徐笑

结肠粘液层中粘蛋白高度O-糖基化，在介导宿主-肠道菌群互作中发挥关键作用，但饮食变化如何影响结肠粘蛋白O-糖基化及其与菌群的互作尚未明确。Gut Microbes上发表的一项最新研究，发现膳食纤维可诱导小鼠的结肠粘蛋白O-糖基化发生变化，促进特定糖基化模式的形成以抑制粘液层降解。另外，膳食纤维摄入可改变小鼠的肠道菌群组成，且特定肠道细菌与结肠粘蛋白O-糖基化结构密切相关，提示膳食纤维可改变结肠粘蛋白与肠道菌群的互作。

膳食纤维 Gut microbiota mucin O-glycosylation glycan-microbiota interaction dietary intervention

多不饱和脂肪酸

从细胞水平解读膳食多不饱和脂肪酸的抗氧化性（综述）

膳食多不饱和脂肪酸（PUFA）是重要的营养物质和信号分子，其抗氧化性和潜在的抗炎、抗癌功能使其备受关注。近期发表在 Progress in Lipid Research上的综述从细胞分子学水平解读PUFA在维持氧化还原平衡中的作用，重点阐述了PUFA参与Nrf2通路激活的机制，指出PUFA很可能是生物调节氧化还原平衡的信号存储物质。该综述有助于系统性地认识膳食PUFA的生物学作用。

多不饱和脂肪酸氧化还原平衡综述基础研究 Nrf2通路

性别差异

肠道菌群的性别差异，受肥胖和更年期的影响

肠道菌群存在性别差异，可能受性腺类固醇的影响。Microbiome发表的一项研究表明，女性和男性的肠道菌群在组成和功能方面都存在显著差异，但这种性别差异受绝经状态和肥胖的影响。该研究还鉴定出可预测血液性腺类固醇（特别是睾酮）水平的菌群组成特征。

性别差异 sex gender Gonadal steroids testosterone

菌群-药物互作

赖信志等：从肠道菌群角度解析中药功效（综述）

近年研究表明，肠道菌群与中药活性成分的互作，在发挥中药疗效中有重要作用。Protein & Cell近期发表了来自台湾长庚大学赖信志团队的综述，从中药多糖、氨基酸代谢、脂质代谢以及小分子化合物等角度，总结了菌群与中药活性成分的相互作用，并提出了使用基于菌群的多组学平台研究中药衍生的活性代谢物的路线图，推荐专业人士参考。

菌群-药物互作传统中药 traditional Chinese medicine Herbs microbiota

宿主-菌群互作

Cell子刊：人体与菌群对微量营养素的协作和竞争（综述）

Molecular Cell近期发表的一篇小综述，重点介绍了人体与肠道共生菌和致病菌，在对锌、铁、B族维生素等微量营养素的利用方面存在的协作与竞争机制。

宿主-菌群互作微量营养素肠道菌群铁锌

食欲调节

Cell子刊：高脂饮食停不下来，跟这种新发现的神经元有关

下丘脑中的两种神经元（AgRP神经元和POMC神经元）参与对食欲的调控。Neuron发表的一项研究却发现了一种不同于这两种神经元的新的GABA能神经元——PNOC神经元。这种神经元可被高脂饮食激活，引起过度进食，或是防止食源性肥胖的新靶点。

食欲调节过度进食 PNOC神经元高脂饮食肥胖

椰子油

JAMA：椰子油保护心血管？临床试验见真章（新闻）

这是JAMA近期发表的一篇新闻，对Circulation年初发表的一项RCT系统综述及荟萃分析研究（https://www.mr-gut.cn/papers/read/1084532461）进行了报道，提醒人们目前的临床证据并不支持“椰子油有益心血管健康”的论调。

椰子油 Jake M Robinson Jake M Robinson

乳糜泻

JAMA：乳糜泻患者的早死风险

来自JAMA上发表的一项队列研究结果，对近5万名乳糜泻患者及近25万名对照进行超过10年的随访，发现乳糜泻患者的全因死亡率、心血管疾病死亡率、癌症死亡率及呼吸系统疾病死亡率均显著高于对照。

乳糜泻研究论文队列研究总体死亡率 Shawn A Steffan

纳米微粒

抗体偶联的纳米微粒或可治疗胃肠道致病菌感染

产志贺毒素的大肠杆菌（STEC）是一种重要的食源性致病菌，如何将其有效地选择性清除是一大挑战。ACS Applied Materials & Interfaces上发表的一项最新研究，通过将STEC的特异性抗体偶联于壳聚糖纳米微粒上，在体外及体内均可靶向性地杀伤对应血清型的STEC。

