基因水平转移

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基因水平转移

文章数：9篇

Cell：工业化加速了人肠道菌群中的基因转移

工业化影响了人类肠道生态系统，改变了微生物的组成和多样性。细菌基因组是否也能适应宿主种群的工业化，目前尚不清楚。Cell最新发表的文章，通过对工业化和非工业化地区的15个人群的肠道细菌进行分析，发现基因的水平转移（HGT）在近几代宿主的肠道菌群中积累，发生频率很高，而且工业化的生活方式与较高的HGT比率有关。即肠道细菌在适应宿主生活方式的基础上不断获得新的功能，较高速率的HGT可能与人类历史中工业化发展有关。

肠道细菌基因水平转移工业化 human gut microbiome Industrialization

基因水平转移

转导组学——研究基因转移的组学新技术

水平基因转移（HGT）在微生物进化中起着重要作用，但是目前尚缺乏观察微生物群落中正在进行的HGT的方法。Microbiome近期发表一种“转导组学”测序方法，通过检测病毒类颗粒中的细菌来源DNA，检测微生态样本中正在进行的基因水平转移事件。该方法可用于检测主要肠道细菌类型间的HGT事件，对研究微生态进化、耐药基因转移等均具有重要参考价值。

基因水平转移基因组测序研究论文转导组基础研究

长穗偃麦草

Science：山东农业大学团队在小麦赤霉病抗性遗传育种研究中取得重要进展

2020年4月9日，山东农业大学孔令让团队在《Science》以 “First Release”的形式发表研究长文（Research Article），成功克隆了来源于长穗偃麦草的抗赤霉病主效基因Fhb7, 揭示了其抗病分子机理和遗传机理，并成功应用于小麦育种，在小麦抗赤霉病育种中取得了重大突破。同期，《Science》也刊登了该工作的点评文章。据相关数据统计，这是我国小麦研究领域首篇Science文章，也是我国小麦重要功能基因研究首篇CNS文章。该研究团队经过20年的持续研究，首先发现小麦近缘植物长穗偃麦草7E染色体长臂末端携带抗赤霉病主效基因，并将其命名为Fhb7，随后成功将该抗病基因转移至栽培小麦品种，明确了其在小麦抗病育种中的稳定抗性和潜在的应用价值。

长穗偃麦草基因水平转移远缘杂交分子标记 DON毒素

纳米颗粒降低菌群中抗性基因的多样性和丰度

纳米科技真神奇！华东师范大学Xie Bing发现，纳米颗粒不仅可以杀菌，还能特异性的降低菌群中抗性基因的多样性和丰度。

抗性基因纳米颗粒 Antibiotic resistance genes Bacterial proliferation Ion dissolution

宏基因组分析方法

培养富集+测序可揭示肠道细菌核心及附属基因

《Microbiome》上发表的一项最新研究，报道了结合液体培养与鸟枪法测序，可研究肠道菌群中低丰度细菌的基因组，并通过此方法鉴定出了阴沟肠杆菌及大肠杆菌的耐药基因，并可推断基因水平转移可能性。该方法对于研究肠道细菌耐药性以及获得方式具有参考价值。

宏基因组分析方法 Microbiome antibiotic resistance Pangenome Metagenomics assembly comparative genomics

生物信息学工具

分析菌群基因水平转移的信息学工具

《Microbiome》近期发表的研究介绍了一种新的生物信息学分析工具——MetaCHIP，可以在不依赖于参考基因组的情况下，用于宏基因组测序数据分析，探索群落水平上的水平基因转移事件。

生物信息学工具基因水平转移 Bioinformatics HGT identification horizontal gene transfer

合成生物学

合成生物学方法研究不可培养细菌的两个实例

Nature Microbiology的一篇观点文章中，提及了两项通过合成生物学方法研究菌群中不可培养细菌的实例。

合成生物学不可培养的微生物基因水平转移 CRISPR基因编辑系统固氮酶

污水处理厂或为细菌耐药性防控重点

污水处理厂是抗菌素耐受基因积累和传播的主要场所之一。本研究通过在12座瑞士污水处理厂采样，发现耐受基因丰度和种类受菌群结构、处理过程等多种因素影响，而且存在发生耐受基因大规模转移的可能，强调了需要在耐药基因检测中考虑基因转移以及宿主致病性，值得参考。

耐药基因污水处理厂基因水平转移 Guido Rindi Guido Rindi

抗生素耐药性

结合进化生物学研究临床相关耐药质粒（综述）

耐药性质粒是临床致病菌获得抗生素耐药性的重要途径。研究耐药质粒在宿主细菌中的持留机制对预测耐药性变化、研究响应耐药性管控措施意义重大。本文作者从进化生物学角度提出了耐药质粒持留的潜在机制，并总结了一系列研究质粒-宿主细菌互作的实验方法和手段，值得专业人士关注。

抗生素耐药性耐药质粒临床菌株基因水平转移 antibiotic resistance