Henry Lee-Six

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Henry Lee-Six

文章数：4篇

吃太多红肉为啥促肠癌？

Cancer Discovery近期发表文章，对900个结直肠癌病人进行全外显子基因测序和流行病学分析，发现一个烷基化突变特征，且该特征与红肉消耗、远端肿瘤位置相关，并预测其靶向KRAS G12D、KRAS G13D和PIK3CA E5445K等癌症驱动突变。即食用红肉或可诱导烷基化损伤而引发CRC，烷基化突变特征可用于CRC的早期筛查。

结直肠癌烷基化突变红肉消耗

炎症性肠病

Cell：慢性炎症改变了结肠细胞的演化

慢性炎症中存在反复发生的组织损伤和修复，这可能增加细胞基因突变，与癌症风险增加相关。体细胞突变促进癌症发展，但在癌症以外的疾病中，体细胞突变的模式、负担和功能后果尚未得到广泛研究。Cell上发表的一项新研究，通过对比炎症性肠病（IBD）患者与健康人的肠隐窝全基因组测序数据，揭示了受慢性炎症所累的结肠细胞的基因突变负担和特征，以及相关的克隆结构异常，表明结肠粘膜的体细胞演化可能引发、维持或延续IBD。这些发现有助于加深对IBD等炎症性疾病的理解，为这类疾病的治疗带来新启示。

炎症性肠病体细胞演化 INFLAMMATORY BOWEL DISEASE somatic mutations mutation rate

Nature：结直肠癌变之前的体细胞突变

目前对结直肠腺瘤-癌的测序为理解连续性的体细胞遗传改变及致癌克隆扩增提供了一个较为全面的框架。然而，对于结直肠细胞以及其他组织细胞最初新生改变的理解还比较模糊，这些改变可能发生在形态正常的组织中。最新发表在Nature杂志的一项研究，从42名年龄在11-78岁参与者的正常上皮组织中分离出2035个结肠隐窝，并对其基因组测序。该发现揭示了多个突变过程的特征，其中一些是普遍存在且和连续的，而另一些只出现在某些个体的某些隐窝中或出现在生命的某个时期。在中年人中，大约1%正常结直肠隐窝中存在可能的肿瘤驱动突变，这表明腺瘤和癌是正常结直肠上皮中普遍存在的致瘤改变过程的罕见结果。与正常细胞相比，结直肠癌的突变负担明显增加。正常结直肠细胞测序为肿瘤的基因组和克隆进化提供了定量分析。

结直肠癌结直肠腺瘤基因组测序突变特征突变负担

Nature：用类器官研究大肠癌的肿瘤内异质性

类器官在癌症研究中的重要性不断凸显，本周Nature再发一篇类器官用于结直肠癌的研究。研究者培养患者肿瘤的单细胞衍生类器官，并分析这些类器官的基因突变、DNA甲基化、转录组和药物反应情况，对肿瘤内部的异质性进行研究。使用单细胞衍生的类器官可以克服单细胞层面研究中“材料不足”的困难，有广阔的研究应用前景。

类器官结直肠癌(CRC) 单细胞肿瘤内异质性 Cancer genomics