纳米微粒 chitosan nanoparticles antimicrobial antibody Shiga toxin-producing E. coli gastrointestinal pathogens 志贺毒素肠道致病菌感染纳米微粒

新冠病毒

国内团队：单细胞转录组分析揭示，消化系统是新冠病毒的潜在传播途径

细胞受体ACE2和跨膜丝氨酸蛋白酶2（TMPRSS2），在新冠病毒（SARS-CoV-2）进入细胞的过程中有关键作用。Gut近期发表了第二军医大学、清华大学和同济大学医学院等多个团队的合作研究，通过分析ACE2和TMPRSS2的单细胞共表达模式，鉴定出新冠病毒在肺和消化系统中潜在靶细胞类型，表明除了肺部，消化系统也是病毒感染的潜在靶点。

新冠病毒 COVID-19 SARS-CoV-2 单细胞转录组肺

微生物组

微生物组的转化之路（观点）

目前微生物领域的研究报道很多，但多终于模糊的关联性结果分析，无法进行下一步的实验验证和临床转化研究。本文提出，我们在进行关联性分析的时候需明确结果，鼓励写明具体菌株、菌种和代谢途径，而非像α多样性或基于多种菌群类别的相关多样性，因为后者无法进行下一步的验证实验（随机对照实验）。本文值得每一位想推动微生物组疗法的相关人士阅读。

微生物组转化应用 Microbiome Reproducibility translational science

昼夜节律

Cell子刊：生物钟与菌群-肠-脑轴的相互作用（观点）

爱尔兰科克大学John Cryan团队近期在Cell Metabolism发表长篇观点性综述，探讨了菌群-肠-脑轴与昼夜节律之间的双向互作，及其对宿主健康与疾病的潜在影响，并对未来的研究方向提出建议。

昼夜节律菌群-肠-脑轴 circadian rhythm Microbiota-gut-brain axis Microbiome

粪菌移植

Nature子刊：粪菌移植治疗肠易激综合症，真有“超级供体”吗？

这是一篇针对去年发表在Gut上关于使用FMT治疗IBS的较大规模研究（https://www.mr-gut.cn/papers/read/1052536024）的评论。该评论肯定了El-Salhy等实验的创新性，如使用胃镜减少FMT操作时长，但对“超级供体帮助实验成功”这一观点充满怀疑，认为该实验并无其他的供体对照，且实际上受体介绍FMT后的粪便菌群组成并无太大变化，而其在菌群分析时并未校准多重比较的结果，因此即使特定菌群丰度变化或特定菌群与FMT后症状改善相关，因此我们要对“超级供体”这一说法持谨慎态度。

粪菌移植肠易激综合症 Irritable bowel syndrome microbiota 新闻观点

瘤胃

瘤胃菌群中的群体感应蛋白

反刍家畜瘤胃适宜的环境(如恒定的温度、pH及充足的养分)为众多微生物的生长提供了良好条件，同时，这些瘤胃微生物在对营养物质进行降解时存在着复杂的共生、竞争关系。群体感应(Quorum sensing, QS)是大多数生物膜中细菌的交流方式，基于酰基高丝氨酸内酯(Acyl- homoserine lactone, AHL)的群体感应通常只存在于革兰氏阴性菌，而基于lux蛋白的自诱导物-2（AI-2）的群体感应常用于革兰氏阴性菌和革兰氏阳性菌间的交流。然而，对瘤胃中细菌细胞间的交流知之甚少。发表在Microbiome的研究对瘤胃菌群基因组进行了全面的群体感应（QS）蛋白鉴定，并结合瘤胃宏转录组分析，表明基于Lux蛋白系统的QS广泛存在于瘤胃菌群。该研究有助于更好地理解瘤胃中植物与微生物的相互作用。

瘤胃群体感应细菌酰基高丝氨酸内酯 LuxS

肠道菌群特征或可预测益生元干预的减肥效果

Gut上发表的这项来自比利时的研究，结合动物和人群实验发现，菊粉对于肥胖的改善效果与干预前的肠道菌群组成密切相关，主要体现在菌群中特定微生物类群的含量上。因此，在干预前对受试者的肠道菌群进行分析，或能筛选出潜在的应答者，有助于实现个性化减肥。

益生元

肠道菌群特征或可预测益生元干预的减肥效果

Gut上发表的这项来自比利时的研究，结合动物和人群实验发现，菊粉对于肥胖的改善效果与干预前的肠道菌群组成密切相关，主要体现在菌群中特定微生物类群的含量上。因此，在干预前对受试者的肠道菌群进行分析，或能筛选出潜在的应答者，有助于实现个性化减肥。

