2018-10-12
靶向菌群的气雾剂,或能防治肺部肿瘤
lung microbiota
Cell子刊:抗生素和益生菌有望用于防治肺转移肿瘤
① 肺菌群可促进肺部形成免疫耐受微环境;② 万古霉素/新霉素雾化治疗,减少小鼠肺部细菌数量,减少调节性T细胞、增强T效应细胞和NK细胞活性,抑制黑色素瘤的肺转移,移植经抗生素治疗的肺部分离菌也有此效;③ 鼠李糖乳杆菌雾化治疗,促进小鼠肺部抗原提呈细胞成熟、减少耐受性微环境,从而增强肺部效应细胞的抗肿瘤免疫;④ 二者都可增强化疗药物达卡巴嗪的疗效;⑤ 益生菌或抗生素的雾化吸入治疗用于防治肺转移肿瘤,有临床运用前景。
lung microbiota
cancer immunosurveillance
aerosolization
antibiotics
probiotics
微生物生态学
Science子刊:分析化学梯度对CF患者肺部菌群的影响,有望带来新疗法
① 用WinCF微生物发酵系统分析18例囊性纤维化(CF)患者的痰液样本;② pH和氧气梯度可将患者菌群成员划分为两个互斥的类群:偏好富氧和高pH环境的非发酵性的致病菌,以及存在于低氧和低pH环境中的发酵性厌氧菌;③ 抗生素杀死特定致病菌,可引起菌群的复杂应答,包括改变抗生素化学结构从而产生抗性,以及菌群整体结构的变化导致其它致病菌占据死掉细菌的生态位;④ 建立数学模型,可用于预测干预疗法对CF患者菌群的影响。
微生物生态学
囊性纤维化
肺部菌群
化学梯度
微生物发酵系统
gut microbiome
Cell子刊:肠道菌群与溃疡性结肠炎的程度和疗效相关
① 纳入405例新发病、未经治疗的小儿溃疡性结肠炎(UC)患者,分析基线和接受治疗1年中的粪便菌群与病程的关联;② 基线的菌群特征与疾病严重程度和进展均相关,患者血清中的抗微生物抗体水平,与菌群特征和疾病严重性相关;③ 在严重患者中,以梭菌目(如瘤胃菌科和毛螺菌科)为代表的43个OTU显著减少,而7个增多的OTU均为口腔细菌;④ 治疗过程中菌群的纵向变化与疗效有关,肠道中口腔细菌(特别是副流感嗜血杆菌)的减少伴随着疾病的缓解。
gut microbiome
pediatric ulcerative colitis
treatment-naive
disease course
response to therapy
动脉粥样硬化
促炎肠道菌群可加速动脉粥样硬化
① 抗生素处理的Ldlr-/-小鼠(高血脂和动脉粥样硬化动物模型),经同笼饲养获得Casp-/-小鼠的促炎肠道菌群(LC)或同种小鼠的肠道菌群(LL);② 高脂高胆固醇饮食下,LC小鼠动脉粥样硬化斑块显著大于LL小鼠;③ 血液白细胞、斑块内的中性粒细胞、血液促炎细胞因子增多;④ 粪便中短链脂肪酸(SCFA)产生菌减少,盲肠SCFA浓度降低,但不影响血液氧化三甲胺水平和肠道屏障功能;⑤ 促炎菌群可增加Ldlr-/-小鼠的系统性炎症,加速动脉粥样硬化形成。
动脉粥样硬化
动脉粥样硬化
肠道菌群
系统性炎症
氧化三甲胺
肠道免疫
Nature子刊:NIK信号轴在肠道免疫及稳态中的重要作用
① 非经典NF-κB诱导激酶(NIK)是粘膜树突细胞(DC)功能的关键调节因子;② DC特异性NIK缺失损害肠道IgA的分泌和菌群稳态,导致小鼠对肠道病原体柠檬酸杆菌敏感;③ 肠上皮细胞中IgA转运蛋白pIgR的表达需要DC特异性NIK,并依赖于Th17细胞和天然淋巴细胞(ILC)产生的IL-17;④ NIK激活的非经典NF-κB诱导DC中IL-23的表达,有助于维持Th17细胞和ILC3;⑤ 另一方面,NIK的缺失可缓解诱导的小鼠结肠炎。
肠道免疫
肠道免疫
树突细胞
非经典NF-κB诱导激酶(NIK)
IL-23
Fecal microbiota transplantations
苏大一院:粪菌移植治疗胃肠道急性移植物抗宿主病
① 类固醇难治性胃肠道(GI)移植物抗宿主病(GvHD)患者预后较差,治疗方案有限;② 纳入8名类固醇难治性GI-GvHD患者,评估粪菌移植(FMT)的有效性和安全性;③ 接受FMT后,所有患者的临床症状均得到改善,肠道菌群的多样性及组成恢复正常,厚壁菌门/拟杆菌门比值恢复正常,未见明显不良反应;④ 与未接受FMT的患者相比,这8位病人的无进展生存期更长,总生存期无显著差异;⑤ FMT可作为GI-GvHD的备用治疗方案,其有效性和安全性需进一步评估。
Fecal microbiota transplantations
refractory gastrointestinal
Graft-versus-host disease (GVHD)
diarrhea
a pilot study
环境-宿主-微生物
中科院邓晔:野生动物保护需考虑环境对肠道菌群的影响
① 鸿雁从人类活动程度较低的繁殖区迁徙到人群活动较频繁的越冬区,粪便细菌和真菌菌群发生变化;② 两地鸿雁粪便菌群的总体组成、α多样性、功能预测谱和核心菌群有一定相似性,但β多样性、物种丰度和互作网络结构有显著差异;③ 越冬区粪便菌群中,外源化合物降解以及疾病相关通路上调,致病菌丰度增加;④ 鸿雁肠道菌群在长途迁徙后有所改变,但核心菌群保持稳定;⑤ 栖息地环境压力,如环境污染,可能通过改变肠道菌群间接威胁野生动物。
环境-宿主-微生物
肠道菌群结构
鸿雁
环境压力
Bioremediation
新方法为微生物修复带来新的希望
① 微生物修复是一种稳定、环境友好的污染治理方法,但其具有适应性差、耗时、竞争力弱和生物利用度低的弱点;② 系统生物学可利用多组学手段,从分子到生态系统不同维度,整合明晰微生物修复过程中的代谢通路与作用机理;③ 代谢工程学在明晰机理的基础上,通过基因克隆、编辑等手段增强或重构代谢通路,从而最终克服微生物修复的弱点;④ 不过,在环境中应用基因改造微生物时要注意可能的生态安全问题(如基因污染)。
Bioremediation
CRISPR-Cas
gene editing
metabolic engineering
Systems biology
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