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Junjie Qin
文章数:9篇
胃肠道菌群
北京协和医学院:绘制不同胃肠道部位的菌群图谱
中国医学科学院北京协和医学院的魏文强团队在Microbiology spectrum发表文章,对不同胃肠道(GI)部位的菌群进行分析,发现不同GI部位都有独特的菌群特征,且这些特征与相邻位点具有重叠性。文章详细描述了胃肠道菌群图谱,为进一步的菌群研究提供了基线信息,包括病因、初步筛查、治疗、结果和保健产品。
胃肠道菌群
不同胃肠道部位
幽门螺杆菌
孕期肠道菌群
国内团队:个体异质性或影响孕期肠道菌群
广州医科大学朱春燕团队和深圳谱元科技有限公司Shenghui Li团队合作在NPJ Biofilms and Microbiomes发表文章,通过研究1497名孕妇的孕期肠道菌群,发现孕妇肠道菌群的核心菌群与年龄匹配的未怀孕妇女相似,且孕期间肠道菌群相对稳定,而宿主的基本特性(如年龄和居住状态、体重增加)和血液临床参数等个体异质性是影响妊娠期肠道微生物群的主要因素。
孕期肠道菌群
个体异质性
口腔菌群
郑树国+陈峰+覃俊杰等:短期喝饮料对儿童口腔菌群有何影响?
口腔菌群失调与口腔及系统性疾病密切相关。口腔作为连通内外的枢纽,经常受饮食和呼吸等因素的影响,口腔菌群能否在日常生活中保持短期内的稳定呢?北大口腔医院郑树国、陈峰与深圳谱元科技覃俊杰和团队近期在Protein & Cell发表研究,表明儿童的口腔菌群对于短期饮用饮料(橙汁、茶、无糖酸奶)带来的扰动具有抵抗性,而且虽然菌群组成具有明显的个体差异,但在菌群功能层面却是高度相似和稳定的。
口腔菌群
儿童
任发政+于政权等:产毒的肠道菌群,或促进肾衰竭
终末期肾病(ESRD)是慢性肾脏疾病的晚期并发症,其发生和进展与有毒代谢物的积累密切相关。动物研究表明许多尿毒症毒素来源于肠道微生物,而这些毒素通常不能通过透析有效去除。中国农业大学任发政院士和于政权教授与团队近期在Gut上发表研究,对223名ESRD患者和69名匹配的健康对照个体进行了多组学分析,揭示了患者肠道微生物组、代谢组和疾病表型组之间的密切关系,表明患者异常的肠道菌群能通过产生有害代谢产物加重临床预后,并用动物模型提供了因果性证据。这些发现提示,调节肠道菌群有望成为降低患者尿毒症毒性的靶标,应作为透析的补充疗法进行深入研究。
终末期肾病
任发政+于政权等:产毒的肠道菌群,或促进肾衰竭
终末期肾病(ESRD)是慢性肾脏疾病的晚期并发症,其发生和进展与有毒代谢物的积累密切相关。动物研究表明许多尿毒症毒素来源于肠道微生物,而这些毒素通常不能通过透析有效去除。中国农业大学任发政院士和于政权教授与团队近期在Gut上发表研究,对223名ESRD患者和69名匹配的健康对照个体进行了多组学分析,揭示了患者肠道微生物组、代谢组和疾病表型组之间的密切关系,表明患者异常的肠道菌群能通过产生有害代谢产物加重临床预后,并用动物模型提供了因果性证据。这些发现提示,调节肠道菌群有望成为降低患者尿毒症毒性的靶标,应作为透析的补充疗法进行深入研究。
终末期肾病
肠-肾轴
肠道菌群
肠道菌群功能
代谢组
二型糖尿病
Nature:二型糖尿病人的肠道菌群长啥样?(2012)
这是MetaHIT的核心成果之一,也是覃俊杰博士在2010年Nature第一作者论文之后的又一重量级研究成果,这开启了用MGWAS分析慢性疾病中肠道菌群的先河,随后大量慢病相关研究出现,包括2013年关于肥胖、2014年关于肝硬化的Nature article。
二型糖尿病
宏基因组相关研究的方法
宏基因组基因关联群组
宏基因组测序
Thomas Blank
杨瑞馥老师研究论文集
NEJM2011:杨瑞馥等,3天破解致病菌全基因组
2011年,杨瑞馥、覃俊杰等老师的经典之作。
杨瑞馥老师研究论文集
Jia Xu
Fengmei Lian
Liping Zhao
Xiaolin Tong
肠型
Nature:人类肠道微生物组有三种肠型(2011)
经典回顾,2011年,MetaHIT团队通过数据比较分析,认为有三种肠型的存在,虽然后来有很多科学家(比如参与HMP的美国科学家)对此提出质疑,但肠型这个概念,在此后5年,直到今天,还是有其影响力。
肠型
人类微生物组计划
生物标记物
Wen Ren
Zhe Xun
人肠道宏基因组
Nature:在人类肠道中鉴定出330万个微生物基因(2010)
经典回顾,这是MetaHIT抢在HMP团队之前在Nature上发出的第一个重量级阶段性研究成果,也是覃俊杰博士的成名之作,迄今被引用次数已近4000次。
人肠道宏基因组
Jacques Ravel
Jacques Ravel