菌群生态学

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菌群生态学

文章数：4篇

戴磊团队：解析膳食纤维干预下肠道微生物组的生态应答

膳食纤维对人体健康有着深远的影响，摄入较高水平的膳食纤维可降低肥胖、炎症性肠病、结直肠癌等多种疾病的风险。多项研究发现，膳食纤维对肠道菌群组成和代谢功能的影响存在个体差异。每个人对膳食纤维的反应取决于他们的基线肠道菌群，但在纤维摄入过程中驱动微生物群重塑的生态学仍不清楚。近日，中国科学院深圳先进技术研究院合成微生物组学研究中心戴磊团队在ISME Journal上发表最新研究，通过广义Lotka-Volterra（gLV）模型为框架，解析膳食纤维干预下肠道菌群应答的生态学机制，发现某些细菌在菊粉作用下显著增加，其基线丰度和种间竞争解释了微生物群落密度和组成动态的基线依赖性，并揭示了微生物生态网络对于理解与预测肠道菌群应答的重要性。总之，该研究为未来系统理解肠道菌群的生态学规律以及开发相应的精准营养调控手段奠定了重要基础。

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Nature子刊：分析细菌重组率的新方法

细菌重组与进化，与抗生素耐药性和致病因素的获得及传播有关。本研究开发了一种新的数据分析平台，可利用全基因组数据和宏基因组鸟枪法测序数据，分析细菌重组情况，适用微生物生态学、进化和流行病学领域，值得参考。

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菌群生态学

Nature子刊：研究菌群功能的新方法

在自然条件下定量分析复杂菌群中不同细菌种系的生态功能是研究的难点。本研究采集了753个天然淡水微生物群落，在同一条件下培养，通过分析物种丰度和生态功能之间的相关性、不同细菌种系互作对特定生态功能的影响，发现菌群功能与菌群种系丰度存在复杂的关联性，且一定程度上推翻了菌群功能冗余这一假说，对于研究菌群互作、菌群功能等具有参考价值，值得专业人士参考。

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FI：共生菌群是对抗感染性疾病的重要力量（综述）

这是Frontiers in Immunology[IF：6.429]发表的关于共生菌群如何帮助宿主应对病原体防止感染性疾病的重要综述，系统性阐述了“保护性菌群”的概念。干货很多，值得精读。

定殖抵抗菌群生态学