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Paul Schulze-Lefert
文章数:6篇
高通量培养
Nature子刊:中科院遗传发育所白洋组发表高通量分离培养和鉴定根系细菌的方法
原位分离培养微生物对于揭示微生物在植物生长和健康中的功能非常重要。分离培养的微生物和无菌体系相结合,将揭示根系微生物与植物生长表型之间的因果关系和互作机制,是推动根系微生物组从描述向功能研究发展的重要技术。2021年1月13日,国际权威学术期刊Nature Protocols发表了中国科学院遗传与发育生物学研究所白洋团队和德国马克斯·普朗克植物育种研究所Ruben Garrido-Oter和Paul Schulze-Lefert合作详细介绍高通量分离培养和鉴定植物根系细菌的实验流程与分析方法。
高通量培养
根系细菌
梯度稀释
双侧标签PCR扩增法
16S rRNA基因
种间互作
Cell:细菌“好朋友”帮助植物抵御真菌危害
细菌,真菌和卵菌分别产生于约 35,10 和 5 亿年前,并且在陆生植物出现 (约4.5亿年前) 之前就在土壤中共存和相互作用。Cell 上的一项研究中综合使用菌群网络分析(含3个地区中的土壤微生物群落)、菌群构建(含148种细菌、34种真菌和8种卵菌)和体外大规模互作实验(2862对互作)确定,根际细菌才是拟南芥的“好朋友”,帮助拟南芥应对真菌的危害。
种间互作
根际菌群
bacteria
Fungi
microbe-microbe interactions
根瘤菌
Cell子刊:根瘤菌的共生进化史
Cell Host and Microbe上发表的最新研究,对超过1000株根瘤菌目菌株进行了比较基因组学分析,探究了根瘤菌的共生进化史,并鉴定出了不同根瘤菌菌株之间的保守特征及差异。
根瘤菌
共生固氮
Mazen Noureddin
Veronica Wendy Setiawan
拟南芥
Cell:帮助植物生长的炭疽菌
4月的Cell,介绍植物寄生菌。
拟南芥
炭疽菌
磷
植物菌群
Nature:拟南芥的叶和根上的菌群
拟南芥,最重要的模式植物,自然成为研究植物菌群的重要模型,这是Nature上去年的一篇文章,关注植物叶和根上的菌群,很值得参考,特别是关注农业、土壤相关菌群的群友,没看过这篇文章的可以好好看看。
植物菌群
拟南芥
根系微生物组
Nature:拟南芥根系微生物组的结构
这篇文章来自德国马普 Paul Schulze-Lefert 教授 研究组2012年发表的Nature,Paul是植物免疫和微生物组方面的大牛,每年都有CNS产出。虽然文章己发表了8年,作为植物微生物组的开山之作,引用过千次。而且即使是多年前的Nature,你会发现即使现在的你,重现一篇这样的研究,也是非常有难度的,经典就是经典。
根系微生物组
拟南芥
根系定殖
根际土
珊瑚状放线菌属