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Thomas D S Sutton
文章数:4篇
肠道病毒组
Cell子刊:人肠道病毒组的稳定性和无麸质饮食的影响
Cell Reports近期发表的研究聚焦人肠道病毒组,分析了其组成、动态变化、个体差异和稳定性,特别探索了无麸质饮食对肠道病毒组的影响,并对研究方法进行了探讨。
肠道病毒组
饮食干预
IBD
Cell子刊:全病毒组分析揭示IBD肠道病毒组中的“暗物质”
Cell Host and Microbe上发表的一项最新研究,对公开数据库中的病毒组序列进行重新分析,鉴定出了IBD患者的肠道病毒组的特异性变化,并发现肠道病毒组的变化反映了肠道细菌的变化。
IBD
Virome
Phageome
INFLAMMATORY BOWEL DISEASE
IBD
病毒组
病毒组分析,选对软件很关键
迄今为止最完整的病毒组组装软件评测,包含了16个宏基因组组装软件(方法),结果表明SPAdes一致性表现最好。
病毒组
Assembly
Bacteriophage
Benchmark
Comparison
实验方法
可重复的提取分析人粪便噬菌体组的实验流程
Microbiome上发表的一项最新研究,开发了一套提取人粪便中的病毒核酸,并分析噬菌体组的可重复性实验流程,简单易行且成本较低,可作为对粪便总DNA测序分析的补充。
实验方法
噬菌体组
Bacteriophage
human gut microbiome
metagenomics