赵立平
文章数:27篇
全身系统方法
靶向肠道菌群并具疾病预防性的全身性系统方法
这篇2010年的文章,提出了用肠道菌群做靶器官、用元基因组学和代谢组学为手段做健康管理的思路。文中观点认为,人自身基因组与元基因组是互相紧密连接的,营养在调节肠道菌群和健康状态中起关键性作用,不平衡的饮食,让很多参与正常机体功能的微生物转变成了慢性疾病的“病原体”。
全身系统方法
系统生物学
肠道菌群
预防保健
HMP
关于我们另一个基因组的故事
这篇文章从元基因组学和参考基因组的研究进展出发,提出菌群研究要在基因组层面取得突破的思路。文章发表于metaHIT和HMP的阶段性成果发布后不久,除了再详细介绍这两个重要研究计划的突破性进展和数据,更又一次介绍了肠道菌群对人体的重要作用。
HMP
metaHIT
肠道菌群
国际微生物组计划
微生物学:创造全球微生物组研究的新成就
德国科学家Nicole Dubilier、美国科学家Margaret McFall-Ngai和上海交大赵立平教授呼吁开展国际微生物组计划(International Microbiome Initiative),以了解微生物到底怎样影响人们的健康。三位教授确信,IMI势在必行。
国际微生物组计划
IMI
高脂饮食
在终身限制能量摄入的小鼠中肠道菌群的结构性调节
这篇文章发现适度节食可以优化肠道菌群结构,减少内毒素入血,延长小鼠寿命。试验中发现,不管是给予低脂还是高脂饮食,对C57BL/6小鼠进行限制热量摄入,而不是锻炼,都能显著改变肠道菌群。在低脂饮食中,限制能量摄入增加能延长寿命的乳酸杆菌属等种系型,而减少会降低寿命的种系型。
高脂饮食
低脂饮食
寿命
肠道菌群
乳酸杆菌
葛根芩连汤
葛根芩连汤缓解2型糖尿病时的肠道菌群改变
肠道菌群(GM)在包括2型糖尿病在内的许多代谢性疾病中发挥重要作用。中医方剂葛根芩莲汤(GQD)能够缓解糖尿病病情。本文采用前瞻、双盲、随机对照试验,研究GQD是否会改变GM。结果:GM的改变早于糖尿病症状的改善;肠道有益菌增加。结论:GQD治疗糖尿病的效果与GM改变有关。
葛根芩连汤
二型糖尿病
肠道菌群
轮状病毒
通过对克隆文库数据的多元统计分析,对肠道菌群在轮状病毒感染后的结构性变化进行特征提取
这篇文章介绍2009年赵立平教授和团队在生物信息学领域的研究,他们使用多元统计模式识别技术分析短标签序列数据,可以找到与疾病有统计关联的具体细菌种类。这个方法可用于研究肠道菌群的结构在微生态环境发生变化后有什么模式性变化。
轮状病毒
偏最小二乘
拟杆菌
克隆文库
肠道菌群-新的潜在药物靶标
肠道菌作为与人类长期共存的一个“器官”,在人类健康和疾病发挥着重要的作用。通过综述宿主和肠菌在肠道疾病、糖尿病等代谢疾病以及癌症中的互作,研究人员提出了解宿主-肠菌之间的关联及互作,通过改变肠道菌调控疾病的进程的理念,即肠道菌群靶向疗法。同时还对可以操作的技术平台进行了综述。
肠道菌群
发现肠道菌群和肥胖的因果关系
肠道菌群和特殊疾病到底存在怎样的因果关联一直是学术界的重要挑战。本研究严格按照科赫法则,通过改变肠道菌群,发现改变肠道菌会影响小鼠和人类的肥胖发育表型。通过菌群关联分析、多变量统计方法和分类建模,发现肠道菌群改变与宿主反应及疾病表型的差异。
肠道菌群
肥胖
科赫法则
微生物组
靶向人基因组/微生物组的药物发现: 来自全球化系统生物学与传统中药的灵感
肠道微生物组在大多数影响人类健康的慢性疾病中起了很大的作用。越来越多的证据显示传统中药作用于人体及其共生微生物,因此可望作为潜在的新药进入西方市场。中西一体的药物研发理念将有利于开发出针对新受体的化合物以治疗慢性疾病。
微生物组
系统生物学
中医药
药物开发
黄连素
黄连素预防高脂肪餐饲养大鼠肥胖及胰岛素抵抗过程中肠道菌群的结构性变化
黄连素处理高脂肪餐(HFD)饲养大鼠,血清脂多糖结合蛋白、单核细胞趋化因子蛋白-1、瘦蛋白升高,而校正的血清脂联素下降;肠道菌群多样性明显受抑;肠道菌群结构发生改变,产短链脂肪酸的菌种增加;菌群种类的离散,与宿主的代谢表型相关。减少外源性抗原负荷、提高SCFA可减轻肠道炎症。
黄连素
脂多糖结合蛋白
单核细胞趋化因子蛋白-1
脂联素
肥胖
肥胖
肥胖患者肠道分离的机会性致病菌导致无菌小鼠肥胖
肥胖患者肠道中分离出一株产内毒素肠杆菌属细菌,使志愿者肠道细菌丰度下降,当给予全谷物、传统中餐及益生元后,体重下降,高血糖症和高血压改善;配合高脂肪餐时,诱导无菌小鼠肥胖和胰岛素抵抗;血清内毒素水平升高,炎症反应加重。人类来源的产内毒素细菌致肥胖能力,为引起宿主肥胖的部分原因。
肥胖
胰岛素抵抗
脂多糖内毒素
无菌小鼠
产毒素细菌
肠道菌群
赵立平+陈卫+张和平团队:东西南北中,国人菌不同!
