16S rRNA gene amplicon sequencing

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16S rRNA gene amplicon sequencing

文章数：6篇

食粪性显著影响小鼠上消化道菌群和胆汁酸谱

小鼠肠道菌群研究中非常重要的模式生物，但是小鼠与人体的实际情况仍有不小的差异。Microbiome近期发表一项研究，首次系统地分析了食粪性对小鼠消化道不同部位菌群的组成和功能的影响，发现小鼠小肠的菌群和胆汁酸谱明显受到食粪行为的影响，而非食粪小鼠的情况则与人类更为接近。这些发现提示，研究小肠菌群时，需要注意模式动物食粪性对研究结论的影响。

食粪性小肠菌群 Microbial quantification Metabolomics analyses mouse models

临床菌群研究

迈向临床菌群研究的标准化-方法比较与优化

mSystems上发表的一篇技术类文章，探讨了在采用二代测序研究微生物组时如何获得最有效、可靠的数据。

临床菌群研究方法标准化 16S rRNA gene amplicon sequencing DNA extraction Bioinformatics

免疫介导的炎性疾病

免疫介导的炎性疾病是否有共同的菌群特征？

炎症性肠病、多发性硬化和类风湿性关节炎等，均为免疫介导的炎性疾病（IMID），Microbiome近期发表的研究，用16S法分析了不同IMID以及健康人群的肠道菌群，鉴定出不同IMID之间的共同和独特的菌群特征，或能作为潜在的疾病生物标志物，也提示这些疾病可能存在共同的病因。

免疫介导的炎性疾病 16S rRNA gene amplicon sequencing bacteria Gut microbiota Immune-mediated inflammatory disease

肥胖与饮食

脂肪酸类型影响肥胖

明确的饮食-菌群互作关系有利于研究菌群对宿主的影响。本研究以雄性C57BL / 6N的SPF/无菌小鼠为模型，研究膳食脂肪对肥胖表型影响与肠道菌群的关系，发现胆汁酸配合不同类型的脂肪，很可能通过影响肠道菌群改变宿主的代谢状态，对于研究饮食干预、菌群代谢等都具有参考价值，值得专业人士关注。

肥胖与饮食膳食脂肪代谢疾病 16S rRNA gene amplicon sequencing bile acids

特发性快速眼动睡眠行为障碍

MD：帕金森症及前驱症状相关的鼻和肠道菌群

这是专门针对帕金森症患者、特发性快速眼动睡眠行为障碍患者的鼻腔和肠道菌群研究，拓展了之前研究者对帕金森症相关菌群的认知，值得特别关注。

特发性快速眼动睡眠行为障碍帕金森症鼻菌群 16S rRNA gene amplicon sequencing PD

Illumina文库制备

Microbiome：Illumina HiSeq平台的新文库制备方法

测序方法学文章，行内人的福音，特别推荐！

Illumina文库制备 16S rRNA gene amplicon sequencing Illumina library preparation ndexed PCR Mock community