副溶血弧菌

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副溶血弧菌

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副溶血弧菌

扈庆华+崔玉军+杨瑞馥Nature子刊：数据驱动的食源性病原菌防控网

食源性疾病对公众健康和福祉具有重大和持久的威胁，然而，传统的食源性疾病暴发监测在面临疫情时却处于被动状态，因为其主要通过聚集性病例的通报触发，难以发现小规模、长时间或跨区域的暴发。深圳市疾控中心扈庆华携手北京微生物流行病研究所杨瑞馥和崔玉军团队与合作者在Nature Microbiology发表文章，通过整合深圳市17年来副溶血弧菌的基因组和流行病学大数据，建立了一张以“数据驱动”的监控网，以挖掘隐性疫情、可能的持久性隐藏储库、传播网络及其枢纽和源头，颠覆了散发患者和独立的点源暴发是食源性感染主要来源的传统认知，该研究不仅为副溶血弧菌的防控提供了有效模型，也为其它食源性病原监测网络的编织提供了新视角。

副溶血弧菌基因组流行病学

全基因组分析

副溶血弧菌：一种自由生活的海洋病原体的流行性克隆、海洋基因库和生态连锁失衡研究

① 副溶血性弧菌（VP）是一种自由生活的和海产品相关的海洋细菌，每年会引起世界各地成千上万的人感染；② 本研究把有性繁殖种群的分析理念和方法应用于副溶血弧菌，根据全基因组变异重建其精细种群结构，发现该物种的独特海域性基因库；③ 通过建模计算，提出“生态连锁失衡”是其主要进化推动力，并鉴定出具有与生物膜形成和六型分泌系统相关的上位相互作用区；④ 该研究为高频重组细菌进化分析提供了全新范例。

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