陈新光

癌症癌症流行病学癌症预防 Fang Yang Shi Huang

肠道菌群是ARGs的重要储存库。① 靶向饮食干预减少肠道耐药基因组，减轻肥胖儿童代谢综合征；② 399个ARGs赋予47种抗生素耐药性；③ 饮食干预降低肠道耐药基因组丰富度和多样性；④ 干预降低含多重耐药基因的大肠杆菌等菌株；⑥ 饮食干预可成为减少肠道耐药基因组的有效方法。

肠道菌群耐药基因组饮食干预抗生素抗性基因ARGs Kristen A Earle

系统性红斑狼疮

SR：红斑狼疮、肠道菌群、免疫细胞、抗体的关系

① SLE患者粪菌促进淋巴细胞活化及向Th17分化；② 两株梭状芽胞杆菌降低Th17/Th1平衡；③ 双歧杆菌防止CD4+细胞过度活化；④ 厚壁菌与IL-17负相关，SLE中与血清IFN-γ相关；⑤ 健康人互养菌与厚壁/拟杆菌比例正相关，与血清IL-6负相关并与IgM抗体正相关。

系统性红斑狼疮粪便菌群 IgM Th17 James D Lewis

艰难梭状芽孢杆菌

理智使用抗生素：对肠道菌群的影响

抗生素治疗对肠道微生物有长期影响。① 艰难梭状芽孢杆菌在抗生素相关性腹泻中扮演着重要角色；② 除此之外，持续感染这种微生物可能增加患炎性肠道疾病的风险；③ 本文总结了最近有关抗生素治疗如何改变肠道微生物的文献。

艰难梭状芽孢杆菌抗生素炎症性肠病微生物婴儿肠道微生物

糖尿病足病

世界卫生日：中国的糖尿病足有多严重，多可怕？

① 中国糖尿病人约9200万，病前期约1.45亿；② 慢性皮肤创伤中32.6%是糖尿病足溃疡；③ 截肢手术27.3%因糖尿病足（40%在5年内去世），不计交通意外等，占56.5%；④ 负担巨大，人均需2685美元；⑤ 北方比南方形势严峻；⑥ 少医院可治，但人才培养、指南等有进展。

糖尿病足病糖尿病

基因组

Cell子刊：研究疾病感染，牡蛎这个动物模型好用

① 长牡蛎可作为动物模型，用于研究疾病动态过程中环境、病原细菌及宿主的相互关系；② 首先要确定的是致病原因是单个细菌克隆还是一个种群，以利于评估疾病爆发的诱因并设计合适的监测工具；③ SPF牡蛎可用于研究自然条件下的感染过程；④ 微生物和宿主基因相互作用，对牡蛎健康与否非常重要。

基因组进化生态无特定抗原

寨卡病毒

想了解寨卡病毒？看NEJM这篇最新重磅综述就够了

① 寨卡病毒（Zika virus，ZIKV）是属于黄病毒科黄病毒属的虫媒病毒。该病毒在世界范围内广泛分布，且其感染会对人类健康造成威胁。② ZIKV 能通过虫媒传播，母婴传播和性传播等多种途径在人群中扩散，提示安全有效的ZIKV 疫苗是预防该病毒的必要手段。③ 其临床症状表现为发热、皮疹、头痛、关节疼痛、肌肉疼痛等。④ 该病毒传播途径多样，传播媒介分布广泛，在人类社会中潜伏的能力较强，且世界范围内仍未有对 ZIKV 特效的药物和疫苗上市。

寨卡病毒

唾液微生物

北大口腔团队：白斑病和口腔癌患者，唾液菌有何不同？

北大口腔医院出品，恭喜@陈峰老师！

唾液微生物口腔白斑口腔鳞状细胞癌

宏基因组

Methods：微生物相互作用，你能算出来么？

深挖文献，算出关系，发大paper！欢迎大家深挖MC，发点中文期刊综述还是很方便的。

宏基因组微生物相互作用文献挖掘

粪便微生物

PLoS One：大肠癌，与粪菌代谢组有何瓜葛？

粪菌代谢组，好文章还不多的感觉，期待大突破。

粪便微生物粪便代谢物结直肠癌

非酒精性脂肪肝

得了脂肪肝，改变菌群和生活方式有用么？

小秘书觉得，改善生活方式，改善饮食，对脂肪肝应该真有好处的。

非酒精性脂肪肝饮食与锻炼肠道菌群生活方式

炎症性肠病

Gut：IBD患者一定会得大肠癌么？

IBD和结直肠癌CRC的关系不是由于共同风险因子，而是通过慢性炎症等机制促进结肠黏膜恶变。①IBD患者被认为CRC高风险，因此接受抗炎治疗及检查②多项研究试图估计IBD患者CRC风险③这些研究很少是大型前瞻性并基于人群的研究，反映了方法论的挑战④本文用新标准来严格审查现有研究。

