原生生物

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文章数：7篇

Cell：揭秘肠道中的隐藏角色——原生生物

肠道微生物中包括原生生物，但这类微生物对肠道环境的影响尚有很多未知。Cell最新发表的研究，揭示了共生原生生物在肠道微生物群中的多样性和代谢差异，表明它们通过不同的代谢作用影响肠道免疫和与细菌的跨界竞争，并提出膳食干预或能调节它们对肠道健康的影响。

肠道菌群原生生物饮食-菌群互作菌群内互作菌群-免疫互作

共生功能体

阻断扩增子测序中宿主和非靶点的简易方法

本文介绍了“阻断寡核苷酸”，这是一种低成本、灵活的方法，使用标准寡核苷酸来阻断不同非靶标的扩增，并使用软件来辅助其设计。通过使扩增子测序更具针对性，这种方法有可能使各种研究系统中的问题更加容易处理，从而导致对微生物发现的更深入的、基于系统的见解。为了在其他研究系统中快速简便地设计出用于阻断任何非靶标DNA的寡核苷酸的方法，本研究还开发了一个公开可用的R软件包以供使用。

共生功能体菌群扩增子测序菌群多样性非目标扩增

EukDetect：基于宏基因组测序准确灵敏地检测真核微生物

在包括宿主相关菌群在内的自然微生物系统中，真核微生物会随着细菌和古细菌一起被发现。尽管真核微生物对这些群落至关重要，但使用鸟枪法测序技术研究它们仍具有挑战性，因此经常被排除在外。本文介绍了EukDetect，一种生物信息学方法，可在鸟枪法宏基因组测序数据中识别真核生物。EukDetect具有广泛的真核微生物分类学范围，在低丰度和近缘种上表现良好，并且对真核生物基因组中的细菌污染具有抵抗力。EukDetect提供了一种自动可靠的方法来表征来自各种菌群的鸟枪测序数据集中的真核生物。作者证明了它使使用标准鸟枪测序分析时会被假阳性所遗漏或掩盖的发现成为可能。EukDetect将极大地促进我们对真核微生物如何贡献于菌群的理解。

真菌原生生物藻类线虫节肢动物

非人灵长类动物

野生非人灵长类动物的肠道真核生物组成

ISME Journal上发表的一项最新研究，对16种野生非人灵长类动物的肠道真核生物（包括真菌、原生生物及线虫）的多样性及组成进行了对比分析。

非人灵长类动物非人灵长类动物原生生物线虫

FM：工程化改造瘤胃代谢途径

这是上个月Frontiers in Microbiology[IF：4.076]发表的一篇社论，对工程瘤胃代谢途径的现状进行了分析介绍，并对未来发展方向进行了展望，推荐专业人士参考。

原生生物反刍动物瘤胃代谢瘤胃菌群

TM：真核微生物组对珊瑚礁的重大意义（综述）

国外团队对海洋特别是珊瑚礁相关微生物组的研究一直都格外重视，这篇综述又特别关注于此，系统性总结了珊瑚礁相关真核微生物组的研究进展，很值得一读，特别推荐。

珊瑚礁真核微生物真菌微藻原生生物

EM：原生生物影响植物叶菌群的组成与功能

这是关于尾滴虫（一种原生生物）如何影响植物叶相关菌群的研究，推荐关注植物菌群的专业人士阅读。

尾滴虫叶相关菌群原生生物 bacteria functional diversity