8
张和平团队:喂食植物乳杆菌P-8对肉鸡菌群的影响
① 本文研究了植物乳杆菌P-8对使用了林可霉素的肉鸡的肠道菌群的影响;② 植物乳杆菌P-8显著改变了肉鸡粪便菌群的种群结构;③ 在宏基因组水平,食用了植物乳杆菌P-8组的肉鸡,功能分类为P, C, N, A的直向同源组集群更多;④ 此外,在食用了植物乳杆菌P-8的肉鸡中,与鞭毛组装、细菌趋化性、氮代谢、硫代谢、辅因子及维生素生物合成的相关基因丰度更高,与半乳糖降解、固碳作用、多糖转运系统及核糖体相关的基因则丰度更低。
植物乳杆菌P-8
林可霉素
肉鸡
粪便菌群
关闭

用微信扫描上面二维码,验证身份

提醒:您需要先关注微信公众号“热心肠先生”,才能验证通过!

 验证成功,3秒后跳转

已超时,请 重试