益生元菊粉肥胖肠道菌群代谢

口腔细菌

两种口腔共生菌之间的相互作用

《ISME Journal》发表的一项研究，报道了口腔中常见的两种共生菌棒状杆菌和链球菌的协同作用，并探究了其中的分子机制。

口腔细菌协同作用 Ashley van der Spek Isobel D Stewart Brigitte Kühnel

类黑精

肠道菌群介导类黑精抗氧化活性

多酚-菌群互作研究。文章采用体外发酵模型，探究了来源于常见10种食物中的类黑精对肠道菌群的影响，以及经发酵后类黑精抗氧化能力的变化。结果显示，不同食物来源的类黑精对菌群的影响不同；菌群对于某些类黑精物质的转化和利用可能降低其抗氧化能力。

类黑精体外发酵 melanoidins Gut microbiota Short chain fatty acids

饮食方式

间歇性周期饮食或调控菌群和空间认知记忆

过度食用高饱和脂肪和高糖的食物会损害人类和啮齿动物的短期空间识别记忆，而且研究显示这种行为表型与饮食引起的肥胖改变、炎症和血脑屏障相关标记物的海马基因表达以及肠道菌群组分之间具有关联。Translational Psychiatry近期发表的文章，显示间歇性周期饮食有助于提高认知能力，改变菌群组分，并揭示出细菌Coprobacter_OTU66和体长可用于预测小鼠在空间认知任务中的表现。

饮食方式空间认知肠道菌群 Enrique Almanza-Aguilera Ainara Cano

海拔

高海拔环境限制影响强棱蜥肠道微生物组

海拔强棱蜥菌群 Altitudinal gradient Ectothermic vertebrate fecal microbiota

肠道菌群与疾病

Cell：肠道菌群与人类疾病间的因果关系被夸大（观点）

人源菌群鼠模型（HMA）是体内植入人体肠道/粪便菌群的无菌鼠类模型，为目前研究肠道菌群和疾病之间因果关系的主流手段。现有大量使用HMA证明多种诸如炎症、过敏、肿瘤等与肠道菌群成因果关系，但已知在人体中能确定具有因果关系的只有两种：幽门螺旋杆菌导致人患胃癌和艰难梭菌感染导致人腹泻。作者认为啮齿动物无法还原人体，自身生理结构、处所和饮食等都会造成不同结果，因此对该领域的研究结论需谨慎说明。在这里补充原文作者提出的相关建议：1）探索HMA中与疾病相关的菌群变化；2）使用考虑了生物差异性的供体样本量量；3）要将供体的重复组数量考虑进实验设计中；4）不混合供体样本以确保个体间差异；5）确保菌群移植成功，如特定的“失衡”菌群特征是否在受体内出现；6）诚实探讨动物实验不足；7）相关性分析HMA多组学数据和可能的菌群特征后进行功能性实验；

肠道菌群与疾病 causality Chronic disease Dysbiosis Fecal transplant

膳食补充剂

Nature子刊：孕期服用膳食补充剂，对婴儿呼吸道菌群有什么影响？

研究表明，孕妇补充鱼油和维生素D可以减少后代哮喘和喘息的发病率，这可能是通过改变孕妇或婴儿的微生物组成实现的。Nature communication最近的研究，给736名孕妇补充n-3长链多不饱和脂肪酸和/或维生素D，或安慰剂，并对695对母婴的菌群（母亲妊娠期阴道菌群、婴儿粪便和呼吸道菌群）进行了分析。结果表明，膳食补充剂能影响婴儿呼吸道菌群组成和呼吸道免疫（如影响鼻内CCL4、TNF-α和CXCL8等细胞因子和趋化因子浓度）。这些膳食补充剂也影响婴儿气道菌群的成熟和特定细菌属的相对丰度。本研究结果提示，孕期膳食补充剂或可调节婴儿呼吸道菌群。

膳食补充剂维生素D N-3长链多不饱和脂肪酸婴儿呼吸道菌群 Marialaura Bonaccio

囊性纤维化

Nature子刊：囊性纤维化患儿生长迟缓或与肠道菌群失调有关

囊性纤维化婴儿肠道菌群早期线性生长拟杆菌门变形菌门

肺部菌群

肺部菌群对肺癌发生、免疫应答及免疫治疗的影响（观点）

微生物是癌症发生和针对癌细胞的免疫反应的关键调节因子，因此，可能会影响免疫治疗的效果。Trends in Cancer最近的观点文章, 综述了健康个体和肺癌患者肺部菌群结构、肺部菌群对肺部炎症和肺癌发生的影响，及肺部菌群与免疫监视和免疫治疗的关系等。并进一步提出，识别肺部菌群可能是理解肺癌发生过程和预测不同治疗效果的关键，了解肺部菌群对宿主免疫的影响，可以发现新的治疗靶点，或有助于设计新的治疗肺癌的免疫疗法。