炎症性肠病结直肠癌

糖尿病足病

Lancet子刊：抗击糖尿病，需要靠谱的实际行动！

糖尿病是今年世界卫生日主题。根据WHO网站，主要目标是①增加糖尿病的负担和后果意识②实施有针对性的预防，诊断，管理措施③推出第一份糖尿病报告。④这些目标是值得称赞的，却不是新的，并缺乏触发迅速有意义行动的焦点⑤现在需要的是一套明确，有助于政府、资助者和临床医生抗击糖尿病的方案。

糖尿病足病

高凝血状态

Nature子刊：小肠癌症发生的新机制

凝血和中性粒细胞过度激活在多种人类癌症中发现。①血液高凝状态及中性粒细胞是否参与肿瘤发展仍未知②自发性肠肿瘤与低密度中性粒细胞和致瘤性N2表型及NET形成相关③脂多糖诱导中性粒细胞C3a受体增加，激活补体级联反应④在一群小肠癌患者中发现中性粒细胞增多和血液高凝状态的关系。

高凝血状态中性粒细胞小肠癌症

生态学

溪流生物膜的生态学与地球生物化学

河流相互交织形成巨大网络覆盖地球表面，它们的沉积物也为微生物提供了广阔的生长空间。①生物膜是微生物在河流中的主要生长模式，驱动生态系统进程并参与重要地球生物化学流动②水流，营养和有机物的运输是生物膜生长的主要限制③强调物理及生态方面生物膜的结构功能，气候环境变化对流生物膜的影响。

生态学地球生物化学流生物膜微生物 Craig L Phillips

粪便菌群移植

文献综述：粪便菌群移植

评价现有文献中粪便菌群移植FMT治疗难辨梭状芽孢杆菌感染CDI的有效性。①检索近五年内发表的有关FMT治疗CDI的文献②所选文献表明，FMT对CDI复发的治疗效果明显③在FMT成为最佳治疗方式之前需要更多大样本研究。

粪便菌群移植难辨梭状芽孢杆菌感染 Pedro A B Pereira Filip Scheperjans

唾液微生物

唾液微生物初步分析及其在口腔扁平藓中的潜在作用

从两类口腔扁平藓（OLP）病人及正常人中唾液样本测定16s rRNA序列研究微生物与OLP的关系。①唾液微生物的整体结构不会被OLP影响②某些特定菌群的丰度显著变化③研究微生物在OLP的同现模式④疾病严重程度及免疫失调与菌群相关⑤微生物在OLP起始及免疫调节是未来研究方向

唾液微生物口腔扁平藓免疫失调口腔微生物 Weijie Lv

代谢串扰

Nature综述：和病原体竞争，你有什么招数？

原核与真核生物使用的代谢物普遍相似或相同。①宿主与病原体的代谢交集与细菌蛋白和宿主受体相互作用同样重要②综述关注代谢水平的宿主病原体的相互作用③化学通路帮助病原体感知宿主体位及生理状态④细菌代谢通路会规避宿主免疫系统⑤一些主要代谢物是宿主与病原体竞争核心。

代谢串扰宿主病原体 Lenka A Vodstrcil Jimmy Twin

定性研究

粪菌移植恶心么？听听亲历过的患者怎么说

首个粪菌移植感受研究：① 访谈17患者，了解生/心理、生活质量、社会支持和费用等；② 移植前，供体意识有限甚至抗拒；③ 患者濒临绝望，则会积极尝试；④ 移植期，患者无心理障碍；⑤ 移植后，患者症状减轻但仍恐惧；⑥ 患者始终很积极寻求治疗；⑦ 对供体的教育和打破系统性限制很关键。

定性研究粪便细菌疗法

志贺菌

志贺菌进化的基因组标记，适应及地理传播

志贺菌是造成腹泻的主要病原菌。①与大肠杆菌、沙门氏菌等病原菌同属肠杆菌科②志贺菌属包括四个物种，它们具有很强的同源性，包括扩散性病原性③DNA测序表明这些相似性起源于不用祖先的趋同进化④综述志贺菌与大肠杆菌的进化关系并强调特殊毒性质粒的获得对高度特化病原菌形成的重要性。

志贺菌腹泻大肠杆菌 DNA测序 Stephen J Keely

肠道菌群

重磅综述：对抗病原菌，肠粘膜免疫力怎样给力？

① 宿主防御机制诱导和类型、应答程度和病程长短因致病菌的不同而不同；② 致病菌利用肠道菌群在肠道中定植，同时也被肠道菌群维持的肠道固有免疫微环境抑制；③ TLR激活能够抑制沙门氏菌感染但对于柠檬酸杆菌等非侵入性致病菌定植有利，而NOD样受体激活可控制后者；④ 受体的激活引起宿主促炎症因子表达，IL-17、IL-22在多种致病菌感染时高表达；⑤ 本文解析肠道菌群对致病菌免疫反应影响，详细介绍应对致病菌的先天免疫和适应性免疫机制。

