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Qirong Shen
文章数:9篇
土传病害
南京农大:植物健康否?可以让土壤微生物群落记录
后基因组学时代,以NCBI为首的基因数据库中储存了大量的微生物群落测序数据,这些数据的再利用已经成为摆在当今科研人员桌面的一个有意思的课题。土传病害影响农业生产许久,并在全世界范围内对农业生产造成了巨大的影响。南京农大沈其荣与团队发表的这项研究,以镰刀菌枯萎病为主题,寻找相关微生物群落测序数据,试图通过在数据库中寻找同一主题的二代扩增子数据,整合并寻找在全球范围内的镰刀菌枯萎病相关的微生物群落特征。
土传病害
土壤菌群
根际菌群
Nature子刊:铁载体——根际能否阻断病原菌传播的关键
南京农业大学沈其荣团队的徐阳春、韦中实验室,近日在 Nature Microbiology 上发文,描绘了植物根际菌群与植物病原菌针对于铁元素尔虞我诈的江湖。我们知道三价铁就是根际微生物争夺的稀缺资源,为了获取铁,微生物会产生一种高效结合Fe3+的低分子化合物——铁载体。理论上来说,每个微生物的铁载体都是有识别码的。如果病原菌掌握了这些识别码,就可以窃取这些铁载体,这样的微生物反而成为病原菌的傀儡和帮凶。而只有产生铁载体的能力强,并且又不能被病原菌识别利用的根际微生物才能更好地保护植物健康。
根际菌群
微生物生态学
铁载体
菌株共培养
青枯病
噬菌体疗法
南京农大沈其荣、韦中等:使用复合噬菌体疗法防治番茄青枯病取得重大突破
本期日报,我们特别报道南京农业大学“微生态与根际健康实验室”在 《Nature Biotechnology 》发表的最新成果:利用复合噬菌体疗法防治番茄青枯病。 尽管噬菌体作为一种治疗手段很早就被提了出来,但是在应用上仍然处于比较初级的阶段。特别是在噬菌体疗法的安全性、特异性和诱导抗性等方面的讨论也一直在持续进行。在这样的背景下,能够以实验方法证实噬菌体疗法的可靠性、安全性显得尤为关键。在小编看来,由于这项研究使用了田间试验的设计,所以成果非常贴近实际。其主要结论之一,使用噬菌体治疗后,可以帮助根际菌群的结构向好,对于我们在肠道或者人类健康领域使用符合噬菌体疗法提供了十分积极的生态学观点指引。 消息传来,热心肠研究院第一时间联系采访了论文第一作者“90后”副教授王孝芳和通讯作者之一“85后”教授韦中两位老师,请他们讲讲如何把噬菌体疗法落到中国大地的精彩故事。
噬菌体疗法
根际菌群
根际菌群
噬菌体
青枯病
土壤菌群
Science子刊:南农沈其荣、徐阳春团队证实苗期土壤菌群微生态决定作物未来健康
沈其荣教授领衔的南京农业大学微生态与根际健康研究团队继上个月发表Nature子刊(http://mr-gut.cn/papers/read/1073890272)之后,又在Science子刊发表论文。论文研究发现,苗期土壤菌群的结构可以决定作物未来是否发病,从实践上明确了早期土壤菌群的重要功能,为未来可能开展的植物微生态调控奠定了理论基础。植株“儿童”时期的菌群决定“长大”后能否发病,这一结果在肠道菌群研究中似曾相识。
土壤菌群
根际菌群
土壤菌群
植物健康
微生态
群落组装
Nature子刊:南农沈其荣、张瑞福团队揭示多样性激发的确定性细菌装配过程限制了群落功能
由于土壤微生物的复杂性和难培养性,长期以来人类对土壤微生物的多样性及其生态功能认识不深。越来越多的证据表明,微生物α多样性可能对生态系统功能产生积极影响,但对β多样性关注较少。南京农业大学沈其荣、张瑞福团队提出“特异性”功能微生物多样性在影响土壤微生物群落装配过程和维持土壤生态系统服务功能中的重要作用,突出了专门功能在群落组装以及在生成和维持土壤生态系统功能中的潜在作用,对破译土壤微生物多样性和系统生态功能之间的关系具有重要的科学意义。
群落组装
微生物多样性
南京农业大学
沈其荣
张瑞福
根际菌群
南京农大沈其荣+韦中:土著根际菌群中的“便利关系”也为外来病原菌的入侵提供“便利”
根际菌群中存在广泛的相互作用关系,包括以互利共生为代表的“便利”型关系和以竞争为代表的“对抗”型关系。在抵御外来病原菌入侵时,充满合作的“便利”型关系难道不能兄弟同心,一致对外吗?
根际菌群
Antagonism
community ecology
facilitation
invasion resistance
土壤菌群
南京农大:植物自土壤中招募“亲兵”抵抗地上病原菌入侵
根际菌群是植物留给土壤的“遗产”。已有多个研究表明植物通过根系分泌物招募益生菌,促进自身的生长和抗病等(http://www.mr-gut.cn/home/search?query=%E6%A0%B9%E7%B3%BB%E5%88%86%E6%B3%8C%E7%89%A9)。南京农大沈其荣团队发现,叶子感染病原体也可引发了土壤对病原菌的遗留抗性,帮助下一代植物更好的抵御病原菌的入侵。
土壤菌群
根际菌群
Disease-suppressive soil
Foliar pathogen
Microbiome
益生菌
mBio:假单胞菌促进抑制植物根部病原体
抑制植物病害,特定益生菌可能能大放异彩,这个研究就发现了假单胞菌促进抑制植物根部病原体青枯雷尔氏菌。值得看看的研究哦。
益生菌
根围菌群
Weintraub A
Nord CE
噬菌体-细菌相互作用
南京农大韦中:噬菌体和细菌竞争者能够协同抑制土壤中植物病原菌的生存
这是韦中教授2016年底发表在《Evolution》杂志上的研究成果,是2019年《Nature Biotechnology》文章的重要基础之一(http://www.mr-gut.cn/papers/read/1052413408)。在这篇文章中,他们发现噬菌体和细菌竞争者共同存在的时候,病原菌在同时应对二者的作用时有点“顾此失彼”,即产生了对噬菌体抗性的病原菌,在面对细菌竞争者时更加脆弱。所以,噬菌体和拮抗菌的组合能够更好的抑制病原菌的活性。
噬菌体-细菌相互作用
根际菌群
噬菌体
青枯病
青枯菌