Elodie Ghedin

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Elodie Ghedin

文章数：9篇

下呼吸道菌群或影响危重症新冠肺炎患者的临床结局

Nature Microbiology上发表的一项前瞻性队列研究结果，在142名需要机械通气的新冠肺炎危重症患者中发现，院内呼吸道感染与死亡结局无显著关联，而下呼吸道菌群的组成及功能、新冠病毒丰度、新冠病毒抗体应答、宿主的下呼吸道转录组特征等因素与临床结局相关。

新冠肺炎研究论文医学研究前瞻性队列研究下呼吸道菌群

转录组测序

宏转录组捕捉呼吸道菌群代谢情况

微生物产物，如短链脂肪酸（SCFAs），在下呼吸道对宿主的免疫调节有显著影响。因此，对微生物组分析的功能性方法是必要的。European Respiratory Journal近期发表的文章，使用全基因组鸟枪测序（WGS）和RNA宏转录组方法，来揭示免疫相关代谢物（如SCFAs）的微生物代谢，结果表明，宏转录组能最有效地捕捉瞬时的微生物代谢。

转录组测序呼吸道菌群微生物代谢短链脂肪酸

呼吸道菌群

流感病毒感染期间患者上呼吸道的抗生素耐药性及宿主-菌群互作

来自Microbiome上发表的一项最新研究，在37名流感病毒感染患者中，发现宿主对病毒感染的应答与呼吸道菌群的组成、功能通路及抗生素耐药基因表达相关，同时鉴定出了一些与特定抗生素耐药基因表达相关的细菌属。

呼吸道菌群 antibiotic resistance Upper respiratory tract infection Microbiome Influenza infection

丁涛：流感病毒感染及疫苗接种状态影响鼻咽菌群组成

mBio上发表的一项来自纽约大学的研究，现任中山大学中山医学院教授的丁涛博士为第一作者。该研究分析了流感病毒感染者的鼻咽菌群，发现流感病毒类型及疫苗接种状态显著影响了鼻咽菌群的组成。

鼻咽菌群鼻咽菌群横断面研究流感病毒感染

Nature子刊：菌群领域KOL探讨菌群治疗面临的挑战

Global Engage和Nature Biotechnology于2018年5月组织菌群领域KOL对人体菌群研究及转化的未来进行了深入探讨，指出了目前研究的局限性的同时，也提出了一系列具有创新性的观点，对于未来的菌群相关基础研究、临床转化、产品开发等都具有重要参考价值！

菌群研究菌群治疗访谈录人体菌群菌群治疗

呼吸道菌群

感染结核病对模式动物（猕猴）呼吸道菌群的影响

一项由国内学者丁涛博士（现为中山大学中山医学院教授）参与的研究中，分析了猕猴在感染结核分枝杆菌发病过程中呼吸道菌群的失调和结构变化过程。这是首次在猕猴这一模式动物中探索结核菌感染对肺部菌群的影响。

呼吸道菌群 16S rRNA gene cynomolgus macaque Lung and airway microbiota Microbiome

Microbiome：真菌在微生物群落稳定性中起重要作用

这是Microbiome[IF：8.496]发表的生物信息学研究，通过分析现有肺部和皮肤微生物组数据，验证了真菌在联通微生态系统中不同物种的关系中发挥重要作用，值得专业人士好好读读。

真菌微生物生态系统 Gianluca Mauria Elio Gregory Pizzutilo Andrea Sartore-Bianchi

Microbiome：猕猴感染SHIV后，肺部微生物会怎么变？

这是一项关于HIV，SHIV感染后肺部微生物组变化的研究，最近相关研究不少，给病原微生物对身体各部位微生物组研究开辟了新思路。

16s rRNA测序猕猴肺微生物猿猴免疫缺损病毒 Michael Shapira

Nature微生物：口腔菌群侵入肺部，引炎症？

口腔菌群与肺部炎症的关系研究，值得关注。

口腔菌群肺部菌群 Th17 肺炎症