分析不同人群肠道菌群结构,了解共生菌如何维持宿主健康:① 对314名健康年轻人进行粪便菌群结构调查,覆盖中国不同省市地区和民族;② 九种合成短链脂肪酸的属在所有人中都被发现;③ 这九种微生物的分布根据宿主的民族、地理和生活方式仍有不同;④ 这些共有菌群是宿主健康不可或缺的成分。
肠道菌群
健康
相关变异分析
共生的肠道微生物调节人体的代谢表型
这篇2008年的文章提出了代谢组学和元基因组学相结合解析肠道菌群里的具体种类与人体代谢关系的方法。文章研究了7个中国人的粪便和尿液样本,发现中国、美国人的肠道菌群差异;提出了功能元基因组的概念,认为关键性的种,是对代谢和健康影响最大的因素,其中,柔嫩梭菌群与尿液中八个代谢物有关。
相关变异分析
肠道菌群
代谢组学
代谢表型
宏基因组
药物开发
Nature Reviews:肠道菌群是药物新靶标(贾伟、赵立平等撰)
这是2008年发表在Nature Reviews Drug Discovery的经典文献:① 肠道菌群与人类疾病和健康密切相关,综合运用抗生素、益生菌和益生元以调节肠道微生物构成可望成为一种全新的治疗手段;② 为此,我们需要系统、全面地了解宿主/细菌之间复杂的相互作用及其与病理、生理表性之间的关联;③ 本综述陈述了靶向肠道菌群这一理念和潜在的应用前景,讨论了需要采取的策略和技术。
药物开发
靶向药物
结直肠癌
结直肠癌患者和健康志愿者肠道菌群的结构性分离
16S rRNA基因分析法、基本组分和UniFrac分析法,提示结直肠癌患者和健康志愿者肠道菌群的结构性分离。鉴定出48个OTUs。实时定量PCR确认结直肠癌患者肠道菌群中产丁酸盐细菌明显下降。产丁酸盐细菌减少及机会性致病菌增加,可能为结直肠癌患者肠道菌群结构性失衡的原因。
结直肠癌
肠道菌群
操作分类单元
慢性炎症
赵立平团队:全麦+中药+益生元,改善肠道菌群和代谢
肠道菌群代谢障碍产生内毒素引起的慢性炎症可导致肥胖相关的代谢紊乱。①全麦、传统中药及益生元组成的WTP食谱可以满足营养需要并平衡肠道菌群。②93位肥胖志愿者完成了WTP食谱的临床实验,体重明显减轻并改善了胰岛素敏感性、血脂及血压。③粪便样本分析表明产内毒素细菌减少而益生菌增加。
慢性炎症
饮食干预
肠道菌群
代谢综合症
肠道菌群
上海交大团队:益生菌或能减肥
① 研究三株候选益生菌;② 将益生菌分别喂给高脂饮食鼠,都能减少体重增加和巨噬细胞向附睾脂肪渗入,显著改善葡萄糖胰岛素稳态及肝脏脂肪变性;③ 益生菌让高脂饮食鼠肠道菌群更像对照鼠;④ 分析鉴定了因益生菌而改变、与代谢综合征正负相关的OTU;⑤ 每株益生菌的功能及差别也被初步研究。
肠道菌群
高脂肪饮食
益生菌
代谢综合征
黄连素
赵立平团队:黄连素和二甲双胍应对肥胖?
黄连素和二甲双胍通过调节肠道菌群在临床中治疗二型糖尿病:① 两种药物都可逆转高脂肪饮食引起的小鼠肠道菌群的改变;② 两种药物都可显著降低肠道菌群多样性;③ 134种与肥胖表型相关的OTU受两种药物调控;④ 60种OTU会减少而产短链脂肪酸菌株会增加。
黄连素
二型糖尿病
二甲双胍
产短链脂肪酸细菌
赵立平
肠道菌群
SR:给肥胖儿童进行饮食干预,耐药基因降低
肠道菌群是ARGs的重要储存库。① 靶向饮食干预减少肠道耐药基因组,减轻肥胖儿童代谢综合征;② 399个ARGs赋予47种抗生素耐药性;③ 饮食干预降低肠道耐药基因组丰富度和多样性;④ 干预降低含多重耐药基因的大肠杆菌等菌株;⑥ 饮食干预可成为减少肠道耐药基因组的有效方法。
肠道菌群
耐药基因组
饮食干预
抗生素抗性基因ARGs
基因组互作网络
赵立平团队:先天肥胖?不怕,用饮食纠正!
①富含不易消化糖类的饮食导致体重明显减轻、肠道菌群变化及炎症的缓解。②161种肠道菌群宏基因组分析发现产乙酸相关基因的增加。③尿液的代谢组分析表明氧化三甲胺和硫酸吲哚酚的合成显著降低。这些肠道菌群代谢物会增加炎症风险。④多组学系统分析表明了肠道菌群与遗传性及单纯性肥胖的密切关系。
基因组互作网络
肠道菌群
代谢组学
宏基因组学
肥胖
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