Frontiers in Microbiology

麦麸益生元 Stephanie E Ander Carolyn B Coyne

这是Frontiers in Microbiology[IF：4.076]近期发表的研究，对4500名军人的分析表明，寄生虫相关肠道感染，尤其是感染结肠小袋绦虫，可增加后续慢性胃肠疾病的风险，该结论的临床指导意义以及是否适用于其他人群还需更多研究，推荐专业人士关注。

慢性胃肠疾病传染性胃肠炎寄生虫军人 Brooke C Wilson

梅花鹿

FM：新生梅花鹿的小肠菌群及代谢组发育

这是近期发表的由吉林特种经济动物分子生物学国家重点实验室团队主导的研究，分析了梅花鹿从出生到断奶期间小肠内菌群和代谢物的变化情况，是难得的关于小肠菌群的研究，推荐阅读！

梅花鹿 Anjelique F Schulfer Joao B Xavier Martin J Blaser

鼠李糖乳杆菌GG

FM：LGG在仔猪中抑制沙门氏菌感染并抑制自噬

这是中国农业大学兽医学院团队在Frontiers in Microbiology[IF：4.076]上发表的关于鼠李糖乳杆菌GG株对仔猪中的“婴儿沙门氏菌”感染和细胞自噬的抑制作用的研究，很值得关注动物和人上的益生菌研究的专业人士都看看。

鼠李糖乳杆菌GG 猪自噬 Alexander Keller Alexander Keller

自身免疫性关节炎

FM：菌群在自身免疫性关节炎中的作用（综述）

这是 Frontiers in Microbiology[IF：4.076]发表的关于菌群如何参与自身免疫性关节炎的综述，系统性总结了相关研究，干货不少，值得好好看看。

自身免疫性关节炎类风湿关节炎脊柱关节炎

大肠癌

FM：大肠癌患者的口腔、粪便和癌组织中菌群的初步分析

这是Frontiers in Microbiology[IF：4.076]发表的针对大肠癌患者的小样本规模研究，分析了患者的口腔、粪便和癌组织中的菌群，值得专业人士看看。

大肠癌具核梭杆菌

猪

FM：粪菌移植可改善新生仔猪的肠道健康

这是浙江大学动物科学学院团队做的一项很有意义的研究，发现将健康成年金华猪的粪菌移植给多品种猪杂交后的仔猪，可改善仔猪的肠道菌群，降低疾病风险，增加体重。这是很有意义的探索性研究，或许我们可以期待标准化的粪菌移植或者组合微生态产品用于养猪行业，降低抗生素的使用。

猪仔猪粪菌移植 Teminioluwa A Ajayi Katherine S Garman

白蚁

FM：白蚁肠道菌群可降解木质纤维素

这是Frontiers in Microbiology[IF：4.076]发表的在体外生物反应器中研究白蚁菌群对木质纤维素的转化效果的研究，值得专业人士关注。

白蚁木质纤维素 M Body-Malapel C Vignal

绿脓杆菌

FM：多重耐药性绿脓杆菌引起小鼠肠道及系统性免疫反应

这是 Frontiers in Microbiology[IF：4.076]发表的关于多重耐药性绿脓杆菌如何激起小鼠肠道及全身系统性免疫反应的机制研究，值得专业人士特别关注。

绿脓杆菌免疫反应 Martin Haupt-Jorgensen Martin Haupt-Jorgensen

数学模型

FM：可预测婴儿肠道菌群代谢互作的数学模型

这是一项针对肠道菌群的数学建模研究，针对婴儿菌群的代谢互作建立了专门的模型系统。值得生物信息学、人工智能、数学算法等相关专业领域人士参考学习。

数学模型代谢互作低聚果糖 Franciele Dietrich-Zagonel Franciele Dietrich-Zagonel

蚕豆

FM：蚕豆中分离的乳酸菌的功能特征

这是Frontiers in Microbiology[IF：4.076]发表的关于在蚕豆中分离的乳酸菌的特性研究，值得专业人士特别关注。

蚕豆乳酸菌 Stefania Marzocco Biagio Di Iorio

呼吸道真菌

FM：慢性呼吸道炎症中的真菌菌群

这是Frontiers in Microbiology[IF：4.076]发表的系统性介绍真菌（包括来源于呼吸道自身及肠道的真菌）与慢性呼吸道炎症的相关性的系统性总结文章，干货不少，值得好好读读。

