李兰娟
文章数:10篇
相关变异分析
共生的肠道微生物调节人体的代谢表型
这篇2008年的文章提出了代谢组学和元基因组学相结合解析肠道菌群里的具体种类与人体代谢关系的方法。文章研究了7个中国人的粪便和尿液样本,发现中国、美国人的肠道菌群差异;提出了功能元基因组的概念,认为关键性的种,是对代谢和健康影响最大的因素,其中,柔嫩梭菌群与尿液中八个代谢物有关。
相关变异分析
肠道菌群
代谢组学
代谢表型
宏基因组
H7N9病毒感染及治疗对肠道菌群的影响
①完成了26个H7N9患者肠道菌群深度测序,其中抗生素治疗组(AB)17人和非抗生素治疗组(NAB)9人,构建了H7N9患者肠道菌群基因集;②阐明了H7N9病毒入侵导致病人肠道菌群的改变;③抗病毒物质,益生菌及抗生素治疗可以提高H7N9患者肠道有益菌的微生物多样性及丰度。
Diagnostic markers
秦楠等答同行学术质疑:代偿性肝硬化和微生物组关系的解释
①测试了用微生物组分析诊断代偿性肝硬化及失代偿性肝硬化的准确性;②在原来66个MGS的基础上又发现了13个新的MGS;③微生物组分析或许可以取代当前不适当的临床诊断参数和/或肝脏活组织检查等侵入性操作来检测出代偿性肝硬化。
Diagnostic markers
Microbiology
肝硬化患者肠道菌群变化
①构建了肝硬化患者肠道菌群基因集;②找到了66个代表细菌物种的MGS,其中28个在患者组中富集,38个在健康组中富集;③首次发现肝硬化患者口腔菌侵入到肠道;④根据15个基因标记物定义了肝硬化“病人区别指数”Patient Discrimination Index(PDI)。
Microbiology
Biomarkers
Genome informatics
中国HIV感染者
SR:感染HIV的中国人,粪便菌群有何变化?
① 67名HIV-1感染者,其中32人接受高效抗逆转录病毒治疗(HAART),另有16名健康人作对照,对粪菌进行测序;② 对比健康人对照和HIV感染者,粪菌的α-多样性指数无显著不同;③ HIV感染者中:F/B比值显著增加,包括普氏菌在内的几个关键属占优,而考拉杆菌属、梭菌属XIVb、小类杆菌属、巨单胞菌属与全身性炎症细胞因子显著相关;④ 经过短时有效的HAART,HIV-1的病毒载量降低,然而粪菌的多样性和组成并没有完全恢复,失衡也依然存在。
中国HIV感染者
高效抗逆转录病毒治疗
HIV
肠道菌群多样性
肠道菌群紊乱
肠道菌群失调
SR:非酒精性脂肪肝也非肥胖的患者的肠道菌群
① 肠道菌群紊乱在肥胖及非酒精性脂肪肝中发挥重要作用;② 分析43名非酒精性脂肪肝的非肥胖患者与83名非肥胖健康人的粪便菌群组成;③ 患者的粪便菌群多样性较低,且在门水平上发生显著改变;④ 与健康人相比,患者的拟杆菌门增加20%,厚壁菌门减少24%;⑤ 患者粪便菌群中,革兰氏阴性菌更为普遍,且产短链脂肪酸的细菌显著减少。
肠道菌群失调
非酒精性脂肪肝
菌群组成
深度测序
SR:肝癌患者的舌苔菌群是怎样失调的?
① 选取35名患有肝硬化的早期肝癌患者及25名健康人,分析其舌苔菌群的16s rRNA;② 肝癌患者的舌苔菌群多样性显著上升;③ 通过主成分分析可显著区分肝癌患者及健康人的舌苔菌群;④ 可用梭形杆菌属及Oribacterium区分肝癌患者及健康人的舌苔菌群。
深度测序
肝癌
舌苔菌群
肝硬化
李兰娟团队:肝硬化病人的小肠菌群有何特征?
① 肝硬化引起的十二指肠失调的相关机制尚不明,研究通过测序分析比较了30个硬化病人和28个对照间的十二指肠粘膜菌群;② 主坐标分析揭示了硬化病人与对照组菌群显著不同,在属的水平,韦永氏球菌、巨型球菌、小类杆菌、奇异菌、普氏菌在病人肠道中量均较高;③ 宏基因组分析发现,病人与营养吸收有关基因水平升高,对照组与细菌增植有关基因水平升高;④ 病因学上,乙肝病毒引发的和原发性胆汁性肝硬化之间两个OTU有所不同。
肝硬化
十二指肠
小肠菌群
李兰娟+王薇等:不同2型糖尿病人的尿液菌群差异很大
① 收集28名单纯糖尿病(A)、24名糖尿病+高血压(B)、7名糖尿病+高血脂(C)、11名糖尿病+高血压+高血脂患者(D)的中段尿液以测序;② A组:最高丰度是乳酸杆菌属;③ B组:最高丰度是普氏菌属,变形菌门为各组之首,仅本组有鲸杆菌属,乳酸杆菌丰度明显低于A组和C组;④ C组:最高丰度是乳酸杆菌,变形菌门为各组之末,仅本组未现埃希菌和加德纳菌属;⑤ D组:最高丰度是普氏菌属;⑥ 多种细菌与患者的餐后血糖、血压和血脂相关。
Engineering:健康和疾病中的人体菌群(综述)
① 本综述特别关注人体菌群和宿主的相互作用,以全景概括在基础生物进程及感染性疾病、肝病、胃肠道癌、呼吸道疾病、精神或心理疾病和自身免疫病等主要人类疾病的发生和进展过程中微生物的作用;② 总结DNA测序、代谢组学、蛋白组学、生物信息学等重要技术进展;③ 认为研究已变得更复杂、更全面,应更多聚焦于宿主-微生物相互作用和因果作用机制,这可为理解人体菌群在疾病和健康中的作用、提供临床实践中新的治疗靶点和治疗方法铺平道路。
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