肺部菌群肺癌肺部免疫反应免疫治疗呼吸道菌群

粪菌移植

评估供体粪便微生物组，提高FMT安全性（观点）

粪菌移植对越来越多的疾病显示临床疗效。但是最近的报道中，耐药性病原菌通过粪菌移植传递给粪菌受者，引起败血症的案例，强调了重新评估供体筛选方法和提高FMT安全性的必要。Trends in Microbiology最近发表的观点文章指出，肠道菌对感染风险有深远影响，但在供体粪便中不进行常规评估。对供体粪便的评估除筛查病原体外，还应考虑菌群组成和结构，以减少FMT受者的感染并发症，提高FMT安全性。

粪菌移植 Faecal microbiota transplantation Microbiome SEPSIS infection

低聚半乳糖

低聚半乳糖调节肉鸡肠道菌群和先天免疫，提高肉鸡品质

肉鸡养殖中，通过饮食控制调节鸡的肠道菌群，能提高肉鸡的生长速度和体重，并能减少抗生素生长促进剂使用。益生元低聚半乳糖(galacto-oligosaccharides，GOS)是奶酪生产的副产品，添加到鸡饲料鸡中，能改善肉鸡的生长速度和体重。mSystems近期的研究，通过比较普通饲料喂养和添加了GOS饲料喂养的鸡(孵化日到35天龄)的各项指标，来评估GOS饮食对肉鸡的影响。发现GOS饲料有助于幼鸡盲肠富集约氏乳杆菌，进而促进肠道的固有免疫。同时，幼鸡盲肠中约氏乳杆菌丰度，与自身体重增加呈正相关。本研究或确定了GOS添加饲料、肠道约氏乳杆菌和肠道固有免疫影响肉鸡生长的相互关系。

低聚半乳糖 galacto-oligosaccharides，GOS 研究论文其它动物肉鸡

益生元

低聚半乳糖调节肉鸡肠道菌群和先天免疫，提高肉鸡品质

肉鸡养殖中，通过饮食控制调节鸡的肠道菌群，能提高肉鸡的生长速度和体重，并能减少抗生素生长促进剂使用。益生元低聚半乳糖(galacto-oligosaccharides，GOS)是奶酪生产的副产品，添加到鸡饲料鸡中，能改善肉鸡的生长速度和体重。mSystems近期的研究，通过比较普通饲料喂养和添加了GOS饲料喂养的鸡(孵化日到35天龄)的各项指标，来评估GOS饮食对肉鸡的影响。发现GOS饲料有助于幼鸡盲肠富集约氏乳杆菌，进而促进肠道的固有免疫。同时，幼鸡盲肠中约氏乳杆菌丰度，与自身体重增加呈正相关。本研究或确定了GOS添加饲料、肠道约氏乳杆菌和肠道固有免疫影响肉鸡生长的相互关系。

益生元低聚半乳糖鸡肠道微生物组肠道健康合生元

生殖系统菌群

生殖系统菌群或影响性生活的方方面面（综述）

本综述阐述了男女生殖系统菌群在人类性生活中可能扮演的作用，在总结现有证据的基础上，为进一步开展生殖系统菌群研究指明方向。

生殖系统菌群 bacteria cryptic female choice reproductive immunity sperm competition

菌群-药用植物互作

紫锥菊可作为药用植物-微生物互作研究模型（观点）

药用植物与植物内生菌之间的互作对植物自身产生具有治疗作用的生物活性化合物的重要性逐渐受到关注。Trends in Plant Science最近发表的观点文章，就紫锥菊作为研究药用植物与植物内生菌之间互作的新模型进行了讨论，旨在发现新的生物活性化合物。

菌群-药用植物互作紫锥菌药用植物生物活性化合物 medicinal plants

噬菌体

饮食中的原噬菌体诱导剂是如何影响肠道菌群的？

在人体肠道内，每一个细菌细胞约含有1个病毒样颗粒(VLP)。这些VLPs大部分是dsDNA噬菌体。人类肠道中的大多数噬菌体属于温和噬菌体，并作为原噬菌体整合到细菌宿主的基因组中。研究表明，许多常见的食物和/或环境化合物可通过激活原噬菌体改变肠道菌群组成。Gut Microbes发表的文章，研究了三种常见肠道细菌和一种条件致病菌对117种常用食品、化学添加剂和植物提取物的反应。结果显示，包括甜菊糖和蜜蜂蜂胶提取物在内的11中化合物，显示出物种特异性生长抑制的原噬菌体诱导作用。以上结果表明，不同的食物可以通过调节温和噬菌体来改变肠道细菌的丰度，本结果或可为调节人类肠道微生物组提供了一条新的途径。

噬菌体饮食-菌群互作 Bacteriophage gut microbiome Diet