宏基因组高通量测序

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宏基因组高通量测序

文章数：3篇

脑海绵状血管瘤

Nature子刊：肠道特征菌可用于海绵状血管瘤（CA）的诊断和分型

海绵状血管瘤(CA)是常见的血管异常导致脑出血的疾病，16S宏基因分析显示，非CA和CA个体肠道微生物组差异。近期一篇发表在《Nature Communications》的文章通过宏基因组鸟枪测序法详细分析了CA个体以及不同亚型的CA个体的肠道菌群差异和特征菌群变化。研究结果提示微生物组变化联合临床血浆炎症生物标志物的加权组合可以增强对疾病严重情况的评价。

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难培养细菌

利用宏基因组发现新型亚硝酸盐氧化细菌

在海洋中的贫氧区存在亚硝酸盐氧化过程，但是目前所有已知的海洋亚硝酸盐氧化细菌都是需氧菌，主要来自于硝化刺菌属。《ISME Journal》近期发表研究，利用宏基因组数据组装，在海洋低氧环境中发现了两种新型亚硝酸盐氧化细菌，其分布与亚硝酸盐氧化率分布情况吻合。该结果为探究难培养微生物的生态学分布及其功能提供了参考价值。

难培养细菌亚硝酸盐氧化细菌宏基因组高通量测序 Daniel van der Lelie Daniel van der Lelie

宏基因组高通量测序

Nature Reviews ：宏基因组技术临床运用的前现状与挑战（综述）

宏基因组高通量测序（mNGS），正迅速从科研转向临床应用，会逐渐改变疾病诊断和治疗的方式。《Nature Reviews Genetics》近期发表综述，系统性总结了目前mNGS在疾病诊和治疗中可发挥的广泛作用，尤其强调了在病原检测上的巨大作用，并指出了该技术在临床运用上面临的挑战，值得参考。

宏基因组高通量测序临床应用综述