肠道菌群病原菌免疫粘膜免疫

动脉粥样硬化

氧化三甲胺可通过MAPK和细胞核因子kapaB通路促进血管炎症

胆碱源代谢物氧化三甲胺TMAO会诱发患动脉粥样硬化及冠状动脉病。①给敲除LDLR的小鼠喂含胆碱的食物或向小鼠体内注入TMAO会增加炎症基因表达并激活MAPK。②人主动脉内皮细胞和血管平滑肌细胞内发现相同变化。③激活胞核因子B是这一过程的关键。④TMAO可以促进内皮细胞招募白细胞。

动脉粥样硬化心血管疾病内皮细胞炎症白细胞附着

耶尔森氏菌

Nature综述：可怕病原体，却是进化研究利器！

① 耶尔森氏菌被用于研究细菌进化为病原体的过程；② 大样本基因组研究再次让鼠疫/假结核/小肠结肠炎耶尔森菌成为研究模型；③ 基因获得、丢失和重排已在这些菌中发现；④ 这改变我们对病原体进化的理解；⑤ 肠杆菌科中也发现这些性状，这为肠道致病菌进化研究提供蓝图。

耶尔森氏菌进化

SR：吃点益生元，阻止孕产妇和后代肥胖风险？

① 母体肥胖，生育前后过度营养增加后代肥胖风险；② 给怀孕SD大鼠喂食低聚果糖，胰岛素抵抗得到改善，母鼠能量摄入减少，孕期体重降低，母鼠和后代肥胖被阻止；③ 血清代谢组分析连同激素和菌群分析都证明母鼠代谢特征影响后代肥胖风险；④ 这为改善人类孕产妇和后代代谢状态提供有利临床证据。

孕妇

SR：吃点益生元，阻止孕产妇和后代肥胖风险？

① 母体肥胖，生育前后过度营养增加后代肥胖风险；② 给怀孕SD大鼠喂食低聚果糖，胰岛素抵抗得到改善，母鼠能量摄入减少，孕期体重降低，母鼠和后代肥胖被阻止；③ 血清代谢组分析连同激素和菌群分析都证明母鼠代谢特征影响后代肥胖风险；④ 这为改善人类孕产妇和后代代谢状态提供有利临床证据。

孕妇益生元肥胖低聚果糖

真菌

Nature综述：免疫系统到底如何应对真菌感染？

① 病原真菌的监测和清除，依赖先天免疫系统中的吞噬细胞，特别是巨噬细胞和中性粒细胞；② 它们识别、吞噬和杀死真菌的效率取决于真菌的大小、形状、组成及免疫逃避机制成功与否；③ 本综述描述真菌，特别是白色念珠菌与吞噬细胞的相互作用，并讨论了多种利于真菌免疫逃避的因素。

真菌吞噬细胞免疫逃避

细菌

Cell：肠道细菌与人自身细胞数的比值，更接近1:1！

这是我们之前多次分享的文献，再次分享，帮助大家更新知识，不在演讲中露怯。

细菌人体细胞比例

肥胖

STM：人类对付肥胖的新疗法（综述）

本文综述肥胖治疗新进展：① 肥胖是代谢稳态的紊乱；② 肥胖与二型糖尿病最相关；③ 当前治疗方法主要为降低卡路里摄入及阻碍热量吸收；④ 手术缩小胃体积可减少能量摄入；⑤ 基础代谢和锻炼可增加热量消耗和散失；⑥ 褐色米色脂肪组织的增加可提高产热；⑦ 肠道细胞及菌群参与摄食行为，可作为潜在治疗靶点。

肥胖二型糖尿病褐色脂肪组织肠道菌群

全基因组测序

Nature综述：病原细菌在体内到底是怎么变异的？

① 细菌单基因组变异速率可能超过RNA病毒；② 全基因组测序可跟踪病原菌从定植到感染间进化的全过程；③ 特别适用于研究趋同进化模式：条件致病菌如何让宿主慢性感染，及产生耐药性的进化过程；④ 宿主内病原菌进化的研究，可预测细菌感染的临床进展，并选择最佳治疗方案。

全基因组测序基因组进化病原体

成纤维细胞

Nature肠胃学综述：过去一年，肝纤维化研究进展

肠肝轴，这个据说靠谱，研究也在如火如荼开展。

成纤维细胞巨噬细胞肝脏纤维化