呼吸道真菌胃肠道真菌 Kentaro Shimizu Kentaro Shimizu

抗生素

FM：比起特定菌株，粪菌移植更有效恢复肠道免疫细胞

这是Frontiers in Microbiology[IF：4.076]发表的关于用广谱抗生素处理小鼠后，利用特定菌株的潜在益生菌或者粪菌移植来恢复肠道免疫细胞的研究，尽管是动物实验，但有一定的启发意义，值得认真看看。

抗生素肠道免疫细胞粪菌移植大肠杆菌约氏乳杆菌

干酪乳杆菌BL23

FM：干酪乳杆菌胞外多糖蛋白复合物抑制斑马鱼感染

这是中国农科院饲料所和浙江大学动物科学学院团队合作的研究，说明干酪乳杆菌BL23的胞外成分能帮助斑马鱼抑制感染。值得关注斑马鱼作为可靠动物模型用于细菌感染、益生菌等研究的专业人士特别关注。

干酪乳杆菌BL23 胞外多糖蛋白复合物斑马鱼维氏气单胞菌 Ryuji Takeda

地震

FM：2015年尼泊尔地震后，饮用水中菌群受到短期影响

这是一项发表在Frontiers in Microbiology[IF：4.076]的奇特但很有意义的研究，在2015年大地震后的2个尼泊尔境内地区收集饮用水样本，分析饮用水中的菌群变化，一部分菌群会因为地震所造成的地球生物化学性质改变而变化，一部分会因为人类等粪便污染而变化。这有一定的启发意义，未来在自然灾害发生后，通过测序等新技术监控饮用水中的菌群变化，或许很有价值。

地震饮用水 Hiroki Kiyohara Tomohisa Sujino Takanori Kanai

噬菌体

FM：对裂解性噬菌体进行的全基因组测序

这是 Frontiers in Microbiology[IF：4.076]针对感染瘤胃中细菌的裂解性噬菌体的全基因组测序研究，值得专业人士特别关注。

噬菌体裂解性噬菌体全基因组测序 Shrey Kanvinde David Oupický

双歧杆菌

FM：双歧杆菌与免疫系统的互作（综述）

这是 Frontiers in Microbiology[IF：4.076]发表的一篇关于双歧杆菌与免疫系统的连接的综述，系统性总结了相关研究，值得好好看看。

双歧杆菌免疫系统 Achal Dhariwal Jianguo Xia

口腔白斑病

FM：口腔白斑病患者的口腔粘膜白斑菌群

这是Frontiers in Microbiology[IF：4.076]发表的恶性口腔白斑病患者的口腔粘膜菌群研究，值得专业人士关注。

口腔白斑病 Linda Partridge Linda Partridge P Eline Slagboom

鼻咽菌群

FM：鼻菌群 ≠ 鼻咽菌群

这是第一个大规模系统性分析健康人鼻（鼻腔）菌群和鼻咽菌群特征的研究，纳入了100名健康人的样本，结果值得关注，特别推荐。

鼻咽菌群鼻菌群

戊己丸

FM：戊己丸调节肠道菌群，改善大鼠的IBS症状

这是中国中医科学院团队针对戊己丸改善大鼠肠道菌群和肠易激综合征症状的研究，值得关注中医药与肠道菌群的人认真读一读。

戊己丸肠易激综合征

干酪乳杆菌Zhang

FM：与干酪乳杆菌Zhang的庆大霉素耐药性相关的碱性休克蛋白

这是内蒙古农业大学张和平团队发表的研究干酪乳杆菌Zhang对特定抗生素耐药性建立进程的研究，通过在庆大霉素环境下培养细菌，研究细菌蛋白表达水平的变化，确定出特定蛋白与耐药性建立的相关性。值得关注的研究，特别推荐。

