定殖抗性

减少食物摄入是宿主对感染的常见反应。PLoS Pathogens上发表的一项最新研究，在鼠伤寒沙门氏菌感染小鼠模型中发现，感染前或感染期间的禁食可抑制沙门氏菌的肠道感染，但对全身感染无保护作用。机制上，禁食通过调节小鼠的肠道菌群以增强其定殖抗性，并降低沙门氏菌的毒力因子表达，从而抑制沙门氏菌感染诱导的肠胃炎。另外，禁食同样可诱导小鼠对其它致病菌感染的定殖抗性。

禁食研究论文基础研究啮齿动物（小鼠）定殖抗性

疟原虫感染

Science子刊：疟原虫如何帮助致病菌定殖肠道？

Science Advances上发表的一项最新研究，发现疟原虫感染可通过降低胃液酸度，以抑制胃部的抗菌防御，从而降低小鼠肠道对鼠柠檬酸杆菌的定殖抗性。

疟原虫感染定殖抗性胃酸研究论文基础研究

定殖抗性研究论文基础研究

肠道菌群可限制致病菌的定殖以保护宿主，但致病菌如何克服定殖抗性尚未明确。Cell Host and Microbe上发表的一项最新研究，发现在肠道菌群存在的情况下，小鼠肠道内的氨基酸水平较低（低于无菌小鼠），致病菌——鼠柠檬酸杆菌可通过增加氨基酸生物合成通路相关基因的表达，以避免与肠道菌群竞争氨基酸，从而增强其在小鼠肠道中的定殖。

致病菌定殖 Citrobacter rodentium colonization resistance microbiota enteric pathogen

饮食-菌群-宿主互作

食物如何影响对肠道致病菌的定殖抗性（综述）

近期研究表明食物组成可影响宿主对肠道致病菌感染的易感性。Annual Review of Microbiology上发表的一篇综述文章，详细介绍了肠道菌群与宿主产生对肠道致病菌的定殖抗性的机制，并讨论了各种食物组分如何通过直接或间接的方式影响定殖抗性，同时概述了现有的用于研究定殖抗性的小鼠模型及其存在的缺陷，最后展望了通过调控食物组分防治肠道致病菌感染的潜能。

饮食-菌群-宿主互作 Enterobacteriaceae Salmonella typhimurium Gut microbiota mouse model

菌群-免疫互作

Cell子刊：共生菌群如何帮助宿主对抗病原体感染（综述）

Molecular Cell上发表的来自Eran Elinav团队的综述文章，详细介绍了在病原体感染过程中，共生菌群如何通过多种直接或间接的方式诱导宿主的定殖抗性，以对抗病原体感染，重点总结了菌群对免疫系统的调控以抑制病原体入侵的机制。最后讨论了通过菌群移植、益生菌/益生元、饮食干预、噬菌体疗法等方式干预菌群对抗感染性疾病的潜在可能。

菌群-免疫互作 mucosal immunity microbiota infection colonization resistance

定殖抗性

Cell子刊：共生奈瑟氏菌杀伤淋病奈瑟氏菌的机制

共生奈瑟氏菌属定殖于粘膜，其生态位可能是一种通过性传播的致病菌——淋病奈瑟氏菌的感染位点。Cell Host and Microbe上发表的一项最新研究，发现共生奈瑟氏菌属可通过释放DNA以杀伤淋病奈瑟氏菌，杀伤作用依赖于DNA的甲基化修饰模式及DNA与淋病奈瑟氏菌基因组的同源重组。

定殖抗性菌群互作奈瑟氏菌属 DNA甲基化淋病奈瑟氏菌

菌群稳态

共生菌群，先到先留

《PLoS Pathogens》发表观点，提出的“创始者假说”再次强调了共生菌群建立时的定殖顺序与定殖抗性、菌群稳定的关联性。该假说对于抵御病原菌入侵、提高益生菌效果有一定的参考价值。

菌群稳态观点定殖抗性菌群稳态 Vera Peters

定殖抗性

菌群产生的短链脂肪酸有望用于清除耐药性致病菌

肠杆菌科致病菌的抗生素耐药性威胁感染治疗有效性的。本研究发现，正常肠道菌群对肠杆菌科致病菌的定殖抗性，部分来源于短链脂肪酸介导的细胞酸化作用，而重建产短链脂肪酸的菌群有助于清除肠道内的耐药肠杆菌。本文结果对研究定殖抗性的作用机制、研发抗感染疗法、控制抗生素耐药性都有借鉴价值。

定殖抗性短链脂肪酸酸化作用肠杆菌科致病菌抗生素耐药性

个性化医疗

Cell子刊：研究益生菌的定殖机制，有助于开发“个性化”菌群疗法

Cell Host and Microbe上发表的一篇评论文章，对Suez等人及Zmora等人最新在Cell上发表的两篇重磅益生菌相关研究发表了观点，作者认为应该深入研究益生菌在体内的定殖机制，有利于未来研发“个性化”的细菌疗法。

个性化医疗益生菌益生菌定殖抗性定殖

定殖抗性

定殖抗性的维持和破坏

肠道细菌间的相互作用对维持菌群稳态、防御病原菌具有重要作用。本综述总结了细菌间直接的定殖抗性机制、潜在病原菌对抗定殖抗性的的竞争策略及其利用定殖抗性的崩溃达到定植和扩增的策略。作者同时提出了真菌、原生动物和噬菌体等对细菌间互作的影响，并强调了肠道不同区段菌群结构差异对细菌互作网络的影响，值得专业人士参考。

定殖抗性病原菌入侵细菌间相互作用 Donghui Xu Rihui Wu

定殖抗性

IR：肠道共生菌如何pk致病菌？（综述）

这是系统性总结肠道共生菌抑制病原体的机制的综述，很值得精读，特别推荐！

定殖抗性 bacterial colonization resistance Gut microbiota INFLAMMATORY BOWEL DISEASE

梭状芽胞杆菌

AJT：梭状芽胞杆菌逆转幼鼠的肠道感染

这是对我们之前介绍过的一篇重要Science文章（http://www.xunludkp.com/papers/read/1096076544）的介绍，一页，但是很生动，图极简，但表达了意思，特别推荐！

梭状芽胞杆菌定殖抗性 Jisu Kang Seong-Il Lim So-Young Lee

梭状芽胞杆菌

Cell子刊：梭状芽胞杆菌——新生儿肠道的保护者

① 共生细菌为肠道提供定殖抗性，然而具体是哪些细菌发挥功能尚未明确；② 在2017年Kim等人发表在Science上的研究中，发现添加到婴儿小鼠肠道菌群中的梭状芽胞杆菌可限制致病性肠杆菌科细菌的定殖；③ 新生小鼠的菌群中缺少梭状芽胞杆菌，而去除成年小鼠菌群中的梭状芽胞杆菌，也可使小鼠对致病菌的定殖抗性缺失；④ 琥珀酸盐的存在增加了保护性梭状芽胞杆菌的定殖，前者在拟杆菌属定殖肠道时增加；⑤ 小鼠实验中的结论还需在人体中进一步验证。

梭状芽胞杆菌定殖抗性新生儿

定殖抗性

Nature子刊：人工组合10几株菌，就能让小鼠抵抗沙门氏菌

这是最近较为令人震惊的研究，人工组合生成一个最小细菌群落，就可以提供对鼠伤寒沙门氏菌的定植抗性，优化以后，可以有更强的功能。人工设计和组合菌群，会成为未来可靠的感染性疾病应对方法么？

定殖抗性基因组指导设计最小细菌群落 Saba Noor Iqbal Parwez