Melanie Schirmer

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Melanie Schirmer

文章数：9篇

Cell子刊：区分与肥胖和糖尿病相关的肠道菌群特征

Cell Host and Microbe发表的一项最新研究，在德国队列中通过对比健康瘦子与健康胖子、健康胖子与糖尿病胖子的肠道菌群，找出了与肥胖和糖尿病单独相关的菌群变化特征，发现肥胖与菌群变化显著相关，而2型糖尿病与菌群变化的关联则较弱，此外，用药和膳食补充剂也可在一定程度上解释菌群的变化。

代谢疾病肥胖 2型糖尿病肠道菌群膳食补充剂

Nature Reviews：IBD中的菌群因素（综述）

Nature Reviews Microbiology上发表的一篇综述文章，详细介绍了菌群（包括细菌、真菌、病毒）在IBD的发生发展中起到的调节作用及调节机制，并讨论了靶向菌群以治疗IBD的潜在可能。

IBD IBD IBD microbiota research Jiuna Zhang Xiaoyu Jiang

Lancet：临床指标+肠道菌群/肠道基因表达，预测小儿结肠炎治疗应答

Lancet上发表的一项队列研究结果，对约400名小儿溃疡性结肠炎患者对标准化治疗的应答进行了评估，发现可结合临床指标及生物学特征（特定肠道细菌丰度、肠道基因表达等），预测患儿对标准化治疗的应答。

精准医疗队列研究精准医疗小儿溃疡性结肠炎 Yan Yu

溃疡性结肠炎

Nature子刊：溃疡性结肠炎的基因表达特征

驱动溃疡性结肠炎的分子机制并不清楚，Nature Communications发表的一项最新研究分析了溃疡性结肠炎患者中的直肠基因表达和通路，及其与疾病程度、肠道菌群、对治疗的应答间的关联。

溃疡性结肠炎转录组肠道菌群治疗应答

儿童克罗恩病

克罗恩病患儿的回肠基因表达和菌群特征

Mucosal Immunology发表的一项研究分析了克罗恩病患儿的回肠基因表达特征和菌群组成，以及二者间的关联，发现回肠基因表达情况因诊断年龄而异：与幼龄患儿相比，大龄患儿中的炎症相关基因表达升高，而潘氏细胞α-防御素的表达降低。此外，患儿存在回肠菌群失调，且其特征不随诊断年龄发生明显改变，但特定细菌类群与特定回肠基因表达水平存在相关性。

儿童克罗恩病回肠菌群炎症肠道粘膜免疫 Sílvia F Henriques

生物信息学工具

Nature 子刊：HUMAnN2实现宏基因组和宏转录组种水平功能组成分析

HUMAnN2 可实现快速宏基因组、宏转录组的物种和功能定量，同时提供功能通路内物种组成信息。

生物信息学工具宏基因组宏转录组 Elizabeth Pennisi Elizabeth Pennisi

小儿溃疡性结肠炎

Cell子刊：肠道菌群与溃疡性结肠炎的程度和疗效相关

现有疗法对不少溃疡性结肠炎（UC）患者效果有限，Cell Host and Microbe本周发表的一项人体研究，对400多名初诊UC患儿进行追踪，发现发病时肠道菌群的组成与疾病程度和对治疗的应答存在关联，治疗过程中菌群的变化也与患儿对治疗的应答相关。虽然菌群与UC间的因果性仍待验证，该研究鉴定出的菌群标志物，应可用于为UC患者制定个性化治疗方案。

小儿溃疡性结肠炎 gut microbiome pediatric ulcerative colitis treatment-naive disease course

炎症性肠病(IBD)

Nature子刊：转录组揭示IBD患者的菌群基因表达水平复杂性

这是Nature Microbiology发表的关于利用宏转录组分析工具揭示炎症性肠病（IBD）患者的肠道菌群基因表达水平差异的研究，充分说明了要结合宏基因组与转录组，才可能真正充分揭示菌群在疾病中的作用机制。只是了解了菌群的物种和基因组成，而不分析基因转录水平的差异，可能并不能充分揭示菌群的规律。很重要的宏转录组研究，特别推荐！

炎症性肠病(IBD) 宏基因组宏转录组菌群功能 Mathias Chamaillard

炎症性肠病

Nature子刊：IBD患者的菌群差异，或更多在转录组层面

这是Nature Microbiology发表的关于炎症性肠病患者的宏转录组研究，这是首次大规模分析IBD患者的宏转录组，发现很多基因组丰度不突出的微生物，却可能因为转录组水平高而对健康或疾病起到关键性作用。这或许是会掀起2018年宏转录组研究论文高潮的开篇，我们可以期待今年看到更多相关研究。

炎症性肠病宏转录组 Xin Li Iliyan D Iliev