纳米孔测序技术

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纳米孔测序技术

文章数：7篇

Nature子刊：超长DNA片段提取助力纳米孔测序对复杂环境单菌基因组的组装

基于二代测序让我们对复杂环境微生物群落组成和功能有了进一步的认识，然而更深层次的研究就需要从复杂环境中组装得到完整基因组，虽然三代测序准确率有待提升，但是却帮助我们将序列读长扩展到足够用的地步，可我们却还是无法从复杂环境中得到可用于三代测序的大片段DNA。因此，从复杂环境中组装完整基因组的工作，从样本提取就开始困难重重，本文提出了一整套方案，从样本提取到下游的生物信息学分析，带我们跨越障碍，组装高质量基因组。

三代测序纳米孔测序技术 DNA提取方法长片段DNA提取混合组装

可移动基因元件

长读长测序协助发掘肠道菌群中的可移动基因元件

肠道菌群基因组中的可移动基因元件对于微生物进化、菌群-宿主互作具有重要影响。《Microbiome》近期发表一项研究，运用nanopore长读长测序技术，发现人体肠道菌群基因组中的可移动基因元件数量大于公共数据库中的已有数据，并发现来自拟杆菌的质粒分布广泛，还阐述了多个聚集在可移动基因元件上的基因功能。上述结果对于研究肠道菌群进化、菌群内和菌群-宿主互作具有重要参考价值。

可移动基因元件长读长测序纳米孔测序技术人肠道菌群 Yonghui Ma

宏基因组病原检测

Nature子刊：纳米孔宏基因组测序，6小时快速诊断下呼吸道感染病原体

下呼吸道感染年导致300万人死亡且病原体类型广泛，目前基于培养的诊断需2~3天且敏感性较差。2019年7月Nature Biotechnology以《纳米孔上的临床宏基因组学》（Clinical metagenomics on a nanopore）为封面，刊登了英国东安格利亚大学Justin O'Grady博士及合作者共同发布的首个使用纳米孔技术的快速、经济的宏基因组测序方法，直接从患者呼吸道样本中准确快速地识别细菌病原体，并在6小时内准确检测抗性基因的突破性研究。

宏基因组病原检测纳米孔测序技术 Tianshu Han Ying Li Changhao Sun

纳米孔测序技术

NanoARG:一个用于检测纳米孔测序宏基因组数据中细菌耐药基因的在线平台

NanoARG中的Nano代表着这是一款专门为纳米孔测序结果开发或优化的抗性基因分析软件。

纳米孔测序技术 antibiotic resistance metagenomics Metal resistance Mobile genetic elements

纳米孔测序技术

吴昕：纳米孔长读长-告别微生物组研究中的盲点

希望组首席技术组技术官兼武汉未来组首席执行官吴昕博士发表题为《纳米孔长读长：告别微生物组研究中的盲点》的报告，介绍了利用Nanopore长读长测序技术发现肠道菌群测序研究中的盲点。

纳米孔测序技术 Ajay Goel Huanlong Qin Yanlei Ma Cheng Kong

纳米孔测序技术

Science：使用纳米孔测序平台实现拉沙热病毒的移动检测

拉沙热是西非特有的一种出血性病毒性疾病。虽然每年仅报告一小部分病例，但住院患者死亡率可高达15％。2018年，尼日利亚的病例增加了10倍，这表明爆发了初期疫情。为了揭示疫情爆发的原因，研究人员对120名患者的样本进行宏基因组纳米孔测序，结果显示没有新的致病株出现，也排除了人与人之间的传播的可能性，同时发现啮齿动物是主要传染源。为了防控这种疾病，我们未来需要了解是什么触发了啮齿动物对人类居住环境的破坏。

纳米孔测序技术宏基因组测序传染病人畜共通传染疾病

纳米孔测序技术

PeerJ：利用Nanopore测序，潜力渐渐显露

充分介绍Oxford Nanopore公司相关技术和产品的文章，希望了解三代测序的人，可以好好读一读。

纳米孔测序技术 Nathan Vannier Nathan Vannier