干酪乳杆菌Zhang 庆大霉素碱性休克蛋白 Jillian R-M Brown Burkhardt Flemer

脆弱拟杆菌

FM：脆弱拟杆菌的CRISPR-Cas系统

这是Frontiers in Microbiology[IF：4.076]发表的关于肠道中重要的致病共生菌——脆弱拟杆菌的CRISPR-Cas系统类型的研究，推荐专业人士关注。

脆弱拟杆菌 CRISPR-Cas系统 Philip Hugenholtz Donovan H Parks

植物乳杆菌MYS6

FM：植物乳杆菌MYS6缓解肉鸡肝肾损伤

这是关于特定菌株植物乳杆菌缓解伏马菌素B1引起的肉鸡肝肾损伤的研究，值得关注。

植物乳杆菌MYS6 伏马菌素肉鸡

抗生素

FM：抗生素改变小鼠的糖代谢

这是Frontiers in Microbiology[IF：4.076]最新发表的关于抗生素如何改变菌群和葡萄糖代谢的研究，值得认真读一读，必有启发。

抗生素葡萄糖代谢 Gregory M Barton April E Price

萃取发酵

FM：如何清除乳酸菌发酵过程中产生的乳酸（综述）

这是一篇关注益生菌工业化生产的人必读的综述，系统性介绍了如何有效去除乳酸菌发酵过程中产生的乳酸以实现更好的生产管理的方法。特别推荐！

萃取发酵乳酸菌益生菌乳酸产物抑制

菊粉

FM：菊粉或可通过影响肠道菌群改善孕猪健康

这是四川农业大学团队发表在Frontiers in Microbiology[IF：4.076]上的研究，关注菊粉对孕猪体重和健康的影响，结果很正向，值得关注。

菊粉孕猪妊娠挥发性脂肪酸 Sallie W Chisholm

肠道菌群

菊粉或可通过影响肠道菌群提高孕猪健康

① 菊粉（1.5%）降低了孕猪体重以及高脂（+5%）带来的脂肪增加，促炎细胞因子il - 6在体内的循环浓度，瘦素以及趋化素也降低；② 菊粉大幅度降低新生猪的平均BMI：BMI（17-20kg/m2）的乳猪减少，BMI（14-17kg/m2）的增加；③ 菊粉带来的肠道菌群变化使母猪有更瘦、低炎症趋势；④ 妊娠也会极大的改变菌群组成；⑤ 同时，挥发性脂肪酸合成相关基因在妊娠期也剧烈变化，出现不同程度的增加；但是饮食对粪便挥发性脂肪酸的影响并不显著。

肠道菌群菊粉孕猪妊娠挥发性脂肪酸

金银花

FM：金银花+二甲双胍，改善大鼠菌群和代谢指标

这是韩国研究者在大鼠模型上做的金银花和二甲双胍联用，以改善大数菌群和代谢指标的研究，值得中医药相关人士关注。

金银花二甲双胍脂肪肝葡萄糖不耐受 Shihua Bao

高通量测序分析

FM：菌群数据分析的局限性及解决之道（综述）

这篇综述值得菌群研究领域的专业人士特别关注，系统性总结了现有数据分析方法，对其中的局限性做了深入阐述并提出解决之道。特别推荐！

高通量测序分析标签测序法测序分析菌群分析丰度分析

高通量测序分析

菌群测序数据该怎么合理分析？

① 微生物数据集是多样本组合数据，不能反映单种菌群的绝对含量；测序仪读取数据是基于菌群相关分子的统计值，片段测定再重组的测序方式不能反映真实的菌群组成；② 传统的距离和差异分析法没能考虑数据的集合性特点，并且关注的是菌群相对丰度的主要变化，而不是更重要的样本间的最大变化；组合数据的相关性分析在亚群和数据组装上存在欺骗性；相对丰度分析对极值敏感，可能带来特错数据；③ 可替代分析方法有元转录组分析法和标签测序法。

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